TARMMIKROBIOTA HOS BØRN MED AUTOIMMUN LEVERSYGDOM OG DETS EFFEKT PÅ BEHANDLINGSRESPONS

Formål og mål - At sammenligne tarmmikrobiotaen (dysbioseforhold, alfa- og beta-diversitet, Shannon-indeks) hos børn med autoimmun leversygdom versus dem med Wilsons sygdom, og studere dens indflydelse på respons på behandling hos børn med autoimmun leversygdom.

(b) Metode:

• Undersøgelsespopulation: Sygdomskohorte: Børn med tegn på kronisk leversygdom med autoimmun leversygdom og Wilsons sygdom (leverpåvirkning) under 18 år
• Kontrolkohorte: Aldersmatchede raske børn under 18 år med Studiedesign: Prospektiv observationsundersøgelse
• Studieperiode: Fra tidspunktet for etisk godkendelse til juni 2025

Afføring til 16S r-RNA-sekventering: Friske afføringsprøver vil blive indsamlet fra forsøgspersoner og kontroller. Afføringsprøver vil blive leveret til laboratoriet i sterile plastikbeholdere ved 4°C og opbevaret ved -80°C indtil videre analyse. Det amplificerede DNA vil blive sekventeret i næste generations sekventeringsplatform. Sekvensdata vil blive behandlet ved hjælp af standardiseret analysepipeline. Kort fortalt ville sekvenser blive sammenføjet, udtømt for stregkoder, sekvenser <150bp og dem med tvetydige basekald ville blive fjernet. Sekvenser vil blive denoiseret, operationelle taksonomiske enheder (OTU'er) genereret og kimærer fjernet. Tarmmikrobiomet vil blive undersøgt ved hele genomet shotgun metagenomisk sekventering (WGSM). Ved påvisning af bakterielle gener for metaboliske fordøjelsesenzymer af tilstedeværende taxa, metaboliske kapaciteter og potentiel produktion af metabolitter af tarmmikrobiomet vil blive forudsagt. Sekvenser ville blive denoiseret, operationelle taksonomiske enheder (OTU'er) genereret og kimærer fjernet. Tarmmikrobiomet vil blive studeret ved hele genomet shotgun metagenomisk sekventering (WGSM). Ved påvisning af bakterielle gener for metaboliske fordøjelsesenzymer tilstedeværende taxa, metaboliske kapaciteter og potentiel produktion af metabolitter af tarmmikrobiomet vil blive forudsagt.

• Monitorering og vurdering: Børn med tegn på kronisk leversygdom med autoimmun leversygdom og Wilson sygdom (leverpåvirkning) vil blive inkluderet Kontrolkohorte: Alder, køn og socioøkonomisk status matchede raske børn under 18 år med TNF-alfa , IL-6, plasmaendotoksin, CRP, procalcitonin, duodenalspirat til dyrkning for at identificere bakteriel overvækst. Afføringsprøver vil blive indsamlet ved baseline hos patienter med AILD, Wilson og sunde kontroller. AILD-patienter vil blive startet på behandling med Prednisolon 1 mg/kg/dag sammen med Azathioprin 1 mg/kg/dag, og afføringsprøver af dem vil blive indsamlet kl. i slutningen ser du responsen på immunsuppression Svært at behandle AILD (som vil blive defineret Manglende normalisering af AST/ALT inden for 1,5 gange eller manglende normalisering af IgG inden for 6 måneder. )

STATISTISK ANALYSE:

• De kategoriske og kontinuerte variable vil blive udtrykt som henholdsvis frekvenser og middelværdi eller median ±SD. Chi-square test og elevens t-test (Fishers eksakte test) vil blive anvendt til vurdering af kausalitet. Korrelation mellem 2 kontinuerte variable vil blive vurderet i henhold til Spearmans korrelation. Statistisk signifikans vil blive nævnt som p-værdi <0,05, og Odds ratio og 95% konfidensintervaller (95% CI). For metagenomiske data, i mangel af genkatalog for undersøgelsespopulationen, vil vi studere de metagenomiske data i de første 10 AILD, 5 Wilson og 5 kontroller].