- ICH GCP
- Yhdysvaltain kliinisten tutkimusten rekisteri
- Kliininen tutkimus NCT05779904
Metylaatio, mikrobiomi, ravitsemustila ja kitukasvuisten lasten kehitys (MINUTES)
DNA-metylaatio, mikrobiomiprofiili, ravitsemustila ja kehitystulokset kitukasvuisten ja ei-kitukasvuisten lasten kasvaessa Covid-19-pandemian aikana: tapauskontrollitutkimus
Tutkimuksen yleiskatsaus
Tila
Yksityiskohtainen kuvaus
Opintotyyppi
Ilmoittautuminen (Odotettu)
Yhteystiedot ja paikat
Opiskeluyhteys
- Nimi: Arienta RP Sudibya, M.Sc.
- Puhelinnumero: +628118113811
- Sähköposti: arientasudibya@seameo-recfon.org
Tutki yhteystietojen varmuuskopiointi
- Nimi: Nur L Zahra, M.Nutr.
- Puhelinnumero: +6285697754706
- Sähköposti: nurlailatuzzahra@gmail.com
Osallistumiskriteerit
Kelpoisuusvaatimukset
Opintokelpoiset iät
Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia
Sukupuolet, jotka voivat opiskella
Näytteenottomenetelmä
Tutkimusväestö
Kuvaus
Sisällyttämiskriteerit:
- iässä 18,0 - 23,9 kuukautta
- ilman vakavia sairauksia
- äiti synnytti 18-40-vuotiaat lapset
- hänellä on sasak-etninen alkuperä, (5) makuuasennon pituus <-2SD (kitukasvuiselle ryhmälle) ja >-1SD (ei-stunted ryhmälle) WHO:n lasten kasvustandardien mediaanien mukaan heidän ikänsä ja sukupuolensa rekrytointihetkellä.
Poissulkemiskriteerit:
- kaksosten syntymä
- synnynnäinen epämuodostuma
- verisukulaisuus
Opintosuunnitelma
Miten tutkimus on suunniteltu?
Suunnittelun yksityiskohdat
Kohortit ja interventiot
Ryhmä/Kohortti |
---|
Kitukasvuinen (tapaus)
Tapausryhmässä rekrytoidaan kitukasvuisia lapsia (<-2SD) (n=150).
|
Ei-kitukasvuinen (ohjaus)
Vertailuryhmässä rekrytoidaan ei-kitukasvuisia lapsia (>-1SD) (n=150).
|
Mitä tutkimuksessa mitataan?
Ensisijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
---|---|---|
Stuntingiin liittyvä epigenetiikka
Aikaikkuna: ilmoittautumisen yhteydessä
|
Epigeneettisten tilojen analyysi (DNA-metylaatio) suoritetaan käyttämällä Illumina Infinium Methylation EPIC V.2.0 BeadChipiä, jota täydennetään sekvensointimenetelmillä, jotta saadaan sekä genomin kattava kattavuus että teräväpiirtoanalyysi.
Epigeneettinen tila säätelee geenien ilmentymistä ja yleistä genomin säätelyä mittakaavassa, ja tutkimus keskittyy ehdokasepigeneettisiin tiloihin, jotka liittyvät stuntingiin ja sen seurauksiin epigenomin laajuisen assosioinnin ohella.
