Cohorte Tuberculose Hôpital Avicenne (COTB-AVC)

À l'échelle mondiale, on estime que 10,0 millions de cas et 1,4 million de décès dus à la tuberculose (TB) ont été signalés en 2019. Malgré un taux de tuberculose latente estimé à 23% de la population mondiale, il existe de très grandes disparités d'incidence entre les continents et les pays avec une incidence de moins de 10 cas pour 100 000 habitants en Europe de l'Ouest à plus de 500/100 000 pour les pays comme le Sud Afrique, Philippines ou Mozambique. Bien que la Région européenne ne représente que 2,5 % de tous les cas, la tuberculose reste une infection courante dans les zones d'immigration et pauvres. L'objectif global de l'OMS d'ici 2035 (The End TB strategy) est de réduire le nombre de décès dus à la tuberculose de 95 % (par rapport à 2015) et de réduire le taux d'incidence de la tuberculose de 90 % à moins de 10/100 000 personnes. En France, le taux de déclaration national est de 7,6/100 000 mais le Nord de Paris est la zone de France où l'incidence de la tuberculose est la plus élevée (25,9/100 000 pour 2016-2018). La baisse des taux de notification observée dans la plupart des pays est rassurante, mais les taux annuels de baisse sont encore insuffisants pour atteindre l'objectif de l'OMS d'élimination de la tuberculose d'ici 2050 dans les pays européens à faible incidence. La lutte antituberculeuse nécessite la détection et le traitement précoces des patients, ainsi que l'investigation des contacts potentiellement exposés. Ces mesures peuvent prévenir la transmission continue de l'infection et le développement d'une résistance aux médicaments. Par conséquent, la surveillance des résultats du traitement de la tuberculose est également d'une grande importance lors de l'évaluation des programmes de lutte contre la tuberculose. Depuis 2014, l'objectif fixé par l'OMS est de 90 % de succès thérapeutique parmi les nouveaux cas de tuberculose à frottis positif. En 2017, 30 des 31 pays de l'UE/EEE ont notifié 55 337 cas de tuberculose. Seuls les deux tiers (67,6%) ont été traités avec succès et 7% sont décédés pendant le traitement antituberculeux. En effet, le suivi de l'issue du traitement (TOM) fait partie de la déclaration obligatoire en France depuis 2007, avec des formulaires d'issue du traitement remplis par le clinicien à 1 an. Malheureusement, en France, les informations disponibles sur les résultats des traitements sont limitées par de fréquentes données manquantes avec seulement 64,8 % des dossiers de résultats de traitement complétés en 2018. En outre, une connaissance approfondie de l'épidémiologie de la maladie tuberculeuse d'un pays spécifique est essentielle pour élaborer un plan stratégique national complet de lutte contre la tuberculose et pourrait aider à identifier les déterminants d'un résultat de traitement défavorable ou d'un perdu de vue. Le parcours de soins des patients tuberculeux présente des lacunes criantes avec une grande partie des résultats thérapeutiques inconnus, dont un grand nombre de perdus de vue entraînant des transmissions secondaires, des récidives de tuberculose et l'émergence de résistances. Les résultats de traitement inconnus correspondent à des résultats de traitement non précisés à 12 mois du début du traitement (perdus de vue, transfert, absence d'information). Les acteurs de santé doivent se mobiliser pour mieux comprendre les caractéristiques des patients aux résultats de traitement incomplets et apporter des solutions pour parvenir à un meilleur contrôle de la tuberculose dans notre région. Nous voulons également évaluer la relation entre les concentrations plasmatiques des principaux médicaments antituberculeux (rifampicine et isoniazide) et les résultats du traitement.

Nous proposons de constituer pour la première fois en France une cohorte de patients atteints de tuberculose maladie afin de répondre à ces objectifs.

