Predecir los resultados del tratamiento de la EII con el análisis del microbioma intestinal (OPTIMIST)
Optimización del tratamiento del paciente que implica la integración del microbioma para terapias especializadas
El objetivo de este estudio observacional prospectivo es determinar si firmas de microbiomas específicos pueden predecir respuestas terapéuticas en pacientes adultos con enfermedad de Crohn (EC), una forma de enfermedad inflamatoria intestinal (EII), que viven en Columbia Británica, Canadá. Las principales preguntas que este estudio busca responder son:
- ¿Pueden las firmas del microbioma en diferentes tipos de muestras (fecales, lavados intestinales y biopsias epiteliales intestinales) predecir la respuesta a la terapia en la EC?
- ¿En qué se diferencian los perfiles de microbioma entre los controles con EC activa y en reposo y sin EII?
Los investigadores compararán las firmas del microbioma en pacientes con EC activa e inactiva, así como con controles sin EII, para ver si hay firmas microbianas que predigan la respuesta a la terapia.
Los participantes:
- Proporcionar muestras de heces y sangre.
- Someterse a lavados intestinales y muestras de biopsia del epitelio intestinal tomadas durante una colonoscopia de rutina.
- Participar en un seguimiento longitudinal durante 12 meses para monitorear las respuestas clínicas, bioquímicas y endoscópicas a la terapia.
Descripción general del estudio
Estado
Intervención / Tratamiento
Descripción detallada
La enfermedad inflamatoria intestinal (EII) es una afección inflamatoria crónica y recurrente que afecta el tracto gastrointestinal (GI). El estudio tiene como objetivo evaluar los perfiles del microbioma (bacterioma y micobioma) en tres tipos diferentes de muestras (fecales, lavados intestinales y biopsias epiteliales intestinales) en una cohorte de pacientes adultos con enfermedad de Crohn (EC) que viven en Columbia Británica, Canadá, e investigar si una firma microbiana puede predecir la respuesta a la terapia de EII.
Objetivos:
- Determine las firmas del microbioma, en diferentes tipos de muestras, en enfermedades inactivas y activas para pacientes con EC que viven en BC, Canadá.
- Evaluar si las firmas del microbioma de la biopsia epitelial fecal, mucosa y/o intestinal pueden predecir la respuesta a la terapia.
Métodos
Diseño del estudio:
Fase 1: Un estudio piloto transversal para evaluar el microbioma en pacientes con EII (con enfermedad activa y quiescente) y en controles sin EII.
Resultado primario: comparar los resultados de los análisis microbianos (incluidos bacteriomas y micobiomas) en tres tipos de muestras diferentes: lavados intestinales y muestras de biopsia del epitelio intestinal tomadas durante la colonoscopia, así como muestras fecales.
Resultados secundarios: investigar las correlaciones entre los análisis microbianos en diferentes tipos de muestras y la actividad de la enfermedad en la EC. Compare la diferencia en los análisis microbianos dentro de cada tipo de muestra entre pacientes con EC activa y en reposo, así como pacientes sin EII. Investigar si la composición y función del microbioma fecal 2 semanas después de la preparación intestinal es comparable al microbioma fecal previo a la preparación intestinal en un subconjunto de pacientes con EC.
Fase 2: Estudio observacional longitudinal con seguimiento de 12 meses.
Resultado primario: identificar si existen firmas microbianas que predicen la respuesta a la terapia en pacientes con enfermedad activa que requieren terapia intensificada, evaluadas clínica y bioquímicamente después de la inducción (12-16 semanas) y a los 12 meses (+/- 3 meses).
Resultados secundarios: comparar la sensibilidad y especificidad de los análisis microbianos de cada tipo de muestra para predecir la respuesta a la terapia.
Tipo de estudio
Inscripción (Estimado)
Contactos y Ubicaciones
Estudio Contacto
- Nombre: Fanny LeMarié, PhD
- Número de teléfono: 6044414992
- Correo electrónico: flemarie@ibdcentrebc.ca
Copia de seguridad de contactos de estudio
- Nombre: Mackenzie Melvin, MSc
- Número de teléfono: 7788072068
- Correo electrónico: mackenzie.melvin@ubc.ca
Ubicaciones de estudio
-
-
British Columbia
-
Vancouver, British Columbia, Canadá, V6Z 2K5
- Reclutamiento
- GI Research Institute
-
Contacto:
- Pedram Tavakoli, BSc
-
Contacto:
- Micah Ten-Pow, BSc
-
-
Criterios de participación
Criterio de elegibilidad
Edades elegibles para estudiar
- Adulto
- Adulto Mayor
Acepta Voluntarios Saludables
Método de muestreo
Población de estudio
Los investigadores pretenden que 75 pacientes con EC completen las fases 1 y 2, y 25 controles sin EII completen la fase 1 únicamente.
