Eficacia clínica en el mundo real del análisis del transcriptoma y el genoma completo para guiar la atención avanzada del cáncer

WGTA brinda la oportunidad de mejorar los resultados de salud de los pacientes al adaptar los tratamientos al perfil genómico de cada individuo. El programa BC POG es un estudio de investigación de un solo brazo que integra la información de WGTA en la toma de decisiones clínicas para pacientes con cánceres incurables en etapa avanzada. Se desconoce la efectividad clínica del enfoque de POG. Este estudio observacional cuasi-experimental retrospectivo estimará la efectividad real de WGTA para guiar la atención del cáncer avanzado. Para identificar un contrafactual para el enfoque de un solo brazo de POG, se utilizarán métodos de comparación combinados con datos administrativos de atención médica. Luego se estimarán los impactos de supervivencia del enfoque de POG en comparación con la atención habitual en controles emparejados.

Objetivos Específicos e Hipótesis

Este estudio tiene como objetivo estimar los efectos de supervivencia general del enfoque de POG versus la atención habitual para pacientes con cánceres avanzados.

Hipótesis (nula): no hay diferencia en la supervivencia entre los pacientes de POG y de atención habitual

Hipótesis (alternativa): Los pacientes POG que iniciaron WGTA viven más tiempo, en promedio, que los pacientes de atención habitual

Diseño del estudio

Este estudio aplicará un diseño de cohorte retrospectivo. Las cohortes incluirán pacientes que dieron su consentimiento para POG y se sometieron a una biopsia para WGTA entre julio de 2014 y diciembre de 2017 y controles de atención habituales coincidentes. Los pacientes de POG que se inscribieron antes de julio de 2014 serán excluidos de nuestro estudio porque durante este período de viabilidad, los médicos remitentes emplearon un alto nivel de selección de reclutamiento caso por caso. Los pacientes de atención habitual se emparejarán con pacientes POG utilizando técnicas de aprendizaje supervisado. El período de estudio abarcará desde el momento del diagnóstico de cáncer metastásico del paciente hasta el 31 de diciembre de 2018.

Fuentes de datos

Se obtendrán conjuntos de datos administrativos basados ​​en la población vinculados no identificados de BC Cancer para todos los pacientes adultos (>18 años) diagnosticados con cánceres en BC antes de diciembre de 2017. Los pacientes POG se identificarán a partir de la base de datos del módulo POG del Sistema de Integración de Vigilancia y Resultados del Cáncer de BC (OaSIS). Los pacientes de control elegibles se identificarán a partir del Registro de cáncer de BC, un registro provincial de cáncer basado en la población. Estos datos se vincularán con los datos de la base de datos de farmacias de cáncer de BC, la base de datos de radioterapia y el sistema de información de la agencia de cáncer (CAIS) utilizando identificadores específicos de la agencia.

Enfoque Estadístico

Los investigadores compararán a los pacientes de POG con los pacientes de atención habitual en función de la fecha de diagnóstico de la enfermedad metastásica. Aplicarán coincidencias basadas en algoritmos genéticos 1:1 (1:2 en análisis de sensibilidad) y emparejarán pacientes en puntajes de propensión y covariables de referencia, incluidos datos demográficos de pacientes, características clínicas, antecedentes de tratamiento y utilización de atención médica antes del diagnóstico de enfermedad metastásica. Cuando sea necesario, los análisis de emparejamiento se estratificarán para tener en cuenta la variación entre los tipos de cáncer.

Para estimar la supervivencia general en pacientes con POG y controles emparejados, se utilizarán análisis de supervivencia paramétricos y no paramétricos. Estos análisis serán ajustados por censura. Los investigadores explorarán la heterogeneidad en la eficacia clínica entre los subtipos de cáncer a través del análisis de subgrupos y utilizarán el análisis de escenarios para determinar el impacto de los cambios futuros en la aplicación de WGTA en la eficacia clínica.