Metilación, microbioma, estado nutricional y desarrollo de niños con retraso en el crecimiento (MINUTES)
2 de julio de 2024 actualizado por: Dr.Umi Fahmida, SEAMEO Regional Centre for Food and Nutrition
Metilación del ADN, perfil del microbioma, estado nutricional y resultados del desarrollo de niños con y sin retraso del crecimiento que crecen durante la pandemia de Covid-19: un estudio de casos y controles
Los investigadores realizarán un estudio de casos y controles entre niños menores de dos años en Lombok Timur, West Nusa Tenggara, Indonesia.
El poder necesario para detectar cambios en los marcadores epigenéticos puede no ser suficiente en el estudio de cohortes.
Por lo tanto, el diseño específico de casos y controles de niños con retraso en el crecimiento frente a los que no tienen retraso en el crecimiento proporcionará la potencia necesaria para detectar posibles marcadores epigenéticos que se investigarán más a fondo a través de la secuenciación específica del estudio de cohortes.
Se reclutará un total de 150 niños con retraso en el crecimiento y luego se emparejará con 150 niños sin retraso en el crecimiento del mismo sexo.
Las evaluaciones para estos sujetos de estudio incluirán: 1) El perfil genético y epigenético de los niños, la microbiota intestinal y el estado nutricional (componente físico), 2) Seguridad alimentaria, agua, saneamiento e higiene (WASH) y alimentación del lactante y del niño pequeño ( IYCF) prácticas (componente Hogar-Alimentación), 3) Atención psicosocial infantil y resultado cognitivo (componente Cognición).
Descripción general del estudio
Estado
Activo, no reclutando
Descripción detallada
Este estudio es parte de Action Against Stunting Hub, un estudio observacional de cohortes destinado a generar evidencia basada en la exploración de los impulsores del retraso en el crecimiento desde diferentes perspectivas y comprender el impacto de diferentes intervenciones en tres países: India, Indonesia y Senegal.
Este estudio tiene como objetivo brindar una descripción general del retraso del crecimiento y sus determinantes entre los niños menores de dos años que crecieron durante el período de la pandemia de Covid-19 en Lombok Timur, Nusa Tenggara Barat, Indonesia.
Debido a que el poder necesario para detectar cambios en los marcadores epigenéticos puede no ser suficiente en el estudio de cohortes, este diseño de casos y controles específico de niños con retraso del crecimiento frente a niños sin retraso del crecimiento también proporcionará el poder necesario para detectar posibles marcadores epigenéticos que se investigarán más a fondo a través de secuenciación dirigida del estudio de cohorte.
Se prevé que los resultados de este estudio inicial apoyen estudios posteriores, especialmente el estudio de observación de cohortes, para determinar los indicadores más adecuados para demostrar la interacción y/o los mecanismos causales del retraso del crecimiento.
Tipo de estudio
De observación
Inscripción (Estimado)
300
Contactos y Ubicaciones
Esta sección proporciona los datos de contacto de quienes realizan el estudio e información sobre dónde se lleva a cabo este estudio.
Ubicaciones de estudio
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Jakarta, Indonesia, 10430
- Seameo Recfon
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Criterios de participación
Los investigadores buscan personas que se ajusten a una determinada descripción, denominada criterio de elegibilidad. Algunos ejemplos de estos criterios son el estado de salud general de una persona o tratamientos previos.
Criterio de elegibilidad
Edades elegibles para estudiar
1 año a 1 año (Niño)
Acepta Voluntarios Saludables
Sí
Método de muestreo
Muestra no probabilística
Población de estudio
Se reclutará un total de 150 niños con retraso del crecimiento (caso) y luego se emparejará con 150 niños sin retraso del crecimiento (control) del mismo sexo.
Antes de la hora de la proyección, datos de niños de 18,0 a 23,9 años
Se enumerarán los meses desde Posyandu.
El equipo de campo se coordinará con las parteras para informar a los niños y a su tutor que se hagan la prueba.
La evaluación de los criterios de elegibilidad se realizará para todos los niños de 18,0 a 23,9 años.
meses que ha indicado en la visita anterior.
