MICROBIOTE INTESTINAL CHEZ LES ENFANTS ATTEINTS D'UNE MALADIE HÉPATIQUE AUTO-IMMUNE ET SON EFFET SUR LA RÉPONSE AU TRAITEMENT

But et objectif - Comparer le microbiote intestinal (rapport de dysbiose, diversité alpha et bêta, indice de Shannon) chez les enfants atteints d'une maladie hépatique auto-immune par rapport à ceux atteints de la maladie de Wilson, et étudier son influence sur la réponse au traitement chez les enfants atteints d'une maladie hépatique auto-immune.

(b) Méthodologie :

• Population étudiée : Cohorte de maladies : enfants présentant des signes de maladie hépatique chronique avec maladie hépatique auto-immune et maladie de Wilson (atteinte hépatique) âgés de moins de 18 ans.
• Cohorte témoin : enfants en bonne santé de même âge âgés de moins de 18 ans avec conception de l'étude : étude observationnelle prospective
• Période d'étude : Du moment de l'approbation éthique jusqu'en juin 2025

Selles pour le séquençage de l'ARNr 16S : des échantillons de selles fraîches seront collectés auprès des sujets de l'étude et des témoins. Les échantillons de selles seront livrés au laboratoire dans des récipients en plastique stériles à 4°C et conservés à -80°C jusqu'à une analyse plus approfondie. L'ADN amplifié sera séquencé dans la plateforme de séquençage de nouvelle génération. Les données de séquence seraient traitées à l’aide d’un pipeline d’analyse standardisé. En bref, les séquences seraient jointes, dépourvues de codes-barres, les séquences <150 pb et celles avec des appels de base ambigus seraient supprimées. Les séquences seraient débruitées, les unités taxonomiques opérationnelles (OTU) générées et les chimères supprimées. Le microbiome intestinal sera étudié par séquençage métagénomique du génome entier (WGSM). Par détection de gènes bactériens pour les enzymes métaboliques digestives des taxons présents, les capacités métaboliques et la production potentielle de métabolites. par le microbiome intestinal sera prédit. Les séquences seraient débruitées, les unités taxonomiques opérationnelles (OTU) générées et les chimères supprimées. Le microbiome intestinal sera étudié par séquençage métagénomique du génome entier (WGSM). Par détection de gènes bactériens pour les enzymes digestives métaboliques de les taxons présents, les capacités métaboliques et la production potentielle de métabolites par le microbiome intestinal seront prédites.

• Surveillance et évaluation : les enfants présentant des signes de maladie hépatique chronique avec maladie hépatique auto-immune et maladie de Wilson (atteinte hépatique) seront inclus. Cohorte témoin : l'âge, le sexe et le statut socio-économique correspondent aux enfants en bonne santé de moins de 18 ans atteints de TNF-alpha. , IL-6, endotoxine plasmatique, CRP, procalcitonine, aspiration duodénale pour culture afin d'identifier la prolifération bactérienne. Des échantillons de selles seront collectés au départ chez les patients atteints d'AILD, de Wilson et de témoins sains. Les patients AILD seront démarrés sous traitement par Prednisolone 1 mg/kg/jour avec Azathioprine 1 mg/kg/jour et des échantillons de selles d'entre eux seront collectés à à la fin, vous voyez la réponse à l'immunosuppression Difficile à traiter l'AILD (qui sera définie Échec de la normalisation de l'AST/ALT dans un délai de 1,5 fois ou échec de la normalisation des IgG dans les 6 mois. )

ANALYSES STATISTIQUES:

• Les variables catégorielles et continues seront exprimées respectivement en fréquences et en moyenne ou médiane ± SD. Le test du chi carré et le test t de Student (test exact de Fisher) seront appliqués pour l'évaluation de la causalité. La corrélation entre 2 variables continues sera évaluée selon la corrélation de Spearman. La signification statistique sera mentionnée comme une valeur p <0,05, un rapport de cotes et des intervalles de confiance à 95 % (IC à 95 %). Pour les données métagénomiques, en l'absence de catalogue de gènes pour la population étudiée, nous étudierons les données métagénomiques dans les 10 premiers AILD, 5 Wilson et 5 contrôles,].