Efficacia clinica nel mondo reale dell'analisi del genoma intero e del trascrittoma per guidare la cura avanzata del cancro

WGTA offre l'opportunità di migliorare i risultati sanitari per i pazienti adattando i trattamenti al profilo genomico di ciascun individuo. Il programma BC POG è uno studio di ricerca a braccio singolo che integra le informazioni del WGTA nel processo decisionale clinico per i pazienti con tumori incurabili in stadio avanzato. L'efficacia clinica dell'approccio del POG è sconosciuta. Questo studio osservazionale retrospettivo quasi sperimentale valuterà l'efficacia nel mondo reale del WGTA per guidare la cura avanzata del cancro. Per identificare un controfattuale per l'approccio a braccio singolo del POG, verranno utilizzati metodi di corrispondenza combinati con dati sanitari amministrativi. Verranno quindi stimati gli impatti sulla sopravvivenza dell'approccio del POG rispetto alle cure abituali nei controlli abbinati.

Obiettivi specifici e ipotesi

Questo studio mira a stimare gli effetti sulla sopravvivenza globale dell'approccio del POG rispetto alle cure abituali per i pazienti con tumori avanzati.

Ipotesi (nulla): non vi è alcuna differenza nella sopravvivenza tra POG e pazienti in cure abituali

Ipotesi (alternativa): i pazienti POG che hanno iniziato il WGTA vivono più a lungo, in media, rispetto ai normali pazienti in cura

Progettazione dello studio

Questo studio applicherà un disegno di coorte retrospettivo. Le coorti includeranno pazienti che hanno acconsentito al POG e sono stati sottoposti a biopsia per WGTA tra luglio 2014 e dicembre 2017 e abbinati ai normali controlli di cura. I pazienti POG che si sono arruolati prima di luglio 2014 saranno esclusi dal nostro studio perché durante questo periodo di fattibilità, i medici di riferimento hanno impiegato un alto livello di selezione del reclutamento caso per caso. I pazienti con cure abituali saranno abbinati ai pazienti POG utilizzando tecniche di apprendimento supervisionato. Il periodo di studio andrà dal momento della diagnosi del cancro metastatico del paziente al 31 dicembre 2018.

Origine dei dati

I set di dati amministrativi anonimizzati basati sulla popolazione saranno ottenuti da BC Cancer per tutti i pazienti adulti (> 18 anni) con diagnosi di cancro in BC prima di dicembre 2017. I pazienti POG saranno identificati dal database del modulo POG BC Cancer Outcomes and Surveillance Integration System (OaSIS). I pazienti di controllo idonei saranno identificati dal BC Cancer Registry, un registro provinciale dei tumori basato sulla popolazione. Questi dati saranno collegati con i dati del database BC Cancer Pharmacy, del database di radioterapia e del sistema informativo dell'agenzia per il cancro (CAIS) utilizzando identificatori specifici dell'agenzia.

Approccio statistico

Gli investigatori abbineranno i pazienti POG e i pazienti con cure abituali in base alla loro data di diagnosi della malattia metastatica. Applicheranno la corrispondenza basata su algoritmi genetici 1:1 (1:2 nell'analisi della sensibilità) e abbineranno i pazienti in base a punteggi di propensione e covariate di base, inclusi i dati demografici dei pazienti, le caratteristiche cliniche, le storie di trattamento e l'utilizzo dell'assistenza sanitaria prima della diagnosi della malattia metastatica. Quando necessario, le analisi di corrispondenza saranno stratificate per tenere conto della variazione tra i tipi di cancro.

Per stimare la sopravvivenza globale nei pazienti POG e nei controlli appaiati, verranno utilizzate analisi di sopravvivenza non parametriche e parametriche. Queste analisi saranno adattate per la censura. I ricercatori esploreranno l'eterogeneità nell'efficacia clinica tra i sottotipi di cancro attraverso l'analisi dei sottogruppi e utilizzeranno l'analisi dello scenario per determinare l'impatto dei futuri cambiamenti nell'applicazione del WGTA sull'efficacia clinica.