La medición de la longitud de los niños y la lista de verificación de los criterios de elegibilidad se realizarán durante el tiempo de selección por enumeradores capacitados.
Después de cumplir con los criterios de elegibilidad, los empadronadores deben determinar los niños emparejados en función de su género.
Descripción
Criterios de inclusión:
- edad 18.0 - 23.9 meses
- sin enfermedades graves
- la madre dio a luz a los niños entre 18 y 40 años de edad
- tiene etnia Sasak, (5) longitud recostada <-2SD (para el grupo con retraso en el crecimiento) y >-1SD (para el grupo sin retraso en el crecimiento) de la mediana de los patrones de crecimiento infantil de la OMS para su edad y sexo en el momento del reclutamiento.
Criterio de exclusión:
- nacimiento de gemelos
- malformación congénita
- consanguinidad
Plan de estudios
Esta sección proporciona detalles del plan de estudio, incluido cómo está diseñado el estudio y qué mide el estudio.
¿Cómo está diseñado el estudio?
Detalles de diseño
Cohortes e Intervenciones
Grupo / Cohorte |
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Atrofiado (Caso)
En el grupo de casos, se reclutarán niños con retraso del crecimiento (<-2SD) (n=150).
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Sin retraso en el crecimiento (Control)
En el grupo de control, se reclutarán niños sin retraso en el crecimiento (>-1SD) (n = 150).
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¿Qué mide el estudio?
Medidas de resultado primarias
Medida de resultado |
Medida Descripción |
Periodo de tiempo |
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Firma epigenética relacionada con el retraso del crecimiento
Periodo de tiempo: en la inscripción
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El análisis de los estados epigenéticos (metilación del ADN) se llevará a cabo utilizando Illumina Infinium Methylation EPIC V.2.0 BeadChip, aumentado con metodologías de secuenciación para proporcionar una amplia cobertura del genoma y un análisis de alta definición.
El estado epigenético controla la expresión génica y la regulación general del genoma a escala y el estudio se centrará en los estados epigenéticos candidatos implicados en el retraso en el crecimiento y sus corolarios junto con la asociación amplia del epigenoma.
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en la inscripción
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Medidas de resultado secundarias
Medida de resultado |
Medida Descripción |
Periodo de tiempo |
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Resultados de cognición infantil (por psicólogos)
Periodo de tiempo: en la inscripción
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Psicólogos capacitados evaluarán el desarrollo cognitivo utilizando las escalas completas de desarrollo de bebés y niños pequeños de Bayley (BSID-4). BSID-4 consta de: Escala Cognitiva (COG); Escala de Lenguaje (LANG) y Escala Motora (MOT). El rango de puntuación estándar (SS) de cada escala es de 40 a 160, en el que una puntuación más alta significa mejor. |
en la inscripción
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Resultados de la cognición del niño (informados por el cuidador)
Periodo de tiempo: en la inscripción
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El desarrollo cognitivo se evaluará utilizando la herramienta informada por el cuidador, es decir, INTERGROWTH-21st Evaluación del desarrollo neurológico INTER-NDA por enumeradores capacitados. INTER-NDA consta de: Cognitivo; Buen motor; motricidad gruesa; Idioma; Comportamiento positivo; Comportamiento negativo. El rango de puntuación en cada escala es de 0 a 100, en el que una puntuación más alta significa mejor. |
en la inscripción
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Microbioma intestinal
Periodo de tiempo: en la inscripción
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El microbioma fecal se analizaría mediante secuenciación de ARN 16S de la región V4 en la plataforma Illumina MiSeq
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en la inscripción
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Colaboradores e Investigadores
Aquí es donde encontrará personas y organizaciones involucradas en este estudio.
Patrocinador
Investigadores
- Investigador principal: Umi Fahmida, Dr., Seameo Recfon
Publicaciones y enlaces útiles
La persona responsable de ingresar información sobre el estudio proporciona voluntariamente estas publicaciones. Estos pueden ser sobre cualquier cosa relacionada con el estudio.
Publicaciones Generales
- Walker SP, Chang SM, Powell CA, Simonoff E, Grantham-McGregor SM. Early childhood stunting is associated with poor psychological functioning in late adolescence and effects are reduced by psychosocial stimulation. J Nutr. 2007 Nov;137(11):2464-9. doi: 10.1093/jn/137.11.2464.
