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Prédire les résultats du traitement des MII grâce à l’analyse du microbiome intestinal (OPTIMIST)

15 janvier 2026 mis à jour par: Genelle Lunken, University of British Columbia

Optimisation du traitement des patients impliquant l'intégration du microbiome pour des thérapies spécialisées

Le but de cette étude observationnelle prospective est de déterminer si des signatures spécifiques du microbiome peuvent prédire les réponses thérapeutiques chez les patients adultes atteints de la maladie de Crohn (MC), une forme de maladie inflammatoire de l'intestin (MII), vivant en Colombie-Britannique, au Canada. Les principales questions auxquelles cette étude cherche à répondre sont :

  1. Les signatures du microbiome de différents types d’échantillons (lavages fécaux, intestinaux et biopsies épithéliales intestinales) peuvent-elles prédire la réponse au traitement de la MC ?
  2. Comment les profils de microbiome diffèrent-ils entre les contrôles CD actifs et au repos et les contrôles non-IBD ?

Les chercheurs compareront les signatures du microbiome chez les patients atteints de MC active et inactive ainsi que chez les témoins non atteints de MII pour voir s'il existe des signatures microbiennes qui prédisent la réponse au traitement.

Les participants :

  1. Fournir des échantillons de matières fécales et sanguines.
  2. Subir des lavages intestinaux et des échantillons de biopsie épithéliale intestinale prélevés lors d'une coloscopie de routine.
  3. Participer à un suivi longitudinal sur 12 mois pour surveiller les réponses cliniques, biochimiques et endoscopiques au traitement.

Aperçu de l'étude

Statut

Recrutement

Les conditions

Intervention / Traitement

Description détaillée

La maladie inflammatoire de l'intestin (MII) est une maladie inflammatoire chronique et récurrente affectant le tractus gastro-intestinal (GI). L'étude vise à évaluer les profils du microbiome (bactériome et mycobiome) sur trois types d'échantillons différents (lavages fécaux, intestinaux et biopsies épithéliales intestinales) dans une cohorte de patients adultes atteints de la maladie de Crohn (MC) vivant en Colombie-Britannique, au Canada, et enquêter si une signature microbienne peut prédire la réponse au traitement des MII.

Objectifs :

  1. Déterminez les signatures du microbiome, sur différents types d'échantillons, dans les maladies au repos et actives chez les patients atteints de MC vivant en Colombie-Britannique, au Canada.
  2. Évaluez si les signatures du microbiome de la biopsie épithéliale fécale, muqueuse et/ou intestinale peuvent prédire la réponse au traitement.

Méthodes

Étudier le design:

Phase 1 : Une étude pilote transversale pour évaluer le microbiome chez les patients atteints de MII (avec maladie active et quiescente) et chez les témoins non atteints de MII.

Résultat principal : Comparez les résultats des analyses microbiennes (y compris le bactériome et le mycobiome) sur trois types d'échantillons différents : lavages intestinaux et échantillons de biopsie épithéliale intestinale prélevés lors de la coloscopie, ainsi que des échantillons fécaux.

Résultats secondaires : Étudier les corrélations entre les analyses microbiennes sur différents types d'échantillons et l'activité de la maladie dans la MC. Comparez la différence dans les analyses microbiennes au sein de chaque type d’échantillon entre les patients atteints de MC active et au repos ainsi que les patients non atteints de MII. Rechercher si la composition et la fonction du microbiome fécal 2 semaines après la préparation intestinale sont comparables au microbiome fécal de préparation pré-intestinale dans un sous-ensemble de patients atteints de MC.

Phase 2 : Une étude observationnelle longitudinale avec un suivi de 12 mois.

Résultat principal : identifier s'il existe des signatures microbiennes qui prédisent la réponse au traitement chez les patients atteints d'une maladie active nécessitant un traitement intensifié, évalués cliniquement et biochimiquement après l'induction (12-16 semaines) et à 12 mois (+/- 3 mois).

Résultats secondaires : Comparez la sensibilité et la spécificité des analyses microbiennes de chaque type d'échantillon pour prédire la réponse au traitement.