La agrupación de pacientes para el reclutamiento es la siguiente:
Grupo 1: 25 EC en remisión endoscópica (puntuación SES-CD <3) Grupo 2: 25 EC con enfermedad endoscópicamente activa de moderada a grave (puntuación SES-CD ≥7 o ≥4 para EC ileal aislada y al menos una úlcera grande (≥ 5 mm)) Grupo 3: 25 EC con enfermedad endoscópicamente activa leve (SES-CD de 3-6, o 3 con EC ileal aislada, sin úlceras grandes (≥5 mm)) Grupo 4: 25 años, sin EII del mismo sexo control S.
Descripción
Criterios de inclusión:
pacientes con EC
- Pacientes adultos ≥19 años y ≤ 80 años.
- EC con afectación distal del intestino delgado y/o colon que es evaluable endoscópicamente con colonoscopia
- Someterse a una colonoscopia como parte de la atención clínica de rutina.
- Enfermedad activa o inactiva
- La enfermedad activa se definirá como una puntuación endoscópica simple para EC (SES-CD) ≥7 o ≥4 para EC ileal aislada y al menos una úlcera grande (≥5 mm)
- La enfermedad inactiva se define como un SES-CD <3.
Controles sin EII
- Pacientes adultos ≥ 19 años y ≤ 80 años.
- Someterse a una colonoscopia como parte del examen colorrectal
Criterio de exclusión:
pacientes con EC
- CD perianal activa: definida como colección en la resonancia magnética o fístula clínicamente activa (es decir, fístula de drenaje)
- Intestino delgado proximal (definido como no evaluable endoscópicamente mediante colonoscopia) o CD gastrointestinal superior aislada
- Antibióticos en los últimos 3 meses para cualquier indicación.
- Suplementos prebióticos, probióticos o posbióticos en el último mes
- Gastroenteritis o viaje fuera de Canadá y Estados Unidos en el último mes
- Cáncer colorrectal, displasia de alto grado o pólipo ≥2 cm diagnosticado en la endoscopia inicial
- Embarazada o amamantando
- Resección intestinal en los 4 meses anteriores.
- Colangitis esclerosante primaria
Controles sin EII
- Se encontró inflamación (considerada por el endoscopista) en la colonoscopia.
- Historia de EII en familiar de 1er grado.
- Antibióticos en los últimos 3 meses.
- Suplementos prebióticos, probióticos o posbióticos en el último mes.
- Gastroenteritis o viaje fuera de Canadá y Estados Unidos en el último mes.
- Embarazada o amamantando.
- Cirugías intestinales previas.
Plan de estudios
¿Cómo está diseñado el estudio?
Detalles de diseño
Cohortes e Intervenciones
Grupo / Cohorte |
Intervención / Tratamiento |
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Pacientes con enfermedad de Crohn
El estudio incluirá a 75 pacientes que consienten con enfermedad de Crohn, con niveles de gravedad variables según la puntuación SES-CD asignada por su gastroenterólogo.
Estos pacientes se someterán a colonoscopia de rutina según su atención habitual, sin que este estudio requiera compromisos de programación adicionales.
Se recogerán muestras de sangre, lavado de mucosa y biopsia intestinal durante el procedimiento de colonoscopia de rutina.
El paciente tendrá la opción de recoger una muestra de heces el día antes de su colonoscopia y llevarla a su cita.
También recibirá un kit de recogida de muestras durante su cita para recoger su próxima muestra de heces requerida dos semanas después de su exploración.
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Se realizará una colonoscopia como parte de la atención clínica de rutina para todos los participantes, y el estudio no requiere ningún compromiso de programación adicional fuera de la atención de rutina.
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Pacientes sin enfermedad inflamatoria intestinal
El estudio incluirá 25 controles no-IBD emparejados por edad y sexo para comparar datos junto a los pacientes con EC.
Estos pacientes se someterán a colonoscopia rutinaria según su programa normal de cribado de colon, sin que este estudio requiera compromisos de programación adicionales.
Se recolectarán muestras de sangre, lavado de mucosa y biopsias intestinales durante el procedimiento de colonoscopia rutinaria.
El paciente tendrá la opción de recolectar una muestra de heces el día anterior a su colonoscopia y llevarla a su cita.
También recibirán un kit de recolección de muestras durante su cita para recolectar su próxima muestra de heces requerida dos semanas después de su endoscopia.
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Se realizará una colonoscopia como parte de la atención clínica de rutina para todos los participantes, y el estudio no requiere ningún compromiso de programación adicional fuera de la atención de rutina.
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¿Qué mide el estudio?
Medidas de resultado primarias
Medida de resultado |
Medida Descripción |
Periodo de tiempo |
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Compare los resultados de los análisis microbianos (incluidos bacteriomas y micobiomas) en tres tipos de muestras diferentes: lavados intestinales y muestras de biopsia del epitelio intestinal tomadas durante la colonoscopia, así como muestras fecales.
Periodo de tiempo: 24 meses
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Los análisis microbianos que se realizarán para cada tipo de muestra son los siguientes: Heces:
Muestras de biopsia:
Lavados intestinales:
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24 meses
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En pacientes con enfermedad de Crohn activa, donde se toma la decisión de intensificar la terapia después de la endoscopia índice, identifique si hay firmas microbianas que predicen una respuesta sostenida a la terapia a los 12 meses (+/- 3 meses).