|
ilmoittautumisen yhteydessä
|
Toissijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
---|---|---|
Lapsen synnytystulokset (psykologien toimesta)
Aikaikkuna: ilmoittautumisen yhteydessä
|
Koulutetut psykologit arvioivat kognitiivista kehitystä käyttämällä täydellisiä Bayley Scales of Infant and Toddler Development -asteikkoja (BSID-4). BSID-4 koostuu: Cognitive Scale (COG); Language Scale (LANG) ja Motoric Scale (MOT). Kunkin asteikon standardipistemäärä (SS) on 40-160, jossa korkeampi pistemäärä tarkoittaa parempaa. |
ilmoittautumisen yhteydessä
|
Lapsen kognition tulokset (hoitajan raportoitu)
Aikaikkuna: ilmoittautumisen yhteydessä
|
Kognitiivista kehitystä arvioidaan käyttämällä hoitajan raportoimaa työkalua, eli INTERGROWTH-21st Neurodevelopment -arviointia INTER-NDA:n koulutettujen luetteloijien toimesta. INTER-NDA koostuu: Kognitiivinen; Hieno moottori; Brutto moottori; Kieli; Positiivinen käyttäytyminen; Negatiivinen käyttäytyminen. Kunkin asteikon pistemäärä on 0 - 100, jossa korkeampi pistemäärä tarkoittaa parempaa. |
ilmoittautumisen yhteydessä
|
Suoliston mikrobiomi
Aikaikkuna: ilmoittautumisen yhteydessä
|
Ulosteen mikrobiomi analysoitaisiin käyttämällä Illumina MiSeqin ja BSAS:n V4-alueen 16S-RNA-sekvensointia.
|
ilmoittautumisen yhteydessä
|
Yhteistyökumppanit ja tutkijat
Tutkijat
- Päätutkija: Umi Fahmida, Dr., SEAMEO RECFON
Julkaisuja ja hyödyllisiä linkkejä
Yleiset julkaisut
- Walker SP, Chang SM, Powell CA, Simonoff E, Grantham-McGregor SM. Early childhood stunting is associated with poor psychological functioning in late adolescence and effects are reduced by psychosocial stimulation. J Nutr. 2007 Nov;137(11):2464-9. doi: 10.1093/jn/137.11.2464.
- Hoddinott J, Behrman JR, Maluccio JA, Melgar P, Quisumbing AR, Ramirez-Zea M, Stein AD, Yount KM, Martorell R. Adult consequences of growth failure in early childhood. Am J Clin Nutr. 2013 Nov;98(5):1170-8. doi: 10.3945/ajcn.113.064584. Epub 2013 Sep 4.
- Olofin I, McDonald CM, Ezzati M, Flaxman S, Black RE, Fawzi WW, Caulfield LE, Danaei G; Nutrition Impact Model Study (anthropometry cohort pooling). Associations of suboptimal growth with all-cause and cause-specific mortality in children under five years: a pooled analysis of ten prospective studies. PLoS One. 2013 May 29;8(5):e64636. doi: 10.1371/journal.pone.0064636. Print 2013.
- Sudfeld CR, McCoy DC, Danaei G, Fink G, Ezzati M, Andrews KG, Fawzi WW. Linear growth and child development in low- and middle-income countries: a meta-analysis. Pediatrics. 2015 May;135(5):e1266-75. doi: 10.1542/peds.2014-3111. Epub 2015 Apr 6.
- Cryan JF, Dinan TG. Mind-altering microorganisms: the impact of the gut microbiota on brain and behaviour. Nat Rev Neurosci. 2012 Oct;13(10):701-12. doi: 10.1038/nrn3346. Epub 2012 Sep 12.
- Stephenson LS, Latham MC, Ottesen EA. Malnutrition and parasitic helminth infections. Parasitology. 2000;121 Suppl:S23-38. doi: 10.1017/s0031182000006491.
- Haggarty P, Hoad G, Campbell DM, Horgan GW, Piyathilake C, McNeill G. Folate in pregnancy and imprinted gene and repeat element methylation in the offspring. Am J Clin Nutr. 2013 Jan;97(1):94-9. doi: 10.3945/ajcn.112.042572. Epub 2012 Nov 14.
- Masser DR, Stanford DR, Freeman WM. Targeted DNA methylation analysis by next-generation sequencing. J Vis Exp. 2015 Feb 24;(96):52488. doi: 10.3791/52488.
