Rappel d'une cohorte de sujets dans la région de la Méditerranée. Surveillance des maladies hépatiques (Nuthep 3). (Nutrihep3)

Les maladies hépatiques représentent un problème de santé publique important, avec une prévalence élevée et une incidence croissante dans le monde, et un impact significatif sur la morbidité et la mortalité mondiales, provoquant environ 2 millions de décès par an. Les décès sont largement attribuables aux complications de la cirrhose et du carcinome hépatocellulaire. Les causes les plus courantes de cirrhose dans le monde sont liées à l'hépatite virale, à l'alcool et aux maladies hépatiques non alcooliques causées par de mauvaises habitudes alimentaires. Les virus hépatotropes sont le facteur étiologique dans la plupart des cas d'hépatite aiguë, mais les lésions hépatiques induites par le médicament représentent de plus en plus un pourcentage important de cas.

En Italie, l'incidence des maladies hépatiques a fait l'objet d'études ces dernières années. Sur la base de ces données, l'Italie a été identifiée comme une région "hyper-endémique" où les étiologies virales et métaboliques sont responsables d'une prévalence élevée et d'une incidence des maladies hépatiques chroniques. En outre, une augmentation progressive de l'incidence de l'hépatite virale du nord au sud de l'Italie a été observée. Au cours des dernières décennies, l'étiologie de ces maladies a subi un changement significatif.

En ce qui concerne le virus de l'hépatite B (HBV), le programme de vaccination, ainsi que des conditions socioéconomiques améliorées et une plus grande sensibilisation à la population, ont progressivement réduit l'incidence et la prévalence de cette maladie virale. L'hépatite chronique liée au virus de l'hépatite C (VHC), après une augmentation des années 80 et 1990, montre désormais une tendance diminuée, en particulier parmi les groupes d'âge plus jeunes. Alors que d'autres études se sont concentrées sur les maladies hépatiques d'origine métabolique (ASLD, Metald, Ald, etc.), qui sont indiquées comme l'une des causes les plus courantes de la maladie du foie dans le monde et en Italie, les données épidémiologiques les plus récentes concernant la population italienne ont été collectées à la fin des années 1990. Au fil d'une décennie, on pensait qu'il pourrait être intéressant de collecter de nouvelles données sur le modèle de prévalence des maladies du foie, en particulier dans le sud de l'Italie, en particulier dans une municipalité géographiquement équidistante de la côte et de l'arrière-pays.

Par conséquent, cette étude observationnelle vise à analyser l'évolution des maladies hépatiques en rappelant une cohorte de patients déjà identifiés dans la région méditerranéenne. La cohorte se compose d'individus résidant dans la municipalité de Putignano (BA) qui ont déjà subi une évaluation de la fonction hépatique, des comorbidités et des habitudes alimentaires, en plus d'ajouter des informations génétiques grâce à l'analyse de l'association à l'échelle du génome (GWAS), utile pour identifier maladies et comorbidités connexes, en utilisant un échantillon de population représentatif.

L'analyse des données collectées vise à identifier les facteurs de risque et les biomarqueurs prédictifs de la progression de la maladie du foie, dans le but d'optimiser les stratégies de prévention et de gestion. Les résultats fourniront des informations utiles pour améliorer la surveillance clinique et favoriseront les interventions personnalisées chez les personnes atteintes de maladies hépatiques. Les analyses seront effectuées à l'aide de la bioinformatique avancée et des méthodologies statistiques pour assurer la robustesse des résultats.

Ce rappel sera effectué près de 20 ans après le premier. Le rappel des sujets permettra une évaluation longitudinale des facteurs de progression de la maladie ou l'apparition de la maladie.

L'objectif de cette étude de cohorte n'est pas seulement de rappeler des sujets précédemment impliqués dans les études Nuthep 1 et Nuthep2, mais, comme toutes les études de cohorte, pour évaluer l'association entre une exposition et un résultat dans un groupe d'individus. En outre, en plus de réévaluer les paramètres précédemment considérés (tests sanguins, questionnaire alimentaire et activité physique) afin d'étudier leur variation, et le génotypage du génome entier effectuera le génotypage du génome entier de polymorphismes de nucléotide unique (SNP) à l'aide de techniques de génomique à haut lancement, telles que la technologie SNP-armée. Cette technologie permet l'analyse de milliers / millions de variantes génétiques uniformément réparties dans l'ensemble du génome, précédemment caractérisées dans différentes populations ancestrales et présente dans la base de données de phase 3 du projet des 1000 Genomes.

