Optimering av provtagning och bearbetning av prover för molekylär mikrobiell forskning på okulära ytprover (EPSO)

Användningen av anestetika är föremål för diskussion inom okulär ytmikrobiomforskning. En publikation visade en signifikant lägre alfadiversitet vid användning av bedövningsmedel. Den utspädande effekten av själva anestesidroppen togs dock inte hänsyn till. Å andra sidan kommer användning av anestetika att göra det möjligt för patienter att tolerera provtagning bättre och detta kan möjliggöra bättre provtagning. För att analysera effekten av bedövningsdroppar på sammansättningen av den okulära ytmikrobiomet tog vi prov på frivilliga som genomgick allmän anestesi. Genom att använda konstgjorda tårar som kontroll syftade vi till att redogöra för bedövningsmedlets utspädande effekt. Genom att använda frivilliga under allmän anestesi ville vi säkerställa liknande tryck med eller utan topikal anestesi eftersom exekutorn inte påverkades av patientens reaktion.

Dessutom kommer effekten av olika extraktionsprotokoll på sekvenseringsresultat att bedömas genom att ta prover på olika frivilliga i båda ögonen under icke på varandra följande dagar.