- MAL-ED Network Investigators. Childhood stunting in relation to the pre- and postnatal environment during the first 2 years of life: The MAL-ED longitudinal birth cohort study. PLoS Med. 2017 Oct 25;14(10):e1002408. doi: 10.1371/journal.pmed.1002408. eCollection 2017 Oct.
- Qin J, Li R, Raes J, Arumugam M, Burgdorf KS, Manichanh C, Nielsen T, Pons N, Levenez F, Yamada T, Mende DR, Li J, Xu J, Li S, Li D, Cao J, Wang B, Liang H, Zheng H, Xie Y, Tap J, Lepage P, Bertalan M, Batto JM, Hansen T, Le Paslier D, Linneberg A, Nielsen HB, Pelletier E, Renault P, Sicheritz-Ponten T, Turner K, Zhu H, Yu C, Li S, Jian M, Zhou Y, Li Y, Zhang X, Li S, Qin N, Yang H, Wang J, Brunak S, Dore J, Guarner F, Kristiansen K, Pedersen O, Parkhill J, Weissenbach J; MetaHIT Consortium; Bork P, Ehrlich SD, Wang J. A human gut microbial gene catalogue established by metagenomic sequencing. Nature. 2010 Mar 4;464(7285):59-65. doi: 10.1038/nature08821.
- Aguilar-Farias N, Toledo-Vargas M, Miranda-Marquez S, Cortinez-O'Ryan A, Cristi-Montero C, Rodriguez-Rodriguez F, Martino-Fuentealba P, Okely AD, Del Pozo Cruz B. Sociodemographic Predictors of Changes in Physical Activity, Screen Time, and Sleep among Toddlers and Preschoolers in Chile during the COVID-19 Pandemic. Int J Environ Res Public Health. 2020 Dec 29;18(1):176. doi: 10.3390/ijerph18010176.
- Ansari I, Raddatz G, Gutekunst J, Ridnik M, Cohen D, Abu-Remaileh M, Tuganbaev T, Shapiro H, Pikarsky E, Elinav E, Lyko F, Bergman Y. The microbiota programs DNA methylation to control intestinal homeostasis and inflammation. Nat Microbiol. 2020 Apr;5(4):610-619. doi: 10.1038/s41564-019-0659-3. Epub 2020 Feb 3.
- Bosso M, Thanaraj TA, Abu-Farha M, Alanbaei M, Abubaker J, Al-Mulla F. The Two Faces of ACE2: The Role of ACE2 Receptor and Its Polymorphisms in Hypertension and COVID-19. Mol Ther Methods Clin Dev. 2020 Jun 25;18:321-327. doi: 10.1016/j.omtm.2020.06.017. eCollection 2020 Sep 11.
- Burchill E, Lymberopoulos E, Menozzi E, Budhdeo S, McIlroy JR, Macnaughtan J, Sharma N. The Unique Impact of COVID-19 on Human Gut Microbiome Research. Front Med (Lausanne). 2021 Mar 16;8:652464. doi: 10.3389/fmed.2021.652464. eCollection 2021.
- Campagna MP, Xavier A, Lechner-Scott J, Maltby V, Scott RJ, Butzkueven H, Jokubaitis VG, Lea RA. Epigenome-wide association studies: current knowledge, strategies and recommendations. Clin Epigenetics. 2021 Dec 4;13(1):214. doi: 10.1186/s13148-021-01200-8.
- Carroll N, Sadowski A, Laila A, Hruska V, Nixon M, Ma DWL, Haines J, On Behalf Of The Guelph Family Health Study. The Impact of COVID-19 on Health Behavior, Stress, Financial and Food Security among Middle to High Income Canadian Families with Young Children. Nutrients. 2020 Aug 7;12(8):2352. doi: 10.3390/nu12082352.
- Development Initiatives (2018). 2018 Global Nutrition Report: Shining a light to spur action on nutrition. Bristol, UK: Development Initiatives.
