Optimisation de l'échantillonnage et du traitement des échantillons pour la recherche microbienne moléculaire sur des échantillons de surface oculaire (EPSO)

L'utilisation d'anesthésiques fait l'objet de discussions dans la recherche sur le microbiome de la surface oculaire. Une publication a montré une diversité alpha significativement plus faible lors de l'utilisation d'un anesthésique. Cependant, l'effet diluant de la goutte anesthésique elle-même n'a pas été pris en compte. D'autre part, l'utilisation d'anesthésiques permettra aux patients de mieux tolérer le prélèvement, ce qui pourrait permettre un meilleur prélèvement. Pour analyser l'effet des gouttes anesthésiques sur la composition du microbiome de la surface oculaire, nous avons échantillonné des volontaires subissant une anesthésie générale. En utilisant des larmes artificielles comme contrôle, nous avons cherché à rendre compte de l'effet diluant de l'anesthésique. En utilisant des volontaires sous anesthésie générale, nous voulions assurer une pression similaire avec ou sans anesthésie topique puisque l'exécuteur n'était pas influencé par la réaction du patient.

De plus, l'effet de différents protocoles d'extraction sur les résultats de séquençage sera évalué en échantillonnant différents volontaires dans les deux yeux sur des jours non consécutifs.