- Hoddinott J, Behrman JR, Maluccio JA, Melgar P, Quisumbing AR, Ramirez-Zea M, Stein AD, Yount KM, Martorell R. Adult consequences of growth failure in early childhood. Am J Clin Nutr. 2013 Nov;98(5):1170-8. doi: 10.3945/ajcn.113.064584. Epub 2013 Sep 4.
- Olofin I, McDonald CM, Ezzati M, Flaxman S, Black RE, Fawzi WW, Caulfield LE, Danaei G; Nutrition Impact Model Study (anthropometry cohort pooling). Associations of suboptimal growth with all-cause and cause-specific mortality in children under five years: a pooled analysis of ten prospective studies. PLoS One. 2013 May 29;8(5):e64636. doi: 10.1371/journal.pone.0064636. Print 2013.
- Sudfeld CR, McCoy DC, Danaei G, Fink G, Ezzati M, Andrews KG, Fawzi WW. Linear growth and child development in low- and middle-income countries: a meta-analysis. Pediatrics. 2015 May;135(5):e1266-75. doi: 10.1542/peds.2014-3111. Epub 2015 Apr 6.
- Cryan JF, Dinan TG. Mind-altering microorganisms: the impact of the gut microbiota on brain and behaviour. Nat Rev Neurosci. 2012 Oct;13(10):701-12. doi: 10.1038/nrn3346. Epub 2012 Sep 12.
- Stephenson LS, Latham MC, Ottesen EA. Malnutrition and parasitic helminth infections. Parasitology. 2000;121 Suppl:S23-38. doi: 10.1017/s0031182000006491.
- Haggarty P, Hoad G, Campbell DM, Horgan GW, Piyathilake C, McNeill G. Folate in pregnancy and imprinted gene and repeat element methylation in the offspring. Am J Clin Nutr. 2013 Jan;97(1):94-9. doi: 10.3945/ajcn.112.042572. Epub 2012 Nov 14.
- Masser DR, Stanford DR, Freeman WM. Targeted DNA methylation analysis by next-generation sequencing. J Vis Exp. 2015 Feb 24;(96):52488. doi: 10.3791/52488.
- MAL-ED Network Investigators. Childhood stunting in relation to the pre- and postnatal environment during the first 2 years of life: The MAL-ED longitudinal birth cohort study. PLoS Med. 2017 Oct 25;14(10):e1002408. doi: 10.1371/journal.pmed.1002408. eCollection 2017 Oct.
- Qin J, Li R, Raes J, Arumugam M, Burgdorf KS, Manichanh C, Nielsen T, Pons N, Levenez F, Yamada T, Mende DR, Li J, Xu J, Li S, Li D, Cao J, Wang B, Liang H, Zheng H, Xie Y, Tap J, Lepage P, Bertalan M, Batto JM, Hansen T, Le Paslier D, Linneberg A, Nielsen HB, Pelletier E, Renault P, Sicheritz-Ponten T, Turner K, Zhu H, Yu C, Li S, Jian M, Zhou Y, Li Y, Zhang X, Li S, Qin N, Yang H, Wang J, Brunak S, Dore J, Guarner F, Kristiansen K, Pedersen O, Parkhill J, Weissenbach J; MetaHIT Consortium; Bork P, Ehrlich SD, Wang J. A human gut microbial gene catalogue established by metagenomic sequencing. Nature. 2010 Mar 4;464(7285):59-65. doi: 10.1038/nature08821.
- Aguilar-Farias N, Toledo-Vargas M, Miranda-Marquez S, Cortinez-O'Ryan A, Cristi-Montero C, Rodriguez-Rodriguez F, Martino-Fuentealba P, Okely AD, Del Pozo Cruz B. Sociodemographic Predictors of Changes in Physical Activity, Screen Time, and Sleep among Toddlers and Preschoolers in Chile during the COVID-19 Pandemic. Int J Environ Res Public Health. 2020 Dec 29;18(1):176. doi: 10.3390/ijerph18010176.
