Test rapide sec ou humide du nasopharynx pour la détection du COVID-19. (RESTART)

En réponse à la pandémie croissante de SRAS-CoV-2 et aux pénuries de capacités et de réactifs de tests moléculaires rapides en laboratoire à l'échelle mondiale, plusieurs fabricants ont développé des kits de tests rapides à utiliser en dehors des laboratoires. Ces kits simples reposent soit sur la détection de protéines du virus SARS-CoV-2 sur des prélèvements respiratoires (ex. prélèvements nasopharyngés ou de la gorge), ou la détection, dans le sang ou le sérum, d'anticorps humains générés en réponse à une infection.

Le 28 octobre 2020, le Conseil fédéral suisse a décidé qu'à partir du 2 novembre 2020, en plus des tests de réaction en chaîne par polymérase (PCR), qui sont considérés comme le "Gold standard" pour le diagnostic du SRAS-CoV-2, il serait possible d'effectuer des tests nasopharyngés tests antigéniques rapides dans toute la Suisse, également en dehors des laboratoires agréés. Dans un établissement de soins hospitaliers, les tests rapides sont destinés à aider les médecins à gérer rapidement les cas présentant des symptômes compatibles avec la COVID-19 à l'admission et à faciliter le triage et le flux des patients, notamment dans une période marquée par la transition vers des taux d'incidence plus élevés et une pression énorme sur le système de santé. . Cette stratégie a ensuite été adoptée par les Hôpitaux universitaires de Lausanne également.

Le test rapide d'antigène SARS-CoV-2 de Roche (qui est le test réel utilisé par notre institution) est un immunodosage chromatographique rapide destiné à la détection qualitative d'un antigène spécifique du SARS-CoV-2 présent dans le nasopharynx humain. Ce test est réalisé à l'aide d'un écouvillon nasopharyngé prélevé sur un patient avec un résultat disponible après 10-15 minutes. Alors que le fabricant rapporte de très bonnes performances diagnostiques du test, la littérature montre une grande variabilité de sensibilité et de spécificité. Les performances diagnostiques du test antigénique rapide peuvent être suffisamment élevées pour détecter les cas à charge virale élevée (c.-à-d. cas présymptomatiques et symptomatiques précoces jusqu'à cinq jours après l'apparition des symptômes. En raison de la nature intense mais de courte durée de l'excrétion du SRAS-CoV-2 par les voies respiratoires supérieures, l'utilisation clinique des tests antigéniques rapides nécessite une grande attention au moment de l'infection, car les tests tardifs au cours de l'infection entraîneront un taux apparemment faible. sensibilité clinique. Il y a une baisse significative de la charge virale après 5 à 7 jours de symptômes. Afin de tenir compte de cet éventuel inconvénient et de compenser la perte de performance diagnostique du test antigénique rapide sur infection tardive, une RT-PCR de confirmation est systématiquement réalisée par le laboratoire de microbiologie du CHUV. Afin d'éviter de multiples prélèvements d'un même patient et d'accélérer le délai d'obtention des résultats finaux, un seul prélèvement nasopharyngé est réalisé sur chaque patient et trempé dans un milieu de transport viral. A partir de ce milieu de transport, les deux tests sont effectués (test antigénique rapide et RT-PCR). Cette procédure introduit une étape de pré-dilution (contrairement à la procédure habituelle de test rapide d'antigène utilisant un écouvillon nasopharyngé sec) mais est conforme aux spécifications des instructions des fabricants. Alors que la littérature actuelle plaide contre une diminution significative des performances analytiques des tests due à cette stratégie, il n'y a pas de consensus fort concernant l'influence du milieu de transport sur la stabilité de la charge virale et sur la sensibilité analytique et clinique du test.