Type d'étude

Observationnel

Inscription (Estimé)

100

Contacts et emplacements

Cette section fournit les coordonnées de ceux qui mènent l'étude et des informations sur le lieu où cette étude est menée.

Coordonnées de l'étude

Sauvegarde des contacts de l'étude

Lieux d'étude

  • Canada
    • British Columbia
      • Vancouver, British Columbia, Canada, V6Z 2K5
        • Recrutement
        • GI Research Institute
        • Contact:
          • Pedram Tavakoli, BSc
        • Contact:
          • Micah Ten-Pow, BSc

Critères de participation

Les chercheurs recherchent des personnes qui correspondent à une certaine description, appelée critères d'éligibilité. Certains exemples de ces critères sont l'état de santé général d'une personne ou des traitements antérieurs.

Critère d'éligibilité

Âges éligibles pour étudier

  • Adulte
  • Adulte plus âgé

Accepte les volontaires sains

Oui

Méthode d'échantillonnage

Échantillon de probabilité

Population étudiée

Les enquêteurs visent à ce que 75 patients atteints de MC terminent les phases 1 et 2, et 25 témoins non atteints de MII pour terminer la phase 1 uniquement.

Le regroupement des patients pour le recrutement est le suivant :

Groupe 1 : 25 MC en rémission endoscopique (score SES-CD < 3) Groupe 2 : 25 MC avec maladie endoscopiquement active modérée à sévère (score SES-CD ≥ 7 ou ≥ 4 pour MC iléale isolée et au moins un ulcère volumineux (≥ 5 mm)) Groupe 3 : 25 MC avec une maladie légèrement active au niveau endoscopique (SES-CD de 3 à 6, ou 3 avec MC iléale isolée, sans gros ulcères (≥ 5 mm)) Groupe 4 : 25 ans, non-MII de même sexe contrôles.

La description

Critère d'intégration:

Patients atteints de MC

  • Patients adultes ≥19 ans et ≤ 80 ans.
  • MC avec atteinte distale de l'intestin grêle et/ou du côlon évaluable par endoscopie par coloscopie
  • Subir une coloscopie dans le cadre des soins cliniques de routine
  • Maladie active ou quiescente
  • La maladie active sera définie comme un simple score endoscopique pour la MC (SES-CD) ≥7 ou ≥4 pour la MC iléale isolée et au moins un gros ulcère (≥5 mm)
  • La maladie quiescente est définie comme un SES-CD <3.

Contrôles non liés aux MII

  • Patients adultes ≥ 19 ans et ≤ 80 ans.
  • Subir une coloscopie dans le cadre d'un dépistage colorectal

Critère d'exclusion:

Patients atteints de MC

  • CD périanale active - définie comme une collection sur IRM ou une fistule cliniquement active (c'est-à-dire une fistule drainante)
  • Intestin grêle proximal (défini comme non évaluable par endoscopie par coloscopie) ou CD gastro-intestinal supérieur isolé
  • Antibiotiques au cours des 3 derniers mois pour toute indication
  • Suppléments prébiotiques, probiotiques ou postbiotiques au cours du dernier mois
  • Gastroentérite ou voyage à l'extérieur du Canada et des États-Unis au cours du dernier mois
  • Cancer colorectal, dysplasie de haut grade ou polype ≥ 2 cm diagnostiqués lors de l'endoscopie initiale
  • Enceinte ou allaitante
  • Résection intestinale dans les 4 mois précédents
  • Cholangite sclérosante primitive

Contrôles non liés aux MII

  • Trouvé une inflammation (considérée par l'endoscopiste) lors de la coloscopie.
  • Antécédents de MII chez un parent du 1er degré.
  • Antibiotiques au cours des 3 derniers mois.
  • Suppléments prébiotiques, probiotiques ou postbiotiques au cours du dernier mois.
  • Gastroentérite ou voyage à l’extérieur du Canada et des États-Unis au cours du dernier mois.
  • Enceinte ou allaitante.
  • Chirurgies intestinales antérieures.

