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- Registre américain des essais cliniques
- Essai clinique NCT05779904
Méthylation, microbiome, état nutritionnel et développement des enfants présentant un retard de croissance (MINUTES)
Méthylation de l'ADN, profil du microbiome, état nutritionnel et résultats développementaux des enfants avec et sans retard de croissance qui grandissent pendant la pandémie de Covid-19 : une étude cas-témoin
Aperçu de l'étude
Statut
Description détaillée
Type d'étude
Inscription (Estimé)
Contacts et emplacements
Lieux d'étude
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Jakarta, Indonésie, 10430
- Seameo Recfon
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Critères de participation
Critère d'éligibilité
Âges éligibles pour étudier
Accepte les volontaires sains
Méthode d'échantillonnage
Population étudiée
La description
Critère d'intégration:
- de 18,0 à 23,9 mois
- sans maladies graves
- la mère a accouché des enfants entre 18 et 40 ans
- a une ethnie Sasak, (5) une longueur couchée <-2SD (pour le groupe avec retard de croissance) et >-1SD (pour le groupe sans retard de croissance) par rapport à la médiane des normes de croissance de l'enfant de l'OMS pour leur âge et leur sexe au moment du recrutement.
Critère d'exclusion:
- naissance de jumeaux
- malformation congénitale
- consanguinité
Plan d'étude
Comment l'étude est-elle conçue ?
Détails de conception
Cohortes et interventions
Groupe / Cohorte |
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Retard de croissance (cas)
Dans le groupe de cas, les enfants présentant un retard de croissance (<-2SD) (n=150) seront recrutés.
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Non rachitique (témoin)
Dans le groupe témoin, des enfants sans retard de croissance (>-1SD) (n=150) seront recrutés.
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Que mesure l'étude ?
Principaux critères de jugement
Mesure des résultats |
Description de la mesure |
Délai |
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Signature épigénétique liée au retard de croissance
Délai: à l'inscription
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L'analyse des états épigénétiques (méthylation de l'ADN) sera effectuée à l'aide de la puce BeadChip Illumina Infinium Methylation EPIC V.2.0, complétée par des méthodologies de séquençage pour fournir à la fois une couverture large du génome et une analyse haute définition.
L'état épigénétique contrôle l'expression des gènes et la régulation globale du génome à grande échelle et l'étude se concentrera sur les états épigénétiques candidats impliqués dans le retard de croissance et ses corollaires parallèlement à l'association à l'échelle de l'épigénome.
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à l'inscription
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Mesures de résultats secondaires
Mesure des résultats |
Description de la mesure |
Délai |
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Résultats de la connaissance de l'enfant (par des psychologues)
Délai: à l'inscription
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Le développement cognitif sera évalué à l'aide de l'échelle Bayley complète du développement du nourrisson et du tout-petit (BSID-4) par des psychologues qualifiés. BSID-4 se compose de : Échelle cognitive (COG) ; Échelle de langage (LANG) et échelle motrice (MOT). La plage de score standard (SS) de chaque échelle est de 40 à 160 dans laquelle un score plus élevé signifie mieux. |
à l'inscription
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Résultats cognitifs de l'enfant (rapporté par le soignant)
Délai: à l'inscription
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Le développement cognitif sera évalué à l'aide de l'outil signalé par le soignant, c'est-à-dire INTERGROWTH-21st Neurodevelopment assessment INTER-NDA par des recenseurs formés. INTER-NDA se compose de : Cognitif ; Bon moteur; Motricité globale ; Langue; Comportement positif; Comportement négatif. La plage de score sur chaque échelle est de 0 à 100 dans laquelle un score plus élevé signifie mieux. |
à l'inscription
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Microbiote intestinal
Délai: à l'inscription
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Le microbiome fécal serait analysé à l'aide du séquençage de l'ARN 16S de la région V4 sur la plateforme Illumina MiSeq
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à l'inscription
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Collaborateurs et enquêteurs
Les enquêteurs
- Chercheur principal: Umi Fahmida, Dr., Seameo Recfon
Publications et liens utiles
Publications générales
- Walker SP, Chang SM, Powell CA, Simonoff E, Grantham-McGregor SM. Early childhood stunting is associated with poor psychological functioning in late adolescence and effects are reduced by psychosocial stimulation. J Nutr. 2007 Nov;137(11):2464-9. doi: 10.1093/jn/137.11.2464.