- Development Initiatives Poverty Research. 2020. 2020 Global Nutrition Report: Action on equity to end malnutrition. Bristol, UK: Development Initiatives.
- Haggarty, P., K. Harrison and Haggarty (2017). Population Epigenetics, Springer.
- Hannon E, Schendel D, Ladd-Acosta C, Grove J, Hansen CS, Hougaard DM, Bresnahan M, Mors O, Hollegaard MV, Baekvad-Hansen M, Hornig M, Mortensen PB, Borglum AD, Werge T, Pedersen MG, Nordentoft M; iPSYCH-Broad ASD Group; Buxbaum JD, Daniele Fallin M, Bybjerg-Grauholm J, Reichenberg A, Mill J. Variable DNA methylation in neonates mediates the association between prenatal smoking and birth weight. Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci. 2019 Apr 15;374(1770):20180120. doi: 10.1098/rstb.2018.0120.
- Harpham T, Reichenheim M, Oser R, Thomas E, Hamid N, Jaswal S, Ludermir A, Aidoo M. Measuring mental health in a cost-effective manner. Health Policy Plan. 2003 Sep;18(3):344-9. doi: 10.1093/heapol/czg041.
- He J, Lu YP, Li J, Li TY, Chen X, Liang XJ, Chen WJ, Pi SN, Hocher B, Chen YP. Fetal But Not Maternal Angiotensin Converting Enzyme (ACE)-2 Gene Rs2074192 Polymorphism is Associated with Increased Risk of Being a Small For Gestational Age (SGA) Newborn. Kidney Blood Press Res. 2018;43(5):1596-1606. doi: 10.1159/000494449. Epub 2018 Oct 22.
- Huang M, Liu J, Liu K, Chen J, Wei Z, Feng Z, Wu Y, Fong M, Tian R, Wang B, Budjan C, Zhuang P, Wan G, Kong XJ. Microbiome-Specific Statistical Modeling Identifies Interplay Between Gastrointestinal Microbiome and Neurobehavioral Outcomes in Patients With Autism: A Case Control Study. Front Psychiatry. 2021 Oct 20;12:682454. doi: 10.3389/fpsyt.2021.682454. eCollection 2021.
- James P, Sajjadi S, Tomar AS, Saffari A, Fall CHD, Prentice AM, Shrestha S, Issarapu P, Yadav DK, Kaur L, Lillycrop K, Silver M, Chandak GR; EMPHASIS study group. Candidate genes linking maternal nutrient exposure to offspring health via DNA methylation: a review of existing evidence in humans with specific focus on one-carbon metabolism. Int J Epidemiol. 2018 Dec 1;47(6):1910-1937. doi: 10.1093/ije/dyy153.
- Littlejohn P, Finlay BB. When a pandemic and an epidemic collide: COVID-19, gut microbiota, and the double burden of malnutrition. BMC Med. 2021 Jan 28;19(1):31. doi: 10.1186/s12916-021-01910-z.
- Lima RS, Rocha LPC, Moreira PR. Genetic and epigenetic control of ACE2 expression and its possible role in COVID-19. Cell Biochem Funct. 2021 Aug;39(6):713-726. doi: 10.1002/cbf.3648. Epub 2021 Jun 1.
- Lozupone CA, Stombaugh J, Gonzalez A, Ackermann G, Wendel D, Vazquez-Baeza Y, Jansson JK, Gordon JI, Knight R. Meta-analyses of studies of the human microbiota. Genome Res. 2013 Oct;23(10):1704-14. doi: 10.1101/gr.151803.112. Epub 2013 Jul 16.
- Mansell G, Gorrie-Stone TJ, Bao Y, Kumari M, Schalkwyk LS, Mill J, Hannon E. Guidance for DNA methylation studies: statistical insights from the Illumina EPIC array. BMC Genomics. 2019 May 14;20(1):366. doi: 10.1186/s12864-019-5761-7.
