TARMMIKROBIOTA HOS BARN MED AUTOIMMUN LEVERSYKDOM OG DENS EFFEKT PÅ BEHANDLINGSRESPONS

Mål og mål - Å sammenligne tarmmikrobiota (dysbioseforhold, alfa- og beta-diversitet, Shannon-indeks) hos barn med autoimmun leversykdom versus de med Wilsons sykdom, og studere dens innflytelse på respons på behandling hos barn med autoimmun leversykdom.

(b) Metodikk:

• Studiepopulasjon: Sykdomskohort: Barn med tegn på kronisk leversykdom med autoimmun leversykdom og Wilson sykdom (leverpåvirkning) under 18 år
• Kontrollkohort: Alderstilpasset friske barn under 18 år med studiedesign: prospektiv observasjonsstudie
• Studieperiode: Fra tidspunktet for etisk godkjenning til juni 2025

Avføring for 16S r-RNA-sekvensering: Ferske avføringsprøver vil bli samlet inn fra forsøkspersoner og kontroller. Avføringsprøver vil bli levert til laboratoriet i sterile plastbeholdere ved 4°C, og lagret ved -80°C inntil videre analyse. Det amplifiserte DNAet vil bli sekvensert i neste generasjons sekvenseringsplattform. Sekvensdata vil bli behandlet ved hjelp av standardisert analysepipeline. Kort fortalt vil sekvenser bli sammenføyd, tømt for strekkoder, sekvenser <150bp og de med tvetydige baseanrop vil bli fjernet. Sekvenser vil bli forringet, operasjonelle taksonomiske enheter (OTUs) generert og kimærer fjernet. Tarmmikrobiomet vil bli studert ved metagenomisk sekvensering av hele genomet hagle (WGSM). Ved påvisning av bakteriegener for metabolske fordøyelsesenzymer av tilstedeværende taxa, metabolske kapasiteter og potensiell produksjon av metabolitter av tarmmikrobiomet vil bli forutsagt. Sekvenser vil bli forringet, operasjonelle taksonomiske enheter (OTUs) generert og kimærer fjernet. Tarmmikrobiomet vil bli studert ved metagenomisk sekvensering av hele genomet (WGSM) .Ved påvisning av bakteriegener for metabolske fordøyelsesenzymer taxa tilstede, metabolske kapasiteter og potensiell produksjon av metabolitter av tarmmikrobiomet vil bli forutsagt.

• Overvåking og vurdering: Barn med tegn på kronisk leversykdom med autoimmun leversykdom og Wilson sykdom (leverpåvirkning) vil bli inkludert Kontrollkohort: Alder, kjønn og sosioøkonomisk status matchet friske barn under 18 år med TNF-alfa , IL-6, plasmaendotoksin, CRP, prokalsitonin, duodenalspirat for kultur for å identifisere bakteriell overvekst. Avføringsprøver vil bli tatt ved baseline i pasienter med AILD, Wilson og friske kontroller. AILD-pasienter vil bli startet på behandling med Prednisolon 1 mg/kg/dag sammen med Azatioprin 1 mg/kg/dag og avføringsprøver av dem vil bli tatt kl. på slutten ser du responsen på immunsuppresjon Vanskelig å behandle AILD (som vil bli definert Manglende normalisering av ASAT/ALT innen 1,5 ganger eller manglende normalisering av IgG innen 6 måneder. )

STATISTISK ANALYSE:

• De kategoriske og kontinuerlige variablene vil bli uttrykt som henholdsvis frekvenser og gjennomsnitt eller median ±SD. Chi-kvadratprøve og elevens t-test (Fishers eksakte test) vil bli brukt for vurdering av årsakssammenheng. Korrelasjon mellom 2 kontinuerlige variabler vil bli vurdert i henhold til Spearmans korrelasjon. Statistisk signifikans vil nevnes som p-verdi <0,05, og Odds ratio og 95 % konfidensintervall (95 % KI). For metagenomiske data, i fravær av genkatalog for studiepopulasjonen, vil vi studere de metagenomiske dataene i de første 10 AILD, 5 Wilson og 5 kontroller,].