- Hoddinott J, Behrman JR, Maluccio JA, Melgar P, Quisumbing AR, Ramirez-Zea M, Stein AD, Yount KM, Martorell R. Adult consequences of growth failure in early childhood. Am J Clin Nutr. 2013 Nov;98(5):1170-8. doi: 10.3945/ajcn.113.064584. Epub 2013 Sep 4.
- Olofin I, McDonald CM, Ezzati M, Flaxman S, Black RE, Fawzi WW, Caulfield LE, Danaei G; Nutrition Impact Model Study (anthropometry cohort pooling). Associations of suboptimal growth with all-cause and cause-specific mortality in children under five years: a pooled analysis of ten prospective studies. PLoS One. 2013 May 29;8(5):e64636. doi: 10.1371/journal.pone.0064636. Print 2013.
- Sudfeld CR, McCoy DC, Danaei G, Fink G, Ezzati M, Andrews KG, Fawzi WW. Linear growth and child development in low- and middle-income countries: a meta-analysis. Pediatrics. 2015 May;135(5):e1266-75. doi: 10.1542/peds.2014-3111. Epub 2015 Apr 6.
- Cryan JF, Dinan TG. Mind-altering microorganisms: the impact of the gut microbiota on brain and behaviour. Nat Rev Neurosci. 2012 Oct;13(10):701-12. doi: 10.1038/nrn3346. Epub 2012 Sep 12.
- Stephenson LS, Latham MC, Ottesen EA. Malnutrition and parasitic helminth infections. Parasitology. 2000;121 Suppl:S23-38. doi: 10.1017/s0031182000006491.
- Haggarty P, Hoad G, Campbell DM, Horgan GW, Piyathilake C, McNeill G. Folate in pregnancy and imprinted gene and repeat element methylation in the offspring. Am J Clin Nutr. 2013 Jan;97(1):94-9. doi: 10.3945/ajcn.112.042572. Epub 2012 Nov 14.
- Masser DR, Stanford DR, Freeman WM. Targeted DNA methylation analysis by next-generation sequencing. J Vis Exp. 2015 Feb 24;(96):52488. doi: 10.3791/52488.
- MAL-ED Network Investigators. Childhood stunting in relation to the pre- and postnatal environment during the first 2 years of life: The MAL-ED longitudinal birth cohort study. PLoS Med. 2017 Oct 25;14(10):e1002408. doi: 10.1371/journal.pmed.1002408. eCollection 2017 Oct.
- Qin J, Li R, Raes J, Arumugam M, Burgdorf KS, Manichanh C, Nielsen T, Pons N, Levenez F, Yamada T, Mende DR, Li J, Xu J, Li S, Li D, Cao J, Wang B, Liang H, Zheng H, Xie Y, Tap J, Lepage P, Bertalan M, Batto JM, Hansen T, Le Paslier D, Linneberg A, Nielsen HB, Pelletier E, Renault P, Sicheritz-Ponten T, Turner K, Zhu H, Yu C, Li S, Jian M, Zhou Y, Li Y, Zhang X, Li S, Qin N, Yang H, Wang J, Brunak S, Dore J, Guarner F, Kristiansen K, Pedersen O, Parkhill J, Weissenbach J; MetaHIT Consortium; Bork P, Ehrlich SD, Wang J. A human gut microbial gene catalogue established by metagenomic sequencing. Nature. 2010 Mar 4;464(7285):59-65. doi: 10.1038/nature08821.