- McArthur, BA., Browne, D., Tough, S., and Madigan, S. (2020). Trajectories of screen use during early childhood: Predictors and associated behavior and learning outcomes. Computers in Human Behavior 113: 106501.
- Miguel PM, Pereira LO, Silveira PP, Meaney MJ. Early environmental influences on the development of children's brain structure and function. Dev Med Child Neurol. 2019 Oct;61(10):1127-1133. doi: 10.1111/dmcn.14182. Epub 2019 Feb 11.
- Ministry of Health RI. 2021. Indonesia Nutritional Status Study 2021. (disseminated study through national event)
- Neumann, C., D. M. Harris and L. M. Rogers (2002). Contribution of animal source foods in improving diet quality and function in children in the developing world. Nutrition research 22(1-2): 193-220.
- Ngure FM, Reid BM, Humphrey JH, Mbuya MN, Pelto G, Stoltzfus RJ. Water, sanitation, and hygiene (WASH), environmental enteropathy, nutrition, and early child development: making the links. Ann N Y Acad Sci. 2014 Jan;1308:118-128. doi: 10.1111/nyas.12330.
- Noor N, Cardenas A, Rifas-Shiman SL, Pan H, Dreyfuss JM, Oken E, Hivert MF, James-Todd T, Patti ME, Isganaitis E. Association of Periconception Paternal Body Mass Index With Persistent Changes in DNA Methylation of Offspring in Childhood. JAMA Netw Open. 2019 Dec 2;2(12):e1916777. doi: 10.1001/jamanetworkopen.2019.16777.
- Nwosu BU, Lee MM. Evaluation of short and tall stature in children. Am Fam Physician. 2008 Sep 1;78(5):597-604.
- Osendarp, S., Akuoku, J.K., Black, R.E. et al. The COVID-19 crisis will exacerbate maternal and child undernutrition and child mortality in low- and middle-income countries. Nat Food 2, 476-484 (2021). https://doi.org/10.1038/s43016-021-00319-4
- Ozaltin E, Hill K, Subramanian SV. Association of maternal stature with offspring mortality, underweight, and stunting in low- to middle-income countries. JAMA. 2010 Apr 21;303(15):1507-16. doi: 10.1001/jama.2010.450.
- Rinninella E, Raoul P, Cintoni M, Franceschi F, Miggiano GAD, Gasbarrini A, Mele MC. What is the Healthy Gut Microbiota Composition? A Changing Ecosystem across Age, Environment, Diet, and Diseases. Microorganisms. 2019 Jan 10;7(1):14. doi: 10.3390/microorganisms7010014.
- Riskesdas (2018). Departemen Kesehatan Republik Indonesia, Laporan Hasil Riset Kesehatan Dasar Indonesia (Riskesdas) 2018. Jakarta, Republic of Indonesia.
- Robertson RC, Manges AR, Finlay BB, Prendergast AJ. The Human Microbiome and Child Growth - First 1000 Days and Beyond. Trends Microbiol. 2019 Feb;27(2):131-147. doi: 10.1016/j.tim.2018.09.008. Epub 2018 Oct 24.
- Stewart CP, Iannotti L, Dewey KG, Michaelsen KF, Onyango AW. Contextualising complementary feeding in a broader framework for stunting prevention. Matern Child Nutr. 2013 Sep;9 Suppl 2(Suppl 2):27-45. doi: 10.1111/mcn.12088.
- Tian Y, Morris TJ, Webster AP, Yang Z, Beck S, Feber A, Teschendorff AE. ChAMP: updated methylation analysis pipeline for Illumina BeadChips. Bioinformatics. 2017 Dec 15;33(24):3982-3984. doi: 10.1093/bioinformatics/btx513.
