Score d'inadéquation allogénomique (AMS) appliqué aux paires donneur/receveur haplo-identiques dans la transplantation de cellules souches hématopoïétiques (AMS-haplo)
7 février 2022 mis à jour par: Alice AARNINK, Central Hospital, Nancy, France
La survenue de GVH (Graf Versus Host disease) aiguë et/ou chronique chez les receveurs subissant une GCSH (greffe de cellules souches hématopoïétiques) avec un donneur géno-identique suggère l'implication d'autres systèmes ou gènes que ceux impliqués dans la compatibilité HLA (Human Leukocyte Antigen) .
En transplantation rénale, il a été montré que l'AMS (score de mismatch allogénomique) est corrélé à la probabilité de survie du greffon. Cet AMS reflète le degré de différences entre les immunopeptidomes du receveur et de son donneur car il s'agit d'une variable continue basée sur le nombre de nsSNP (polymorphisme mononucléotidique non synonyme) entre le donneur et le receveur. En gros, l'exome du donneur est aligné sur l'exome du receveur, permettant de compter le nombre de variations qui vont générer un peptide présent chez le receveur mais absent chez le donneur. Dans ce cas, le peptide présenté par les cellules du receveur ne fait pas partie de l'immunopeptidome du donneur, conduisant à une activation des cellules immunocompétentes du donneur vis-à-vis de cet antigène, c'est-à-dire à une alloréactivité pouvant provoquer une GVL (Graft Versus Leukemia) et/ou une GVH.
Cette étude vise à mettre en évidence des corrélations significatives entre la survenue de GVH aiguë et/ou chronique après greffe de cellules souches haplo-identiques et l'AMS.
Cela permettrait d'utiliser l'AMS comme facteur prédictif de GVH aiguë ou chronique, qui pourrait être utilisé pour sélectionner le meilleur donneur pour un receveur particulier et/ou personnaliser les immunothérapies après la transplantation
Aperçu de l'étude
Statut
Complété
Les conditions
Type d'étude
Observationnel
Inscription (Réel)
80
Contacts et emplacements
Cette section fournit les coordonnées de ceux qui mènent l'étude et des informations sur le lieu où cette étude est menée.
Lieux d'étude
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Vandœuvre-lès-Nancy, France, 54500
- Alice Aarnink
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Critères de participation
Les chercheurs recherchent des personnes qui correspondent à une certaine description, appelée critères d'éligibilité. Certains exemples de ces critères sont l'état de santé général d'une personne ou des traitements antérieurs.
Critère d'éligibilité
Âges éligibles pour étudier
18 ans et plus (Adulte, Adulte plus âgé)
Accepte les volontaires sains
Non
Sexes éligibles pour l'étude
Tout
Méthode d'échantillonnage
Échantillon non probabiliste
Population étudiée
40 couples donneur/receveur haplo-identiques
La description
Critère d'intégration:
- - Receveurs ayant subi une greffe de cellules souches haplo-identiques au CHRU (Centre Hospitalier Régional et Universitaire) de Nancy
- Receveurs greffés entre le 03/01/2015 et le 01/01/2020
- Bénéficiaire âgé de plus de 18 ans au moment de la greffe
- ADN disponible pour le receveur et son donneur.
Critère d'exclusion:
- Le receveur est décédé dans les 6 mois suivant la greffe sans GVH aiguë (statut inconnu pour l'un des résultats mesurés)
Plan d'étude
Cette section fournit des détails sur le plan d'étude, y compris la façon dont l'étude est conçue et ce que l'étude mesure.
Comment l'étude est-elle conçue ?
Détails de conception
- Modèles d'observation: Cohorte
- Perspectives temporelles: Rétrospective
Cohortes et interventions
Groupe / Cohorte |
Intervention / Traitement |
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pas de GVH aiguë, pas de GVH chronique
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Le score d'inadéquation allogénomique (AMS) est une variable continue basée sur le nombre de nsSNP entre le donneur et le receveur.
En gros, l'exome du donneur est aligné sur l'exome du receveur, permettant de compter le nombre de variations qui vont générer un peptide présent chez le receveur mais absent chez le donneur.
Le score d'incompatibilité allogénomique optimisé (AMS) est une variable continue basée sur le nombre de nsSNP entre le donneur et le receveur, ne rencontrant que des peptides pouvant être présentés par le CMH des donneurs (en utilisant une autre couche d'algorithme, NetMHCpan).
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GVH aiguë sans GVH chronique
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Le score d'inadéquation allogénomique (AMS) est une variable continue basée sur le nombre de nsSNP entre le donneur et le receveur.
En gros, l'exome du donneur est aligné sur l'exome du receveur, permettant de compter le nombre de variations qui vont générer un peptide présent chez le receveur mais absent chez le donneur.
Le score d'incompatibilité allogénomique optimisé (AMS) est une variable continue basée sur le nombre de nsSNP entre le donneur et le receveur, ne rencontrant que des peptides pouvant être présentés par le CMH des donneurs (en utilisant une autre couche d'algorithme, NetMHCpan).
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GVH chronique sans GVH aiguë
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Le score d'inadéquation allogénomique (AMS) est une variable continue basée sur le nombre de nsSNP entre le donneur et le receveur.
En gros, l'exome du donneur est aligné sur l'exome du receveur, permettant de compter le nombre de variations qui vont générer un peptide présent chez le receveur mais absent chez le donneur.
Le score d'incompatibilité allogénomique optimisé (AMS) est une variable continue basée sur le nombre de nsSNP entre le donneur et le receveur, ne rencontrant que des peptides pouvant être présentés par le CMH des donneurs (en utilisant une autre couche d'algorithme, NetMHCpan).