Plan d'étude

Cette section fournit des détails sur le plan d'étude, y compris la façon dont l'étude est conçue et ce que l'étude mesure.

Comment l'étude est-elle conçue ?

Détails de conception

Cohortes et interventions

Groupe / Cohorte
Intervention / Traitement
Patients atteints de la maladie de Crohn
L'étude inclura 75 patients consentants atteints de la maladie de Crohn, avec des niveaux de gravité variables selon le score SES-CD attribué par leur gastro-entérologue. Ces patients subiront une coloscopie de routine conformément à leur suivi médical habituel, cette étude ne nécessitant pas d'engagement de planification supplémentaire. Des échantillons de sang, de lavage muqueux et de biopsie intestinale seront prélevés pendant la coloscopie de routine. Le patient aura la possibilité de collecter un échantillon de selles la veille de sa coloscopie et de l'apporter à son rendez-vous. Il recevra également un kit de prélèvement lors de son rendez-vous pour collecter le prochain échantillon de selles requis deux semaines après sa coloscopie.
Procédure: Coloscopie
Une coloscopie sera réalisée dans le cadre des soins cliniques de routine pour tous les participants, l'étude ne nécessitant aucun engagement de planification supplémentaire en dehors des soins de routine.
Patients sans maladie inflammatoire de l'intestin
L'étude inclura 25 témoins appariés pour l'âge et le sexe sans MICI pour comparer les données aux côtés des patients atteints de MC. Ces patients subiront une coloscopie de routine conformément à leur programme normal de dépistage du côlon, cette étude ne nécessitant pas d'engagements de planification supplémentaires. Des échantillons de sang, de lavage muqueux et de biopsie intestinale seront prélevés lors de la procédure de coloscopie de routine. Le patient aura la possibilité de collecter un échantillon de selles la veille de sa coloscopie et de l'apporter à son rendez-vous. Il recevra également un kit de prélèvement d'échantillons lors de son rendez-vous pour collecter son prochain échantillon de selles requis deux semaines après son examen endoscopique.
Procédure: Coloscopie
Une coloscopie sera réalisée dans le cadre des soins cliniques de routine pour tous les participants, l'étude ne nécessitant aucun engagement de planification supplémentaire en dehors des soins de routine.

Que mesure l'étude ?

Principaux critères de jugement

Mesure des résultats
Description de la mesure
Délai
Comparez les résultats des analyses microbiennes (y compris le bactériome et le mycobiome) sur trois types d'échantillons différents : les lavages intestinaux et les échantillons de biopsie épithéliale intestinale prélevés lors de la coloscopie ainsi que les échantillons fécaux.
Délai: 24mois

Les analyses microbiennes qui seront entreprises pour chaque type d’échantillon sont les suivantes :

Tabouret:

  • Métagénomique (Séquençage Shotgun, Séquençage ITS pour l'analyse fongique)
  • Métaprotéomique et métabolomique (analyse des protéines de l'hôte, microbiennes et alimentaires, analyse des métabolites microbiens)
  • Culture anaérobie (simuler l'environnement intestinal, utiliser des substrats alimentaires pour cibler les microbes clés)

Échantillons de biopsie :

  • Culture d'organoïdes (analyse de modèles intestinaux in vitro, analyse du microbiome épithélial, analyse de la production de mucine)
  • RNA-seq, transcriptomique (analyse du profilage de l'expression génique, identification des marqueurs de maladie)
  • Métagénomique
  • Métaprotéomique et métabolomique

Lavages intestinaux :

