Verklig klinisk effektivitet av hela genomet och transkriptomanalys för att vägleda avancerad cancervård

WGTA ger en möjlighet att förbättra hälsoresultaten för patienter genom att skräddarsy behandlingar till varje individs genomiska profil. BC POG-programmet är en enarmsforskningsstudie som integrerar WGTA-information i kliniskt beslutsfattande för patienter med obotlig cancer i framskridet stadium. Den kliniska effektiviteten av POG:s tillvägagångssätt är okänd. Denna retrospektiva kvasi-experimentella observationsstudie kommer att uppskatta den verkliga effektiviteten av WGTA för att vägleda avancerad cancervård. För att identifiera en kontrafaktisk för POG:s enarmsmetod kommer matchningsmetoder i kombination med administrativ sjukvårdsdata att användas. Överlevnadseffekterna av POG:s tillvägagångssätt jämfört med vanlig vård i matchade kontroller kommer sedan att uppskattas.

Specifika mål och hypoteser

Denna studie syftar till att uppskatta de övergripande överlevnadseffekterna av POG:s tillvägagångssätt kontra vanlig vård för patienter med avancerad cancer.

Hypotes (noll): det finns ingen skillnad i överlevnad mellan POG-patienter och vanlig vård

Hypotes (alternativ): POG-patienter som påbörjade WGTA lever längre i genomsnitt än vanliga vårdpatienter

Studera design

Denna studie kommer att tillämpa en retrospektiv kohortdesign. Kohorter kommer att inkludera patienter som samtyckte till POG och genomgick en biopsi för WGTA mellan juli 2014 och december 2017 och matchade vanliga vårdkontroller. POG-patienter som registrerade sig före juli 2014 kommer att uteslutas från vår studie eftersom remitterande läkare under denna genomförbarhetsperiod använde en hög nivå av rekrytering från fall till fall. Vanlig vårdpatienter kommer att matchas till POG-patienter med hjälp av övervakade inlärningstekniker. Studieperioden kommer att sträcka sig från patientens tidpunkt för metastaserande cancerdiagnos till den 31 december 2018.

Datakällor

Avidentifierade länkade populationsbaserade administrativa datauppsättningar kommer att erhållas från BC Cancer för alla vuxna patienter (>18 år) diagnostiserade med cancer i BC före december 2017. POG-patienter kommer att identifieras från BC Cancer Outcomes and Surveillance Integration System (OaSIS) POG Module Database. Kvalificerade kontrollpatienter kommer att identifieras från BC Cancer Registry, ett befolkningsbaserat provinsiellt cancerregister. Dessa data kommer att kopplas till data från BC Cancer Pharmacy Database, Radiotherapy Database och Cancer Agency Information System (CAIS) med hjälp av byråspecifika identifierare.

Statistiskt tillvägagångssätt

Utredarna kommer att matcha POG-patienter och vanliga vårdpatienter baserat på deras datum för metastaserande sjukdomsdiagnos. De kommer att tillämpa 1:1 genetisk algoritmbaserad matchning (1:2 i känslighetsanalys) och matcha patienter på benägenhetspoäng och baslinjekovariater, inklusive patientdemografi, kliniska egenskaper, behandlingshistorik och sjukvårdsanvändning före metastaserande sjukdomsdiagnos. Vid behov kommer matchande analyser att stratifieras för att ta hänsyn till variation mellan cancertyper.

För att uppskatta total överlevnad hos POG-patienter och matchade kontroller kommer icke-parametriska och parametriska överlevnadsanalyser att användas. Dessa analyser kommer att justeras för censur. Utredarna kommer att undersöka heterogenitet i klinisk effektivitet över cancersubtyper genom subgruppsanalys och använda scenarioanalys för att bestämma inverkan av framtida förändringar i tillämpningen av WGTA på klinisk effektivitet.