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GVH aiguë et chronique
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Le score d'inadéquation allogénomique (AMS) est une variable continue basée sur le nombre de nsSNP entre le donneur et le receveur.
En gros, l'exome du donneur est aligné sur l'exome du receveur, permettant de compter le nombre de variations qui vont générer un peptide présent chez le receveur mais absent chez le donneur.
Le score d'incompatibilité allogénomique optimisé (AMS) est une variable continue basée sur le nombre de nsSNP entre le donneur et le receveur, ne rencontrant que des peptides pouvant être présentés par le CMH des donneurs (en utilisant une autre couche d'algorithme, NetMHCpan).
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Que mesure l'étude ?
Principaux critères de jugement
Mesure des résultats |
Description de la mesure |
Délai |
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Performances prédictives de l'AMS concernant la survenue de GVH chronique
Délai: 12 mois après chaque greffe
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Le score d'inadéquation allogénomique (AMS) est une variable continue basée sur le nombre de nsSNP entre le donneur et le receveur.
En gros, l'exome du donneur est aligné sur l'exome du receveur, permettant de compter le nombre de variations qui vont générer un peptide présent chez le receveur mais absent chez le donneur.
La comparaison d'AMS sera effectuée entre les groupes "présence de cGVH" et "absence de cGVH"
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12 mois après chaque greffe
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Mesures de résultats secondaires
Mesure des résultats |
Description de la mesure |
Délai |
|---|---|---|
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Performances prédictives de l'AMS concernant la survenue d'une GVH aiguë
Délai: 6 mois après chaque greffe
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Le score d'inadéquation allogénomique (AMS) est une variable continue basée sur le nombre de nsSNP entre le donneur et le receveur.
En gros, l'exome du donneur est aligné sur l'exome du receveur, permettant de compter le nombre de variations qui vont générer un peptide présent chez le receveur mais absent chez le donneur.
La comparaison d'AMS sera effectuée entre les groupes "présence d'aGVH" et "absence d'aGVH"
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6 mois après chaque greffe
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Performances prédictives d'un AMS optimisé concernant la survenue de GVH chronique
Délai: 12 mois après chaque greffe
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Le score d'incompatibilité allogénomique optimisé (AMS) est une variable continue basée sur le nombre de nsSNP entre le donneur et le receveur, ne rencontrant que des peptides pouvant être présentés par le CMH des donneurs (en utilisant une autre couche d'algorithme, NetMHCpan).
La comparaison de l'AMS optimisé sera effectuée entre les groupes "présence de cGVH" et "absence de cGVH"
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12 mois après chaque greffe
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Performances prédictives d'un AMS optimisé concernant la survenue d'une GVH aiguë
Délai: 6 mois après chaque greffe
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Le score d'incompatibilité allogénomique optimisé (AMS) est une variable continue basée sur le nombre de nsSNP entre le donneur et le receveur, ne rencontrant que des peptides pouvant être présentés par le CMH des donneurs (en utilisant une autre couche d'algorithme, NetMHCpan).
La comparaison d'AMS optimisé sera effectuée entre les groupes "présence d'aGVH" et "absence d'aGVH"
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6 mois après chaque greffe
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Performances prédictives de l'AMS concernant la survenue d'une rechute
Délai: 12 mois après chaque greffe
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Le score d'inadéquation allogénomique (AMS) est une variable continue basée sur le nombre de nsSNP entre le donneur et le receveur.
En gros, l'exome du donneur est aligné sur l'exome du receveur, permettant de compter le nombre de variations qui vont générer un peptide présent chez le receveur mais absent chez le donneur.
La comparaison des AMS sera effectuée entre les groupes "rechute" et "sans rechute"
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12 mois après chaque greffe
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Performances prédictives d'un AMS optimisé concernant la survenue d'une rechute
Délai: 12 mois après chaque greffe
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Le score d'incompatibilité allogénomique optimisé (AMS) est une variable continue basée sur le nombre de nsSNP entre le donneur et le receveur, ne rencontrant que des peptides pouvant être présentés par le CMH des donneurs (en utilisant une autre couche d'algorithme, NetMHCpan).
La comparaison des AMS optimisés sera effectuée entre les groupes "rechute" et "sans rechute"
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12 mois après chaque greffe
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Collaborateurs et enquêteurs
C'est ici que vous trouverez les personnes et les organisations impliquées dans cette étude.
Parrainer
Dates d'enregistrement des études
Ces dates suivent la progression des dossiers d'étude et des soumissions de résultats sommaires à ClinicalTrials.gov. Les dossiers d'étude et les résultats rapportés sont examinés par la Bibliothèque nationale de médecine (NLM) pour s'assurer qu'ils répondent à des normes de contrôle de qualité spécifiques avant d'être publiés sur le site Web public.
Dates principales de l'étude
Début de l'étude (Réel)
23 mars 2015
Achèvement primaire (Réel)
6 novembre 2020
Achèvement de l'étude (Réel)
6 novembre 2020
Dates d'inscription aux études
Première soumission
13 janvier 2022
Première soumission répondant aux critères de contrôle qualité
7 février 2022
Première publication (Réel)
17 février 2022
Mises à jour des dossiers d'étude
Dernière mise à jour publiée (Réel)
17 février 2022
Dernière mise à jour soumise répondant aux critères de contrôle qualité
7 février 2022
Dernière vérification
1 février 2022
Plus d'information
Termes liés à cette étude
Autres numéros d'identification d'étude
- 2021PI066
Plan pour les données individuelles des participants (IPD)
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Indécis
Informations sur les médicaments et les dispositifs, documents d'étude
Étudie un produit pharmaceutique réglementé par la FDA américaine
Non
Étudie un produit d'appareil réglementé par la FDA américaine
Non
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