- Aguilar-Farias N, Toledo-Vargas M, Miranda-Marquez S, Cortinez-O'Ryan A, Cristi-Montero C, Rodriguez-Rodriguez F, Martino-Fuentealba P, Okely AD, Del Pozo Cruz B. Sociodemographic Predictors of Changes in Physical Activity, Screen Time, and Sleep among Toddlers and Preschoolers in Chile during the COVID-19 Pandemic. Int J Environ Res Public Health. 2020 Dec 29;18(1):176. doi: 10.3390/ijerph18010176.
- Ansari I, Raddatz G, Gutekunst J, Ridnik M, Cohen D, Abu-Remaileh M, Tuganbaev T, Shapiro H, Pikarsky E, Elinav E, Lyko F, Bergman Y. The microbiota programs DNA methylation to control intestinal homeostasis and inflammation. Nat Microbiol. 2020 Apr;5(4):610-619. doi: 10.1038/s41564-019-0659-3. Epub 2020 Feb 3.
- Bosso M, Thanaraj TA, Abu-Farha M, Alanbaei M, Abubaker J, Al-Mulla F. The Two Faces of ACE2: The Role of ACE2 Receptor and Its Polymorphisms in Hypertension and COVID-19. Mol Ther Methods Clin Dev. 2020 Jun 25;18:321-327. doi: 10.1016/j.omtm.2020.06.017. eCollection 2020 Sep 11.
- Burchill E, Lymberopoulos E, Menozzi E, Budhdeo S, McIlroy JR, Macnaughtan J, Sharma N. The Unique Impact of COVID-19 on Human Gut Microbiome Research. Front Med (Lausanne). 2021 Mar 16;8:652464. doi: 10.3389/fmed.2021.652464. eCollection 2021.
- Campagna MP, Xavier A, Lechner-Scott J, Maltby V, Scott RJ, Butzkueven H, Jokubaitis VG, Lea RA. Epigenome-wide association studies: current knowledge, strategies and recommendations. Clin Epigenetics. 2021 Dec 4;13(1):214. doi: 10.1186/s13148-021-01200-8.
- Carroll N, Sadowski A, Laila A, Hruska V, Nixon M, Ma DWL, Haines J, On Behalf Of The Guelph Family Health Study. The Impact of COVID-19 on Health Behavior, Stress, Financial and Food Security among Middle to High Income Canadian Families with Young Children. Nutrients. 2020 Aug 7;12(8):2352. doi: 10.3390/nu12082352.
- Development Initiatives (2018). 2018 Global Nutrition Report: Shining a light to spur action on nutrition. Bristol, UK: Development Initiatives.
- Development Initiatives Poverty Research. 2020. 2020 Global Nutrition Report: Action on equity to end malnutrition. Bristol, UK: Development Initiatives.
- Haggarty, P., K. Harrison and Haggarty (2017). Population Epigenetics, Springer.
- Hannon E, Schendel D, Ladd-Acosta C, Grove J, Hansen CS, Hougaard DM, Bresnahan M, Mors O, Hollegaard MV, Baekvad-Hansen M, Hornig M, Mortensen PB, Borglum AD, Werge T, Pedersen MG, Nordentoft M; iPSYCH-Broad ASD Group; Buxbaum JD, Daniele Fallin M, Bybjerg-Grauholm J, Reichenberg A, Mill J. Variable DNA methylation in neonates mediates the association between prenatal smoking and birth weight. Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci. 2019 Apr 15;374(1770):20180120. doi: 10.1098/rstb.2018.0120.
- Harpham T, Reichenheim M, Oser R, Thomas E, Hamid N, Jaswal S, Ludermir A, Aidoo M. Measuring mental health in a cost-effective manner. Health Policy Plan. 2003 Sep;18(3):344-9. doi: 10.1093/heapol/czg041.