  • Analyse de mucine (analyse de glycoprotéine)
  • Métagénomique
  • Métaprotéomique et métabolomique
24mois
Chez les patients atteints de la maladie de Crohn active, pour lesquels une décision est prise d'intensifier le traitement après l'endoscopie d'indexation, identifiez s'il existe des signatures microbiennes qui prédisent une réponse soutenue au traitement à 12 mois (+/- 3 mois).
Délai: 24mois
  • Réponse clinique : poursuite ou amélioration des symptômes cliniques tels que mesurés par des systèmes de notation clinique standardisés (SES-CD).
  • Réponse biochimique : normalisation ou amélioration persistante des taux de CRP et de calprotectine fécale.
  • Réponse endoscopique : amélioration ou guérison des lésions muqueuses observées lors de l'examen endoscopique, évaluées par des systèmes de notation clinique validés (SES-CD).
24mois
Chez les patients atteints de la maladie de Crohn active, lorsqu'une décision est prise d'intensifier le traitement après l'endoscopie de référence, identifier s'il existe des signatures microbiennes qui prédisent la réponse au traitement après l'induction (12 - 16 semaines).
Délai: 24 mois
  • Réponse clinique : Définie en fonction des changements dans les symptômes cliniques selon les systèmes de notation clinique standardisés (SES-CD).
  • Réponse biochimique : Évaluée par les niveaux de protéine C-réactive (CRP) et la calprotectine fécale, deux biomarqueurs qui indiquent une inflammation ou une activité de la maladie.

Le score endoscopique simple pour la maladie de Crohn (SES-CD) est une évaluation clinique objective de la sévérité de la maladie de Crohn d'un patient. Un score plus élevé signifie une activité de la maladie plus sévère. Les trois classes de sévérité du score SES-CD sont les suivantes :

  • Rémission endoscopique (SES-CD < 3).
  • Maladie active endoscopiquement modérée à sévère (SES-CD ≥ 7 ou ≥ 4 pour la maladie de Crohn iléale isolée).
  • Maladie active endoscopiquement légère (SES-CD de 3-6, ou 3 avec une maladie de Crohn iléale isolée).
24 mois

Mesures de résultats secondaires

Mesure des résultats
Description de la mesure
Délai
Étudier les corrélations entre les analyses microbiennes sur différents types d'échantillons et l'activité de la maladie dans la MC.
Délai: 24mois

Analyse de corrélation : des mesures statistiques seront utilisées pour évaluer la force et l'orientation de la relation entre la composition microbienne dans différents types d'échantillons (lavages intestinaux, biopsie intestinale, échantillons fécaux) et l'activité de la maladie dans la MC.

Mesures de l'activité de la maladie : l'activité de la maladie sera évaluée à l'aide de l'indice Harvey-Bradshaw modifié, de marqueurs biochimiques (CRP, calprotectine fécale) et des résultats endoscopiques (SES-CD).
24mois
Comparez la différence dans les analyses microbiennes au sein de chaque type d’échantillon entre les patients atteints de MC active et au repos ainsi que les patients non atteints de MII.
Délai: 24mois

Évaluations :

1. Paramètres de diversité microbienne :

  • Métriques de diversité alpha :

    • Indice de Shannon
    • Indice de diversité inverse de Simpson
    • Chao1
  • Ces mesures seront utilisées pour comparer la diversité microbienne au sein de chaque type d'échantillon entre les patients atteints de MC actifs et au repos, ainsi que les patients non atteints de MII.
24mois
Comparez la différence dans les analyses microbiennes au sein de chaque type d’échantillon entre les patients atteints de MC active et au repos ainsi que les patients non atteints de MII.
Délai: 24mois

Évaluations :

Analyse d'abondance différentielle : une analyse d'abondance différentielle sera effectuée à l'aide de modèles linéaires généralisés pour identifier des taxons microbiens spécifiques qui sont significativement différents entre les patients atteints de MC actifs et au repos et les patients non atteints de MII au sein de chaque type d'échantillon.
24mois
Étudier, dans un sous-ensemble de patients atteints de MC, si la composition et la fonction du microbiome fécal 2 semaines après la préparation intestinale sont comparables au microbiome fécal de la préparation intestinale.
Délai: 24mois

Évaluations :