- Ansari I, Raddatz G, Gutekunst J, Ridnik M, Cohen D, Abu-Remaileh M, Tuganbaev T, Shapiro H, Pikarsky E, Elinav E, Lyko F, Bergman Y. The microbiota programs DNA methylation to control intestinal homeostasis and inflammation. Nat Microbiol. 2020 Apr;5(4):610-619. doi: 10.1038/s41564-019-0659-3. Epub 2020 Feb 3.
- Bosso M, Thanaraj TA, Abu-Farha M, Alanbaei M, Abubaker J, Al-Mulla F. The Two Faces of ACE2: The Role of ACE2 Receptor and Its Polymorphisms in Hypertension and COVID-19. Mol Ther Methods Clin Dev. 2020 Jun 25;18:321-327. doi: 10.1016/j.omtm.2020.06.017. eCollection 2020 Sep 11.
- Burchill E, Lymberopoulos E, Menozzi E, Budhdeo S, McIlroy JR, Macnaughtan J, Sharma N. The Unique Impact of COVID-19 on Human Gut Microbiome Research. Front Med (Lausanne). 2021 Mar 16;8:652464. doi: 10.3389/fmed.2021.652464. eCollection 2021.
- Campagna MP, Xavier A, Lechner-Scott J, Maltby V, Scott RJ, Butzkueven H, Jokubaitis VG, Lea RA. Epigenome-wide association studies: current knowledge, strategies and recommendations. Clin Epigenetics. 2021 Dec 4;13(1):214. doi: 10.1186/s13148-021-01200-8.
- Carroll N, Sadowski A, Laila A, Hruska V, Nixon M, Ma DWL, Haines J, On Behalf Of The Guelph Family Health Study. The Impact of COVID-19 on Health Behavior, Stress, Financial and Food Security among Middle to High Income Canadian Families with Young Children. Nutrients. 2020 Aug 7;12(8):2352. doi: 10.3390/nu12082352.
- Development Initiatives (2018). 2018 Global Nutrition Report: Shining a light to spur action on nutrition. Bristol, UK: Development Initiatives.
- Development Initiatives Poverty Research. 2020. 2020 Global Nutrition Report: Action on equity to end malnutrition. Bristol, UK: Development Initiatives.
- Haggarty, P., K. Harrison and Haggarty (2017). Population Epigenetics, Springer.
- Hannon E, Schendel D, Ladd-Acosta C, Grove J, Hansen CS, Hougaard DM, Bresnahan M, Mors O, Hollegaard MV, Baekvad-Hansen M, Hornig M, Mortensen PB, Borglum AD, Werge T, Pedersen MG, Nordentoft M; iPSYCH-Broad ASD Group; Buxbaum JD, Daniele Fallin M, Bybjerg-Grauholm J, Reichenberg A, Mill J. Variable DNA methylation in neonates mediates the association between prenatal smoking and birth weight. Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci. 2019 Apr 15;374(1770):20180120. doi: 10.1098/rstb.2018.0120.
- Harpham T, Reichenheim M, Oser R, Thomas E, Hamid N, Jaswal S, Ludermir A, Aidoo M. Measuring mental health in a cost-effective manner. Health Policy Plan. 2003 Sep;18(3):344-9. doi: 10.1093/heapol/czg041.
- He J, Lu YP, Li J, Li TY, Chen X, Liang XJ, Chen WJ, Pi SN, Hocher B, Chen YP. Fetal But Not Maternal Angiotensin Converting Enzyme (ACE)-2 Gene Rs2074192 Polymorphism is Associated with Increased Risk of Being a Small For Gestational Age (SGA) Newborn. Kidney Blood Press Res. 2018;43(5):1596-1606. doi: 10.1159/000494449. Epub 2018 Oct 22.
- Huang M, Liu J, Liu K, Chen J, Wei Z, Feng Z, Wu Y, Fong M, Tian R, Wang B, Budjan C, Zhuang P, Wan G, Kong XJ. Microbiome-Specific Statistical Modeling Identifies Interplay Between Gastrointestinal Microbiome and Neurobehavioral Outcomes in Patients With Autism: A Case Control Study. Front Psychiatry. 2021 Oct 20;12:682454. doi: 10.3389/fpsyt.2021.682454. eCollection 2021.
