Klinisk effektivitet af hele genomet og transkriptomanalyse i den virkelige verden for at vejlede avanceret kræftbehandling

WGTA giver mulighed for at forbedre sundhedsresultater for patienter ved at skræddersy behandlinger til hver enkelts genomiske profil. BC POG-programmet er et enkeltarmsforskningsstudie, der integrerer WGTA-information i klinisk beslutningstagning for patienter med fremskredne, uhelbredelige kræftformer. Den kliniske effektivitet af POG's tilgang er ukendt. Denne retrospektive kvasi-eksperimentelle observationsundersøgelse vil estimere den virkelige effektivitet af WGTA til at vejlede avanceret kræftbehandling. For at identificere en kontrafaktisk for POG's single-arm tilgang, vil matchningsmetoder kombineret med administrative sundhedsdata blive brugt. Overlevelseseffekterne af POG's tilgang sammenlignet med sædvanlig pleje i matchede kontroller vil derefter blive estimeret.

Specifikke mål og hypoteser

Denne undersøgelse har til formål at estimere de overordnede overlevelseseffekter af POG's tilgang versus sædvanlig pleje til patienter med fremskreden cancer.

Hypotese (null): der er ingen forskel i overlevelse på tværs af POG-patienter og patienter med normal pleje

Hypotese (alternativ): POG-patienter, der påbegyndte WGTA, lever i gennemsnit længere end normalt plejepatienter

Studere design

Denne undersøgelse vil anvende et retrospektivt kohortedesign. Kohorter vil omfatte patienter, der gav samtykke til POG og gennemgik en biopsi for WGTA mellem juli 2014 og december 2017 og matchede sædvanlige plejekontroller. POG-patienter, der tilmeldte sig før juli 2014, vil blive udelukket fra vores undersøgelse, fordi henvisende klinikere i denne gennemførlighedsperiode anvendte et højt niveau af sag-til-sag rekruttering. Patienter med sædvanlig pleje vil blive matchet med POG-patienter ved hjælp af superviserede læringsteknikker. Undersøgelsesperioden vil strække sig fra patientens tidspunkt for metastatisk cancerdiagnose til 31. december 2018.

Data kilder

De-identificerede linkede befolkningsbaserede administrative datasæt vil blive indhentet fra BC Cancer for alle voksne patienter (>18 år) diagnosticeret med cancer i BC før december 2017. POG-patienter vil blive identificeret fra BC Cancer Outcomes and Surveillance Integration System (OaSIS) POG-moduldatabase. Kvalificerede kontrolpatienter vil blive identificeret fra BC Cancer Registry, et befolkningsbaseret provinsielt cancerregister. Disse data vil blive forbundet med data fra BC Cancer Pharmacy Database, Radiotherapy Database og Cancer Agency Information System (CAIS) ved hjælp af agenturspecifikke identifikatorer.

Statistisk tilgang

Efterforskerne vil matche POG-patienter og patienter med sædvanlig pleje baseret på deres dato for metastatisk sygdomsdiagnose. De vil anvende 1:1 genetisk algoritme-baseret matchning (1:2 i sensitivitetsanalyse) og matche patienter på tilbøjelighedsscore og baseline-kovariater, herunder patientdemografi, kliniske karakteristika, behandlingshistorier og sundhedsudnyttelse forud for metastatisk sygdomsdiagnose. Når det er nødvendigt, vil matchende analyser blive stratificeret for at tage højde for variation på tværs af kræfttyper.

For at estimere den samlede overlevelse hos POG-patienter og matchede kontroller, vil ikke-parametriske og parametriske overlevelsesanalyser blive brugt. Disse analyser vil blive justeret for censur. Efterforskerne vil undersøge heterogenitet i klinisk effektivitet på tværs af kræftundertyper gennem undergruppeanalyse og bruge scenarieanalyse til at bestemme virkningen af ​​fremtidige ændringer i anvendelsen af ​​WGTA på klinisk effektivitet.