La caractérisation de ces variantes génétiques (SNP) nous permettront de calculer, pour chaque sujet de notre cohorte d'étude, des scores de risque génétique et polygénique déterminés par l'influence combinée de plusieurs variantes génétiques.

Plus précisément, la détermination des scores de risque génétique et polygénique sera effectuée en utilisant des données obtenues à partir d'études d'association à l'échelle du génome (GWAS) et en utilisant des algorithmes sophistiqués biostatistiques et mathématiques pour pondérer le nombre d'allèles sur les variantes associées à la pathologie MAFLD basée sur l'origine antérieure de notre cohort du patient. Dans les phases suivantes, les scores de risque génétique et polygénique seront utilisés pour étudier les associations avec les caractéristiques cliniques des sujets malades afin d'identifier les sous-groupes de patients ayant des caractéristiques cliniques distinctes et de prédire le risque d'apparition et d'évolution de la pathologie.

La cohorte de Nuthep (Putignano) a été créée pour la première fois en 2006-2007, comprenant une cohorte de 2300 sujets, rappelés des listes de médecins généralistes dans la municipalité de Putignano (BA) avec une étape 1: 3.

En 2015-2018, les mêmes sujets ont été rappelés, avec une adhésion de suivi de 65,60%. En outre, 102 décès ont été enregistrés de 2007 à 2014.

Le rappel examinera le 2300 de la 1ère vague, à partir duquel les décès évalués par la consultation des registres de la mort via le système régional d'Edotto et ceux qui ont déménagé dans d'autres régions seront soustraits.

En outre, une cohorte intégrée sera créée pour maintenir la représentativité de la population d'étude, extraite avec une étape 1: 3 basée sur les enregistreurs des médecins généralistes. Cette approche est utile car la cohorte initiale a vieilli et ne comprend donc plus les individus appartenant aux groupes d'âge plus jeunes, qui étaient présents au début de l'étude mais ont vieilli au fil du temps. Cela nous permet de maintenir la distribution d'âge similaire à celle initiale, empêchant la cohorte de devenir progressivement biaisée vers les groupes d'âge plus âgés, ainsi que la réduction du biais en raison du vieillissement de la cohorte elle-même et de l'amélioration de la généralisabilité des résultats. Il nous permet également de préserver le pouvoir statistique de l'étude, car en particulier certains groupes d'âge plus âgés sont essentiels pour l'analyse des effets de l'exposition sur le résultat.

Avec des modalités similaires aux précédentes, cette étude d'observation se concentrera principalement sur les phases suivantes:

Phase initiale

• Création d'une liste de sujets à appeler, issues à la fois des noms des participants à l'étude Nuthep 1 et des résidents de la municipalité de Putignano à travers la liste des médecins généralistes pour compenser le groupe d'âge plus jeune;
• Re-contacter les sujets encore en vie, par le biais de lettres envoyées à leur domicile et des appels;
• Planification des rendez-vous.

V1:

• Signaler le consentement éclairé;
• Évaluation de la santé du foie par examen non invasif avec Fibroscan;
• Anamnèse basée sur les paramètres épidémiologiques (âge, sexe, revenu, antécédents pathologiques et familiaux des maladies liées au foie);
• Collecte de paramètres anthropométriques tels que le poids, la hauteur, le tour de taille, la circonférence de la hanche, la circonférence du cou, la circonférence du poignet et la circonférence du veau. En outre, les paramètres de la pression artérielle (systolique et diastolique) et l'état de la condition physique seront enregistrés dans les tests de terrain suivants: Test de la poignée, assis et atteint, support à une seule jambe, 30 '' SIT TO STOW, TEST RUFFIER, VO2 MAX.

Les sujets inscrits recevront un accéléromètre qui fournit des informations objectives et fiables sur l'activité physique (accélérations, mouvements ...) et la qualité du sommeil. Il sera donné le jour du recrutement et reviendra après 7 jours.