- James P, Sajjadi S, Tomar AS, Saffari A, Fall CHD, Prentice AM, Shrestha S, Issarapu P, Yadav DK, Kaur L, Lillycrop K, Silver M, Chandak GR; EMPHASIS study group. Candidate genes linking maternal nutrient exposure to offspring health via DNA methylation: a review of existing evidence in humans with specific focus on one-carbon metabolism. Int J Epidemiol. 2018 Dec 1;47(6):1910-1937. doi: 10.1093/ije/dyy153.
- Littlejohn P, Finlay BB. When a pandemic and an epidemic collide: COVID-19, gut microbiota, and the double burden of malnutrition. BMC Med. 2021 Jan 28;19(1):31. doi: 10.1186/s12916-021-01910-z.
- Lima RS, Rocha LPC, Moreira PR. Genetic and epigenetic control of ACE2 expression and its possible role in COVID-19. Cell Biochem Funct. 2021 Aug;39(6):713-726. doi: 10.1002/cbf.3648. Epub 2021 Jun 1.
- Lozupone CA, Stombaugh J, Gonzalez A, Ackermann G, Wendel D, Vazquez-Baeza Y, Jansson JK, Gordon JI, Knight R. Meta-analyses of studies of the human microbiota. Genome Res. 2013 Oct;23(10):1704-14. doi: 10.1101/gr.151803.112. Epub 2013 Jul 16.
- Mansell G, Gorrie-Stone TJ, Bao Y, Kumari M, Schalkwyk LS, Mill J, Hannon E. Guidance for DNA methylation studies: statistical insights from the Illumina EPIC array. BMC Genomics. 2019 May 14;20(1):366. doi: 10.1186/s12864-019-5761-7.
- McArthur, BA., Browne, D., Tough, S., and Madigan, S. (2020). Trajectories of screen use during early childhood: Predictors and associated behavior and learning outcomes. Computers in Human Behavior 113: 106501.
- Miguel PM, Pereira LO, Silveira PP, Meaney MJ. Early environmental influences on the development of children's brain structure and function. Dev Med Child Neurol. 2019 Oct;61(10):1127-1133. doi: 10.1111/dmcn.14182. Epub 2019 Feb 11.
- Ministry of Health RI. 2021. Indonesia Nutritional Status Study 2021. (disseminated study through national event)
- Neumann, C., D. M. Harris and L. M. Rogers (2002). Contribution of animal source foods in improving diet quality and function in children in the developing world. Nutrition research 22(1-2): 193-220.
- Ngure FM, Reid BM, Humphrey JH, Mbuya MN, Pelto G, Stoltzfus RJ. Water, sanitation, and hygiene (WASH), environmental enteropathy, nutrition, and early child development: making the links. Ann N Y Acad Sci. 2014 Jan;1308:118-128. doi: 10.1111/nyas.12330.
- Noor N, Cardenas A, Rifas-Shiman SL, Pan H, Dreyfuss JM, Oken E, Hivert MF, James-Todd T, Patti ME, Isganaitis E. Association of Periconception Paternal Body Mass Index With Persistent Changes in DNA Methylation of Offspring in Childhood. JAMA Netw Open. 2019 Dec 2;2(12):e1916777. doi: 10.1001/jamanetworkopen.2019.16777.
- Nwosu BU, Lee MM. Evaluation of short and tall stature in children. Am Fam Physician. 2008 Sep 1;78(5):597-604.
- Ozaltin E, Hill K, Subramanian SV. Association of maternal stature with offspring mortality, underweight, and stunting in low- to middle-income countries. JAMA. 2010 Apr 21;303(15):1507-16. doi: 10.1001/jama.2010.450.
- Rinninella E, Raoul P, Cintoni M, Franceschi F, Miggiano GAD, Gasbarrini A, Mele MC. What is the Healthy Gut Microbiota Composition? A Changing Ecosystem across Age, Environment, Diet, and Diseases. Microorganisms. 2019 Jan 10;7(1):14. doi: 10.3390/microorganisms7010014.
- Riskesdas (2018). Departemen Kesehatan Republik Indonesia, Laporan Hasil Riset Kesehatan Dasar Indonesia (Riskesdas) 2018. Jakarta, Republic of Indonesia.
