Efficacité clinique réelle de l'analyse du génome entier et du transcriptome pour guider les soins avancés contre le cancer

La WGTA offre la possibilité d'améliorer les résultats de santé des patients en adaptant les traitements au profil génomique de chaque individu. Le programme BC POG est une étude de recherche à un seul bras intégrant les informations WGTA dans la prise de décision clinique pour les patients atteints de cancers incurables à un stade avancé. L'efficacité clinique de l'approche de POG est inconnue. Cette étude observationnelle quasi-expérimentale rétrospective estimera l'efficacité réelle de la WGTA pour guider les soins avancés contre le cancer. Pour identifier un contrefactuel pour l'approche à un seul bras de POG, des méthodes d'appariement combinées à des données administratives sur les soins de santé seront utilisées. Les impacts sur la survie de l'approche de POG par rapport aux soins habituels chez des témoins appariés seront ensuite estimés.

Objectifs spécifiques et hypothèses

Cette étude vise à estimer les effets sur la survie globale de l'approche de POG par rapport aux soins habituels pour les patients atteints de cancers avancés.

Hypothèse (nulle) : il n'y a pas de différence de survie entre les patients POG et les patients en soins habituels

Hypothèse (alternative) : les patients POG qui ont commencé la WGTA vivent plus longtemps, en moyenne, que les patients recevant des soins habituels

Étudier le design

Cette étude appliquera une conception de cohorte rétrospective. Les cohortes comprendront des patients qui ont consenti au POG et ont subi une biopsie pour WGTA entre juillet 2014 et décembre 2017 et correspondaient aux contrôles de soins habituels. Les patients POG qui se sont inscrits avant juillet 2014 seront exclus de notre étude car pendant cette période de faisabilité, les cliniciens référents ont utilisé un niveau élevé de sélection de recrutement au cas par cas. Les patients en soins habituels seront appariés aux patients POG à l'aide de techniques d'apprentissage supervisé. La période d'étude s'étendra du moment où le patient reçoit un diagnostic de cancer métastatique jusqu'au 31 décembre 2018.

Les sources de données

Des ensembles de données administratives anonymisées liées à la population seront obtenues auprès de BC Cancer pour tous les patients adultes (> 18 ans) diagnostiqués avec un cancer en Colombie-Britannique avant décembre 2017. Les patients POG seront identifiés à partir de la base de données du module POG du BC Cancer Outcomes and Surveillance Integration System (OaSIS). Les patients témoins admissibles seront identifiés à partir du registre du cancer de la Colombie-Britannique, un registre provincial du cancer basé sur la population. Ces données seront liées aux données de la BC Cancer Pharmacy Database, de la Radiotherapy Database et du Cancer Agency Information System (CAIS) à l'aide d'identificateurs propres à l'agence.

Approche statistique

Les chercheurs associeront les patients POG et les patients en soins habituels en fonction de leur date de diagnostic de la maladie métastatique. Ils appliqueront une correspondance basée sur un algorithme génétique 1: 1 (1: 2 dans l'analyse de sensibilité) et associeront les patients sur les scores de propension et les covariables de base, y compris les données démographiques des patients, les caractéristiques cliniques, les antécédents de traitement et l'utilisation des soins de santé avant le diagnostic de la maladie métastatique. Au besoin, les analyses d'appariement seront stratifiées pour tenir compte de la variation entre les types de cancer.

Pour estimer la survie globale des patients POG et des témoins appariés, des analyses de survie non paramétriques et paramétriques seront utilisées. Ces analyses seront ajustées pour la censure. Les chercheurs exploreront l'hétérogénéité de l'efficacité clinique entre les sous-types de cancer grâce à une analyse de sous-groupes et utiliseront une analyse de scénarios pour déterminer l'impact des changements futurs dans l'application de la WGTA sur l'efficacité clinique.