Pour mieux comprendre, avant le début du projet, des aspects qui pourraient interférer avec le succès des interventions proposées, les sujets rempliront un questionnaire supplémentaire:

De plus, des tests seront effectués pour évaluer la qualité du sommeil et la kinesophobie, l'indice de qualité du sommeil de Pittsburgh (PSQI) et l'échelle Tampa de la kinésiophobie (TSK). Pour la classification de la sarcopénie, le test de batterie de performances physiques courts (SPPB) sera administré; - Échantillonnage sanguin pour les analyses de routine. Les éléments suivants seront mesurés sur les échantillons: numérisation sanguine complète, CRP, protéines totales, céruloplasmine, alpha 1 antitrypsine, glucose, taux d'hémoglobine A1C (HbA1c), urée, créatinine, albumine glomérulaire estimée (EGFR), bilirubine totale et direct) Aminotransférase (ALT / GPT), gamma-glutamyl transférase (GGT), sodium, potassium, calcium, phosphore, fer à faible densité (LDL), triglycérides, ferritin, vice-c-peptide, vitamine d, insuline, ferritine, vice-viblé B12, hormones parathyroïdiens, hormones stimulant la thyroïde (TSH), triiodothyronine libre (FT3), thyroxine libre (FT4), facteur de croissance de type insulin HCV; Les aliquotes sériques, qui restaient peut-être après les analyses de chimie du sang de routine, seront stockées dans la biobanque pour les analyses ultérieures et, avec le consentement du sujet, utilisée pour d'autres études que les IRCC "Saverio de Bellis" s'activeront.

Les analyses de génotypage seront effectuées sur des aliquotes du sang total, qui resteront également après des analyses de routine. L'anonymat sera garanti en attribuant un code unique au patient au moment de l'inscription.

- Livraison des questionnaires d'auto-complétion: questionnaire alimentaire (EPIC), activité physique (IPAQ, longue forme) et questionnaires pour évaluer la santé psychologique: PSS-10 (échelle de stress perçue), H.A.D.S. (Échelle d'anxiété et de dépression de l'hôpital), TMI-I (testez votre mémoire).

V2 (7 jours plus tard):

• Collecte de tests de chimie du sang;
• Livraison de selles et d'échantillons d'urine. La calprotectine fécale et le sang occulte seront mesurés sur les échantillons de selles; Les échantillons de selles et d'urine seront ensuite stockés dans la biobanque. Des échantillons de selles seront utilisés pour l'évaluation du microbiote intestinal et du métabolome fécal. Des échantillons d'urine seront utilisés pour les mesures de métabolomique; Pour l'évaluation du microbiote intestinal, l'ADN métagénomique bactérienne total sera extrait des échantillons de selles en utilisant le mini kit de selles ADN rapide Qiaamp (Qiagen, Hilden, Allemagne). La caractérisation du microbiome sera réalisée à l'aide d'une approche de métabarcodage d'ADN et de métatranscriptomique du fusil de chasse. L'analyse du métabarcodage de l'ADN sera effectuée à l'aide des régions hypervariables V5-V6 de l'ARNr 16S pour les bactéries (plate-forme MiSeq-illumine). Les échantillons qui sont significatifs dans l'analyse du métabarcodage de l'ADN seront soumis à une analyse métatranscriptomique (plate-forme NextSeq 500 - Illumina). Les données de métagénomique et de métatranscriptomique seront analysées à l'aide de pipelines bioinformatiques.

Pour effectuer des tests de métabolomique, les échantillons seront analysés pour les composés organiques volatils (COV) qui seront désorbés thermiquement en transférant immédiatement la fibre dans le port d'injection chauffé (220 ° C) d'une Clarus 680 (Perkin Elmer, Beaconsfield UK) équipé d'une colonne RTX-Wax (30 m × 0,25 mm I.D., 0,25 oµm de la colonne) (repos) (Reposek) Film) (Reposek) Film) (Reposek) I.D.D., 0,25 oµm Films) (Reposek) Film) (Reposek) Film) (Reposek) Film) (Reposek) Film) (Reposek) Film) (Reposek) Film) I.D., 0,25 oµm Films) (Reposek) Film) (Reposek) Film). et couplé à un Clarus SQ8MS (Perkin Elmer) avec des températures de source et de ligne de transfert maintenus à 250 et 210 ° C, respectivement.

• Collection de l'accéléromètre;
• Livraison de questionnaires et discussion à leur sujet pour éviter les malentendus et les données manquantes.