Comparaison de la composition microbienne : les mesures de diversité bêta (dissimilitude de Bray-Curtis, indice Jaccard) et les mesures de distance dépendantes de la phylogénétique (UniFrac pondérées et non pondérées) seront calculées, et le regroupement ultérieur sera appliqué à l'aide d'une analyse des coordonnées principales (PCoA). Pour tester les différences globales du microbiome, un test PERMANOVA sera appliqué. La méthode Benjamini-Hochberg sera appliquée pour contrôler le taux de fausses découvertes.
24mois
Étudier, dans un sous-ensemble de patients atteints de MC, si la composition et la fonction du microbiome fécal 2 semaines après la préparation intestinale sont comparables au microbiome fécal de la préparation intestinale.
Délai: 24mois

Évaluations :

Analyse fonctionnelle : un profilage fonctionnel du microbiome sera effectué pour évaluer s'il y a des changements dans les voies métaboliques et les fonctions du microbiome entre les échantillons de préparation pré- et post-intestinale dans le sous-ensemble de patients atteints de MC.
24mois
Comparez la sensibilité des analyses microbiennes de chaque type d'échantillon dans leur prédiction de la réponse au traitement.
Délai: 24mois

Sensibilité des analyses microbiennes :

  • À l'aide de modèles prédictifs développés à partir d'analyses microbiennes et statistiques, la sensibilité des analyses microbiennes de chaque type d'échantillon sera évaluée.
  • La sensibilité sera rapportée comme la proportion de vrais positifs correctement identifiés par l'analyse.
24mois
Comparez la spécificité des analyses microbiennes de chaque type d'échantillon dans leur prédiction de la réponse au traitement.
Délai: 24mois

Spécificité des analyses microbiennes :

  • Des modèles prédictifs seront également utilisés pour évaluer la spécificité des analyses microbiennes de chaque type d'échantillon.
  • La spécificité sera rapportée comme la proportion de vrais négatifs correctement identifiés par l'analyse.
24mois

Collaborateurs et enquêteurs

C'est ici que vous trouverez les personnes et les organisations impliquées dans cette étude.

Parrainer

University of British Columbia

Collaborateurs

IBD Centre of BC
GI Research Institute
Pacific Gastroenterology Associates

Publications et liens utiles

La personne responsable de la saisie des informations sur l'étude fournit volontairement ces publications. Il peut s'agir de tout ce qui concerne l'étude.

Publications générales

Dates d'enregistrement des études

Ces dates suivent la progression des dossiers d'étude et des soumissions de résultats sommaires à ClinicalTrials.gov. Les dossiers d'étude et les résultats rapportés sont examinés par la Bibliothèque nationale de médecine (NLM) pour s'assurer qu'ils répondent à des normes de contrôle de qualité spécifiques avant d'être publiés sur le site Web public.

Dates principales de l'étude

Début de l'étude (Réel)

1 août 2024

Achèvement primaire (Estimé)

1 juillet 2026

Achèvement de l'étude (Estimé)

1 avril 2027

Dates d'inscription aux études

Première soumission

22 mai 2024

Première soumission répondant aux critères de contrôle qualité

4 juin 2024

Première publication (Réel)

12 juin 2024

Mises à jour des dossiers d'étude

Dernière mise à jour publiée (Réel)

20 janvier 2026

Dernière mise à jour soumise répondant aux critères de contrôle qualité

15 janvier 2026

Dernière vérification

1 janvier 2026

Plus d'information

Termes liés à cette étude

Mots clés

Termes MeSH pertinents supplémentaires

Autres numéros d'identification d'étude

  • H23-02927

Informations sur les médicaments et les dispositifs, documents d'étude

Étudie un produit pharmaceutique réglementé par la FDA américaine

Non

Étudie un produit d'appareil réglementé par la FDA américaine

Non

produit fabriqué et exporté des États-Unis.

Non

Ces informations ont été extraites directement du site Web clinicaltrials.gov sans aucune modification. Si vous avez des demandes de modification, de suppression ou de mise à jour des détails de votre étude, veuillez contacter register@clinicaltrials.gov. Dès qu'un changement est mis en œuvre sur clinicaltrials.gov, il sera également mis à jour automatiquement sur notre site Web .

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