- UNICEF. COVID-19 and Children in Indonesia.An Agenda for Action to Address Socio-Economic Challenges. 11 May 2020
- Williams AM, Suchdev PS. Assessing and Improving Childhood Nutrition and Growth Globally. Pediatr Clin North Am. 2017 Aug;64(4):755-768. doi: 10.1016/j.pcl.2017.03.001.
- Ye J, Wu W, Li Y, Li L. Influences of the Gut Microbiota on DNA Methylation and Histone Modification. Dig Dis Sci. 2017 May;62(5):1155-1164. doi: 10.1007/s10620-017-4538-6. Epub 2017 Mar 24.
- Yu G, Wang LG, Han Y, He QY. clusterProfiler: an R package for comparing biological themes among gene clusters. OMICS. 2012 May;16(5):284-7. doi: 10.1089/omi.2011.0118. Epub 2012 Mar 28.
- Zemrani B, Gehri M, Masserey E, Knob C, Pellaton R. A hidden side of the COVID-19 pandemic in children: the double burden of undernutrition and overnutrition. Int J Equity Health. 2021 Jan 22;20(1):44. doi: 10.1186/s12939-021-01390-w.
Opintojen ennätyspäivät
Opi tärkeimmät päivämäärät
Opiskelun aloitus (Odotettu)
Ensisijainen valmistuminen (Odotettu)
Opintojen valmistuminen (Odotettu)
Opintoihin ilmoittautumispäivät
Ensimmäinen lähetetty
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Ensimmäinen Lähetetty (Todellinen)
Tutkimustietojen päivitykset
Viimeisin päivitys julkaistu (Todellinen)
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Viimeksi vahvistettu
Lisää tietoa
Tähän tutkimukseen liittyvät termit
Muita asiaankuuluvia MeSH-ehtoja
Muut tutkimustunnusnumerot
- AASH Early Year Study
Yksittäisten osallistujien tietojen suunnitelma (IPD)
Aiotko jakaa yksittäisten osallistujien tietoja (IPD)?
Lääke- ja laitetiedot, tutkimusasiakirjat
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää lääkevalmistetta
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää laitetuotetta
Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .
Kliiniset tutkimukset Stunting
-
Indonesia UniversityWyeth nutrition indonesiaValmisKasvu; Stunting, ravitsemusIndonesia
-
Danone Asia Pacific Holdings Pte, Ltd.KK Women's and Children's HospitalValmisKasvu; Stunting, ravitsemusSingapore
-
University of CopenhagenUniversity of Aarhus; Arla FoodsValmisKasvun kiihtyvyys | Kasvu; Stunting, ravitsemusTanska
-
International Centre for Diarrhoeal Disease Research...Department for International Development, United Kingdom; University of... ja muut yhteistyökumppanitValmisStunting alle 2-vuotiailla lapsillaBangladesh
-
Swiss Federal Institute of TechnologyBRAC University; HarvestPlusValmisSinkin puute | Kasvu; Stunting, ravitsemusSveitsi, Bangladesh
-
Andalas UniversityIndonesia UniversityValmisRuoansulatuskanavan mikrobiomi | Kasvu; Stunting, ravitsemus | Immunoglobuliini AIndonesia
-
University of WashingtonFrankel Family Foundation; Stewardship FoundationAktiivinen, ei rekrytointiImetys, eksklusiivinen | Rokotus; Infektio | Kasvu; Stunting, ravitsemusEtiopia
-
Johns Hopkins Bloomberg School of Public HealthEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human Development... ja muut yhteistyökumppanitValmisAnemia | Kasvu; Stunting, ravitsemusZimbabwe
-
Boston CollegeUnited States Agency for International Development (USAID); University of... ja muut yhteistyökumppanitValmisMasennus | Kognitiivinen muutos | Vanhemmuus | Käyttäytyminen | Väkivalta | Kieli | Kasvu; Stunting, ravitsemusRuanda
-
Swiss Tropical & Public Health InstituteBoston University; Innovations for Poverty ActionValmis