- He J, Lu YP, Li J, Li TY, Chen X, Liang XJ, Chen WJ, Pi SN, Hocher B, Chen YP. Fetal But Not Maternal Angiotensin Converting Enzyme (ACE)-2 Gene Rs2074192 Polymorphism is Associated with Increased Risk of Being a Small For Gestational Age (SGA) Newborn. Kidney Blood Press Res. 2018;43(5):1596-1606. doi: 10.1159/000494449. Epub 2018 Oct 22.
- Huang M, Liu J, Liu K, Chen J, Wei Z, Feng Z, Wu Y, Fong M, Tian R, Wang B, Budjan C, Zhuang P, Wan G, Kong XJ. Microbiome-Specific Statistical Modeling Identifies Interplay Between Gastrointestinal Microbiome and Neurobehavioral Outcomes in Patients With Autism: A Case Control Study. Front Psychiatry. 2021 Oct 20;12:682454. doi: 10.3389/fpsyt.2021.682454. eCollection 2021.
- James P, Sajjadi S, Tomar AS, Saffari A, Fall CHD, Prentice AM, Shrestha S, Issarapu P, Yadav DK, Kaur L, Lillycrop K, Silver M, Chandak GR; EMPHASIS study group. Candidate genes linking maternal nutrient exposure to offspring health via DNA methylation: a review of existing evidence in humans with specific focus on one-carbon metabolism. Int J Epidemiol. 2018 Dec 1;47(6):1910-1937. doi: 10.1093/ije/dyy153.
- Littlejohn P, Finlay BB. When a pandemic and an epidemic collide: COVID-19, gut microbiota, and the double burden of malnutrition. BMC Med. 2021 Jan 28;19(1):31. doi: 10.1186/s12916-021-01910-z.
- Lima RS, Rocha LPC, Moreira PR. Genetic and epigenetic control of ACE2 expression and its possible role in COVID-19. Cell Biochem Funct. 2021 Aug;39(6):713-726. doi: 10.1002/cbf.3648. Epub 2021 Jun 1.
- Lozupone CA, Stombaugh J, Gonzalez A, Ackermann G, Wendel D, Vazquez-Baeza Y, Jansson JK, Gordon JI, Knight R. Meta-analyses of studies of the human microbiota. Genome Res. 2013 Oct;23(10):1704-14. doi: 10.1101/gr.151803.112. Epub 2013 Jul 16.
- Mansell G, Gorrie-Stone TJ, Bao Y, Kumari M, Schalkwyk LS, Mill J, Hannon E. Guidance for DNA methylation studies: statistical insights from the Illumina EPIC array. BMC Genomics. 2019 May 14;20(1):366. doi: 10.1186/s12864-019-5761-7.
- McArthur, BA., Browne, D., Tough, S., and Madigan, S. (2020). Trajectories of screen use during early childhood: Predictors and associated behavior and learning outcomes. Computers in Human Behavior 113: 106501.
- Miguel PM, Pereira LO, Silveira PP, Meaney MJ. Early environmental influences on the development of children's brain structure and function. Dev Med Child Neurol. 2019 Oct;61(10):1127-1133. doi: 10.1111/dmcn.14182. Epub 2019 Feb 11.
- Ministry of Health RI. 2021. Indonesia Nutritional Status Study 2021. (disseminated study through national event)
- Neumann, C., D. M. Harris and L. M. Rogers (2002). Contribution of animal source foods in improving diet quality and function in children in the developing world. Nutrition research 22(1-2): 193-220.
- Ngure FM, Reid BM, Humphrey JH, Mbuya MN, Pelto G, Stoltzfus RJ. Water, sanitation, and hygiene (WASH), environmental enteropathy, nutrition, and early child development: making the links. Ann N Y Acad Sci. 2014 Jan;1308:118-128. doi: 10.1111/nyas.12330.
- Noor N, Cardenas A, Rifas-Shiman SL, Pan H, Dreyfuss JM, Oken E, Hivert MF, James-Todd T, Patti ME, Isganaitis E. Association of Periconception Paternal Body Mass Index With Persistent Changes in DNA Methylation of Offspring in Childhood. JAMA Netw Open. 2019 Dec 2;2(12):e1916777. doi: 10.1001/jamanetworkopen.2019.16777.
