Déterminants de la pneumonie COVID-19 (MC-19) (MC-19)

Comme l'a démontré une étude menée par Ai et al., incluant 1014 cas suspects de COVID-19 qui ont subi plusieurs tests RT-PCR et CT thoracique, dans l'ensemble, 88 % des patients avaient des tomodensitogrammes positifs tandis que la positivité RT-PCR n'a été trouvée que dans 59 % de tous les cas. En outre, comme indiqué par Yang et al, le taux positif total de RT-PCR pour les échantillons de prélèvement de gorge était d'environ 30 % à 60 % lors de la présentation initiale. Ainsi, un résultat négatif n'exclut pas la possibilité d'une infection et ne doit pas être utilisé comme seul critère pour le traitement du patient et les décisions de prise en charge.

Les raisons d'une RT-PCR faussement négative peuvent inclure le manque d'identification ou des procédures inadéquates pour la collecte, la manipulation et le stockage des échantillons, ainsi qu'une recombinaison virale active ou des tests effectués hors de la fenêtre de diagnostic.

Des études préliminaires ont révélé que les patients peuvent présenter des modifications CT très précoces mais significatives avant même les études RT-PCR. D'où la nécessité de développer une approche combinée pour le diagnostic de ces patients particuliers qui présentent des résultats négatifs au test RT-PCR.

L'hypothèse des enquêteurs est que plusieurs patients qui ont présenté une pneumonie confirmée par tomodensitométrie lors de l'épidémie de coronavirus et qui ont été testés négatifs pour le SRAS-CoV2 lors de la RT-PCR pourraient probablement être affectés par la maladie et doivent être surveillés attentivement.

Critère principal Le critère principal de notre étude prospective et observationnelle est d'évaluer si les patients hospitalisés qui ont présenté une pneumonie mais qui ont eu un test négatif pour le Covid-19 sont positifs à la sérologie pour le SRAS-CoV-2.

Critères d'évaluation secondaires Parmi les autres critères d'évaluation secondaires, l'objectif des chercheurs est de déterminer si la combinaison de la tomodensitométrie et de la sérologie pourrait aider à identifier les patients initialement négatifs aux seuls tests de laboratoire.

D'autres critères d'évaluation secondaires sont l'efficacité des différents traitements pharmaceutiques contre le Covid-19 qui ont été initiés de manière empirique dans ces cas hautement suspects et le développement d'une approche utile pour les patients initialement testés négatifs pour l'infection par le Covid-19.

Méthodes Avant de commencer l'étude, le protocole sera soumis et approuvé par les comités d'éthique locaux de la Fondazione Policlinico Universitario A. Gemelli IRCCS, Université catholique, Rome, Italie. Avant l'inscription, chaque sujet signera le consentement éclairé.

Critères d'inclusion : sujets hospitalisés des deux sexes âgés de 18 ans ou plus avec diagnostic de pneumonie, confirmé par imagerie thoracique et saturation en oxygène (SaO2) ≤ 94 % dans l'air ambiant, test Covid-19 négatif, ayant donné leur consentement éclairé à la collecte des données du patient ou du représentant légal du patient si le patient est trop malade pour donner son consentement.

Critères d'exclusion : âge inférieur à 18 ans, grossesse ou allaitement. Des échantillons d'écouvillonnage nasopharyngé seront prélevés pour une réaction en chaîne par polymérase quantitative en temps réel afin de diagnostiquer Covid19 (2 tests répétés).

Les données recueillies comprennent le moment des symptômes (toux, fièvre, dyspnée, conjonctivite, diarrhée, asthénie, arthralgie), l'âge, le sexe, la taille, le poids, l'éducation, les habitudes d'alcool et de tabac, les morbidités, la glycémie, la créatinine, les transaminases, les γ-GT, le total cholestérol, HDL-cholestérol, triglycérides, formule sanguine complète, D-dimères, lactique déshydrogénase (LDH), protéine C-réactive à haute sensibilité (hs-CRP), créatinkinase (CK), ferritine, HbA1c, radiographie pulmonaire, thorax Tomodensitométrie, cultures, traitement de la pneumonie, autres traitements, y compris les agents antihypertenseurs et antihyperglycémiants, la température corporelle, la pression artérielle et le débit d'oxygène ou d'autres types de traitement à l'oxygène.

Cinq ml de plasma divisés en aliquotes de 1 ml chacun seront également obtenus et stockés à -80°C de manière anonyme pour une analyse future, y compris par des tiers.

Taille de l'échantillon S'il n'y a vraiment aucune différence entre le traitement standard et expérimental (16 % dans les deux groupes), alors 260 patients doivent être sûrs à 90 % que les limites d'un intervalle de confiance bilatéral à 90 % excluront une différence entre le groupe standard et groupe expérimental de plus de 15 % Signification (α) = 0,05 Puissance (1-β) = 90 % Pourcentage de décès dans le groupe témoin et le groupe expérimental = 16 % Limite d'équivalence = 15 %

Calcul basé sur la formule :

n = 2 × f(α, β/2) × π × (100 - π) / d2 où π est le véritable pourcentage de « succès » dans les groupes de traitement témoin et expérimental, et f(α, β) = [Φ -1(α) + Φ-1(β)]2 Φ-1 est la fonction de distribution cumulative d'un écart normal standardisé.

Statistiques L'association entre la récupération et les groupes de patients sera testée au moyen d'un test exact de Fisher. Une régression Cox Proportional-Hazard sera utilisée pour comparer les courbes de survie (temps d'amélioration) entre les groupes étudiés en corrigeant pour la thérapie administrée et pour toutes les variables quantitatives collectées. Les variables quantitatives, mesurées à l'admission à l'hôpital, seront comparées entre les groupes à l'aide de l'ANOVA. Dans les analyses univariées, les variables catégorielles, telles que le sexe, l'éducation, la consommation d'alcool et les habitudes tabagiques seront analysées au moyen d'un test du chi carré pour étudier leur association avec la récupération, tandis qu'un modèle de régression logistique sera utilisé pour tester d'éventuels prédicteurs quantitatifs de récupération. Un modèle logistique multivariable, avec une procédure de sélection pas à pas, sera ensuite utilisé pour tester toutes les variables significatives dans une analyse univariée.