L'étude princeps recruterait 75 patients par an pendant 4 ans associés à 1 an de suivi pour une durée totale de l'étude estimée à 5 ans. En mettant en place une étude de cohorte prospective de patients atteints de tuberculose dans le nord de Paris, nous visons évaluer les résultats du traitement de la tuberculose et leurs déterminants dans la zone où l'incidence de la tuberculose en France métropolitaine est la plus élevée. Parallèlement, nous souhaitons évaluer les caractéristiques socio-démographiques et cliniques de nos patients ainsi que la relation entre les concentrations plasmatiques des principaux antituberculeux (rifampicine et isoniazide) et les résultats du traitement.

Méthodes Population étudiée et collecte des données Une étude de cohorte observationnelle, prospective, monocentrique de patients adultes traités pour une maladie tuberculeuse sera réalisée dans 1 centre du nord de Paris : le service d'infectiologie et de pneumologie de l'hôpital Avicenne (Bobigny).

Des données sociodémographiques, physiques, biologiques et radiologiques seront collectées pour les patients répondant aux critères d'inclusion selon le calendrier de l'étude : jour 0 (J0), J15, mois 1 (M1), M2, M6 et M12. Le critère d'évaluation principal sera un résultat défavorable du traitement à 12 mois. Les catégories de résultats thérapeutiques ont été définies en adaptant les recommandations européennes et OMS au contexte français. Un patient ayant terminé son traitement dans les 12 mois était considéré comme ayant une évolution favorable du traitement même s'il ne s'était pas présenté à la visite à M12. Les critères d'évaluation secondaires comprendront les caractéristiques socioéconomiques et cliniques des cas de tuberculose, ainsi que la pharmacocinétique de la rifampicine et de l'isoniazide.

Les critères d'inclusion sont TB ambulatoire ou hospitalisé nouvellement traité dans l'un des centres d'inclusion pour TB pulmonaire ou extra-pulmonaire confirmée bactériologiquement (examen direct, Gen-eXpert MTB/RIF et/ou culture positive), histologie évocatrice (épithélioïde gigantocellulaire granulome avec ou sans nécrose caséeuse), ou forte suspicion clinique de tuberculose non encore confirmée biologiquement mais avec décision d'instauration d'un traitement. Les critères de non inclusion sont : refus de participer à l'étude, traitement antituberculeux de plus de 7 jours à la visite d'inclusion et participation à un autre protocole de recherche.

Les données recueillies à l'inclusion seront : des données démographiques, sociales et professionnelles (sexe, âge, pays de naissance, date d'arrivée en France, séjour à l'étranger au cours des 2 dernières années, situation familiale, profession, domiciliation, assurance maladie couverture, langues parlées, co-infections, antécédents cliniques, addictions (tabac, alcool, drogues), indice de performance OMS, données cliniques (co-infections, indice de performance OMS, antécédents de tuberculose, localisation de la tuberculose, présence de toux, fièvre, sudation nocturne, contexte diagnostique), données biologiques, microbiologiques et radiologiques pour le suivi du traitement et de sa tolérance. Les données pharmacocinétiques seront également recueillies au jour 15 à partir du début du traitement avec un pic de dosage de la rifampicine et de l'isoniazide 3 heures après la prise du traitement. Le suivi de chaque patient durera 12 mois. Les données seront saisies dans un système électronique de saisie des données.

Analyse statistique Les variables qualitatives seront décrites comme fréquence (%) et les variables quantitatives comme médiane et intervalle interquartile (IQR). L'évolution du traitement à 1 an et les facteurs socio-économiques et cliniques associés seront étudiés par analyse multivariée. Des analyses univariées et multivariées seront effectuées à l'aide de la régression logistique. Tous les tests statistiques seront basés sur des valeurs p bilatérales, avec p<0,05 considéré comme indiquant une signification statistique. Les associations seront exprimées à l'aide de rapports de cotes bruts et ajustés avec des intervalles de confiance à 95 %. Dans notre modèle final, nous inclurons tous les éléments statistiquement significatifs après une rétrosélection utilisant un seuil de 0,20 pour la valeur de p. Toutes les analyses seront effectuées à l'aide du logiciel statistique RStudio (version 1.4.869 © 2009-2020 RStudio, Inc).