Periodo de tiempo: 24 meses
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24 meses
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En pacientes con enfermedad de Crohn activa, cuando se decide intensificar el tratamiento tras la endoscopia índice, identificar si existen firmas microbianas que predigan la respuesta al tratamiento tras la inducción (12-16 semanas).
Periodo de tiempo: 24 meses
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La Puntuación Endoscópica Simple para la Enfermedad de Crohn (SES-CD) es una evaluación clínica objetiva de la gravedad de la enfermedad de Crohn de un paciente. Una puntuación más alta significa una actividad de la enfermedad más grave. Las tres clases de gravedad de la puntuación SES-CD son las siguientes:
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24 meses
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Medidas de resultado secundarias
Medida de resultado |
Medida Descripción |
Periodo de tiempo |
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Investigar las correlaciones entre los análisis microbianos de diferentes tipos de muestras y la actividad de la enfermedad en la EC.
Periodo de tiempo: 24 meses
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Análisis de correlación: se utilizarán medidas estadísticas para evaluar la fuerza y dirección de la relación entre la composición microbiana en diferentes tipos de muestras (lavados de intestino, biopsia intestinal, muestras fecales) y la actividad de la enfermedad en la EC. Medidas de actividad de la enfermedad: la actividad de la enfermedad se evaluará utilizando el índice Harvey-Bradshaw modificado, marcadores bioquímicos (PCR, calprotectina fecal) y hallazgos endoscópicos (SES-CD). |
24 meses
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Compare la diferencia en los análisis microbianos dentro de cada tipo de muestra entre pacientes con EC activa y en reposo, así como pacientes sin EII.
Periodo de tiempo: 24 meses
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Evaluaciones: 1. Métricas de diversidad microbiana:
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24 meses
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Compare la diferencia en los análisis microbianos dentro de cada tipo de muestra entre pacientes con EC activa y en reposo, así como pacientes sin EII.
Periodo de tiempo: 24 meses
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Evaluaciones: Análisis de abundancia diferencial: el análisis de abundancia diferencial se realizará utilizando modelos lineales generalizados para identificar taxones microbianos específicos que son significativamente diferentes entre pacientes con EC activa y quiescente y pacientes sin EII dentro de cada tipo de muestra. |
24 meses
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Investigar, en un subconjunto de pacientes con EC, si la composición y función del microbioma fecal 2 semanas después de la preparación intestinal es comparable al microbioma fecal previo a la preparación intestinal.
Periodo de tiempo: 24 meses
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Evaluaciones: Comparación de la composición microbiana: métricas de diversidad beta (disimilaridad de Bray-Curtis, índice de Jaccard) y métricas de distancia dependientes de la filogenética (UniFrac ponderada y no ponderada) se calcularán y se aplicará la agrupación posterior mediante un análisis de coordenadas principales (PCoA). Para probar las diferencias generales del microbioma, se aplicará una prueba PERMANOVA. Se aplicará el método Benjamini-Hochberg para controlar la tasa de descubrimiento falso. |
24 meses
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Investigar, en un subconjunto de pacientes con EC, si la composición y función del microbioma fecal 2 semanas después de la preparación intestinal es comparable al microbioma fecal previo a la preparación intestinal.
Periodo de tiempo: 24 meses
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Evaluaciones: Análisis funcional: Se realizará un perfil funcional del microbioma para evaluar si hay cambios en las vías metabólicas y funciones del microbioma entre muestras previas y posteriores a la preparación intestinal en el subconjunto de pacientes con EC. |
24 meses
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Compare la sensibilidad de los análisis microbianos de cada tipo de muestra en su predicción de respuesta a la terapia.
Periodo de tiempo: 24 meses
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Sensibilidad de los análisis microbianos:
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24 meses
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Compare la especificidad de los análisis microbianos de cada tipo de muestra en su predicción de respuesta a la terapia.
Periodo de tiempo: 24 meses
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Especificidad de los análisis microbianos:
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24 meses
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Términos relacionados con este estudio
Palabras clave
Términos MeSH relevantes adicionales
- Enfermedades intestinales
- Enfermedades del Sistema Digestivo
- Enfermedades Gastrointestinales
- Gastroenteritis
- Enfermedad de Crohn
- Enfermedades inflamatorias del intestino
- Técnicas y procedimientos de diagnóstico
- Diagnóstico
- Procedimientos quirúrgicos, operativo
- Procedimientos quirúrgicos mínimamente invasivos
- Técnicas de diagnóstico, quirúrgico
- Endoscopia, gastrointestinal
- Endoscopia, sistema digestivo
- Técnicas de diagnóstico, sistema digestivo
- Endoscopia
- Procedimientos quirúrgicos del sistema digestivo
- Colonoscopia
Otros números de identificación del estudio
- H23-02927
Información sobre medicamentos y dispositivos, documentos del estudio
Estudia un producto farmacéutico regulado por la FDA de EE. UU.
Estudia un producto de dispositivo regulado por la FDA de EE. UU.
producto fabricado y exportado desde los EE. UU.
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