- Robertson RC, Manges AR, Finlay BB, Prendergast AJ. The Human Microbiome and Child Growth - First 1000 Days and Beyond. Trends Microbiol. 2019 Feb;27(2):131-147. doi: 10.1016/j.tim.2018.09.008. Epub 2018 Oct 24.
- Stewart CP, Iannotti L, Dewey KG, Michaelsen KF, Onyango AW. Contextualising complementary feeding in a broader framework for stunting prevention. Matern Child Nutr. 2013 Sep;9 Suppl 2(Suppl 2):27-45. doi: 10.1111/mcn.12088.
- Tian Y, Morris TJ, Webster AP, Yang Z, Beck S, Feber A, Teschendorff AE. ChAMP: updated methylation analysis pipeline for Illumina BeadChips. Bioinformatics. 2017 Dec 15;33(24):3982-3984. doi: 10.1093/bioinformatics/btx513.
- UNICEF. COVID-19 and Children in Indonesia.An Agenda for Action to Address Socio-Economic Challenges. 11 May 2020
- Williams AM, Suchdev PS. Assessing and Improving Childhood Nutrition and Growth Globally. Pediatr Clin North Am. 2017 Aug;64(4):755-768. doi: 10.1016/j.pcl.2017.03.001.
- Ye J, Wu W, Li Y, Li L. Influences of the Gut Microbiota on DNA Methylation and Histone Modification. Dig Dis Sci. 2017 May;62(5):1155-1164. doi: 10.1007/s10620-017-4538-6. Epub 2017 Mar 24.
- Yu G, Wang LG, Han Y, He QY. clusterProfiler: an R package for comparing biological themes among gene clusters. OMICS. 2012 May;16(5):284-7. doi: 10.1089/omi.2011.0118. Epub 2012 Mar 28.
- Zemrani B, Gehri M, Masserey E, Knob C, Pellaton R. A hidden side of the COVID-19 pandemic in children: the double burden of undernutrition and overnutrition. Int J Equity Health. 2021 Jan 22;20(1):44. doi: 10.1186/s12939-021-01390-w.
- Osendarp S, Akuoku JK, Black RE, Headey D, Ruel M, Scott N, Shekar M, Walker N, Flory A, Haddad L, Laborde D, Stegmuller A, Thomas M, Heidkamp R. The COVID-19 crisis will exacerbate maternal and child undernutrition and child mortality in low- and middle-income countries. Nat Food. 2021 Jul;2(7):476-484. doi: 10.1038/s43016-021-00319-4. Epub 2021 Jul 19.
Fechas de registro del estudio
Estas fechas rastrean el progreso del registro del estudio y los envíos de resultados resumidos a ClinicalTrials.gov. Los registros del estudio y los resultados informados son revisados por la Biblioteca Nacional de Medicina (NLM) para asegurarse de que cumplan con los estándares de control de calidad específicos antes de publicarlos en el sitio web público.
Fechas importantes del estudio
Inicio del estudio (Actual)
5 de abril de 2023
Finalización primaria (Actual)
31 de diciembre de 2023
Finalización del estudio (Estimado)
1 de septiembre de 2024
Fechas de registro del estudio
Enviado por primera vez
6 de febrero de 2023
Primero enviado que cumplió con los criterios de control de calidad
9 de marzo de 2023
Publicado por primera vez (Actual)
22 de marzo de 2023
Actualizaciones de registros de estudio
Última actualización publicada (Actual)
3 de julio de 2024
Última actualización enviada que cumplió con los criterios de control de calidad
2 de julio de 2024
Última verificación
1 de julio de 2024
Más información
Términos relacionados con este estudio
Palabras clave
Términos MeSH relevantes adicionales
Otros números de identificación del estudio
- AASH Early Year Study
Plan de datos de participantes individuales (IPD)
¿Planea compartir datos de participantes individuales (IPD)?
NO
Información sobre medicamentos y dispositivos, documentos del estudio
Estudia un producto farmacéutico regulado por la FDA de EE. UU.
No
Estudia un producto de dispositivo regulado por la FDA de EE. UU.
No
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