- Nwosu BU, Lee MM. Evaluation of short and tall stature in children. Am Fam Physician. 2008 Sep 1;78(5):597-604.
- Ozaltin E, Hill K, Subramanian SV. Association of maternal stature with offspring mortality, underweight, and stunting in low- to middle-income countries. JAMA. 2010 Apr 21;303(15):1507-16. doi: 10.1001/jama.2010.450.
- Rinninella E, Raoul P, Cintoni M, Franceschi F, Miggiano GAD, Gasbarrini A, Mele MC. What is the Healthy Gut Microbiota Composition? A Changing Ecosystem across Age, Environment, Diet, and Diseases. Microorganisms. 2019 Jan 10;7(1):14. doi: 10.3390/microorganisms7010014.
- Riskesdas (2018). Departemen Kesehatan Republik Indonesia, Laporan Hasil Riset Kesehatan Dasar Indonesia (Riskesdas) 2018. Jakarta, Republic of Indonesia.
- Robertson RC, Manges AR, Finlay BB, Prendergast AJ. The Human Microbiome and Child Growth - First 1000 Days and Beyond. Trends Microbiol. 2019 Feb;27(2):131-147. doi: 10.1016/j.tim.2018.09.008. Epub 2018 Oct 24.
- Stewart CP, Iannotti L, Dewey KG, Michaelsen KF, Onyango AW. Contextualising complementary feeding in a broader framework for stunting prevention. Matern Child Nutr. 2013 Sep;9 Suppl 2(Suppl 2):27-45. doi: 10.1111/mcn.12088.
- Tian Y, Morris TJ, Webster AP, Yang Z, Beck S, Feber A, Teschendorff AE. ChAMP: updated methylation analysis pipeline for Illumina BeadChips. Bioinformatics. 2017 Dec 15;33(24):3982-3984. doi: 10.1093/bioinformatics/btx513.
- UNICEF. COVID-19 and Children in Indonesia.An Agenda for Action to Address Socio-Economic Challenges. 11 May 2020
- Williams AM, Suchdev PS. Assessing and Improving Childhood Nutrition and Growth Globally. Pediatr Clin North Am. 2017 Aug;64(4):755-768. doi: 10.1016/j.pcl.2017.03.001.
- Ye J, Wu W, Li Y, Li L. Influences of the Gut Microbiota on DNA Methylation and Histone Modification. Dig Dis Sci. 2017 May;62(5):1155-1164. doi: 10.1007/s10620-017-4538-6. Epub 2017 Mar 24.
- Yu G, Wang LG, Han Y, He QY. clusterProfiler: an R package for comparing biological themes among gene clusters. OMICS. 2012 May;16(5):284-7. doi: 10.1089/omi.2011.0118. Epub 2012 Mar 28.
- Zemrani B, Gehri M, Masserey E, Knob C, Pellaton R. A hidden side of the COVID-19 pandemic in children: the double burden of undernutrition and overnutrition. Int J Equity Health. 2021 Jan 22;20(1):44. doi: 10.1186/s12939-021-01390-w.
- Osendarp S, Akuoku JK, Black RE, Headey D, Ruel M, Scott N, Shekar M, Walker N, Flory A, Haddad L, Laborde D, Stegmuller A, Thomas M, Heidkamp R. The COVID-19 crisis will exacerbate maternal and child undernutrition and child mortality in low- and middle-income countries. Nat Food. 2021 Jul;2(7):476-484. doi: 10.1038/s43016-021-00319-4. Epub 2021 Jul 19.
Dates d'enregistrement des études
Dates principales de l'étude
Début de l'étude (Réel)
Achèvement primaire (Réel)
Achèvement de l'étude (Estimé)
Dates d'inscription aux études
Première soumission
Première soumission répondant aux critères de contrôle qualité
Première publication (Réel)
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Dernière mise à jour soumise répondant aux critères de contrôle qualité
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