L'effet des gouttes ophtalmiques antibiotiques sur le microbiome nasal chez les sujets sains

Les antibiotiques topiques ophtalmiques sont couramment prescrits en pratique clinique pour plusieurs indications telles que la conjonctivite bactérienne, la kératite, la blépharite, la dacryocystite et aussi en prophylaxie. Aminosides (c.-à-d. gentamicine) et les fluoroquinolones (c.-à-d. ciprofloxacine) font partie des classes de substances les plus fréquemment utilisées.

Il existe des preuves que les collyres topiques non antibiotiques pourraient avoir un effet sur la flore muqueuse nasopharyngée. Cela semble logique en raison de la connexion anatomique à travers le canal lacrymo-nasal et du fait que jusqu'à 80 % du médicament administré par voie topique diffuse dans la circulation systémique à travers la muqueuse nasopharyngée hautement vascularisée. Cependant, dans la littérature aucune donnée sur l'effet des collyres antibiotiques sur le microbiome nasal ou pharyngé n'est actuellement disponible.

Récemment, de nouvelles techniques non basées sur la culture pour l'évaluation du microbiome bactérien ont été développées, appelées "séquençage de nouvelle génération" (NGS). NGS utilise des amorces universelles ciblant le gène de l'ARNr 16S, qui est omniprésent dans la plupart des bactéries. Avec cette technique, il est possible d'obtenir des informations sur un large éventail du microbiome bactérien et pas seulement sur des espèces présélectionnées.

Dans la présente étude, le NGS sera utilisé pour étudier l'effet des gouttes ophtalmiques antibiotiques sur le microbiome nasal et pharyngé. À cette fin, des sujets sains seront randomisés pour recevoir soit des gouttes ophtalmiques contenant de la gentamicine, de la ciprofloxacine ou des lubrifiants topiques comme contrôle. Comme résultat secondaire, la prévalence des gènes de résistance bactérienne, ainsi que les signes et symptômes de lésions de la surface oculaire seront évalués.

L'étude se déroulera en 2 parties. Étant donné que les deux formulations d'antibiotiques topiques contiennent du chlorure de benzalkonium qui a également un effet potentiel sur la flore muqueuse nasale et pharyngée, on ne sait pas dans quelle mesure le chlorure de benzalkonium contribuerait aux modifications du microbiome nasal après l'administration d'antibiotiques topiques. Pour surmonter ce problème, une première étude pilote sur 20 sujets sera réalisée dans laquelle les sujets seront randomisés pour recevoir soit des gouttes ophtalmiques contenant de la gentamicine, de la ciprofloxacine, des lubrifiants topiques contenant des conservateurs ou des lubrifiants topiques sans conservateur. Sur la base des résultats de cette étude pilote, le contrôle pour la partie principale de l'étude sera choisi, en fonction de l'effet sur le microbiome bactérien. Les résultats de l'étude pilote pourraient également fournir des données utiles pour ajuster la taille de l'échantillon pour la partie principale de l'étude. Dans l'étude principale, 60 sujets seront randomisés pour recevoir de la gentamicine, de la ciprofloxacine ou des gouttes ophtalmiques lubrifiantes. Les mêmes examens que décrits ci-dessus seront effectués après 1 semaine de traitement ainsi qu'1 semaine et 3 mois après le traitement.