Przypomnienie kohorty pacjentów w regionie Morza Śródziemnego. Monitorowanie chorób wątroby (NutriHep 3). (Nutrihep3)

Choroby wątroby stanowią znaczący problem zdrowia publicznego, z dużą częstością występowania i rosnącym występowaniem na całym świecie oraz znaczącym wpływem na globalną zachorowalność i śmiertelność, powodując około 2 milionów zgonów rocznie. Zgony w dużej mierze przypisują powikłania marskości wątroby i raka wątrobowokomórkowego. Najczęstsze przyczyny marskości wątroby na całym świecie są związane z wirusowym zapaleniem wątroby, alkoholu i bezalkoholowej choroby wątroby tłuszczowej spowodowanej złymi nawykami dietetycznymi. Wirusy wątrobowe są czynnikiem etiologicznym w większości przypadków ostrego zapalenia wątroby, ale uszkodzenie wątroby wywołane przez leki stanowi znaczny odsetek przypadków.

We Włoszech częstość występowania chorób wątroby była przedmiotem badań w ostatnich latach. Na podstawie tych danych Włochy zostały zidentyfikowane jako region „hiper endemiczny”, w którym zarówno etiologie wirusowe, jak i metaboliczne są odpowiedzialne za wysoką częstość występowania i występowanie przewlekłych chorób wątroby. Ponadto zaobserwowano postępowy wzrost częstości występowania wirusowego zapalenia wątroby od północy do południowych Włoch. W ostatnich dziesięcioleciach etiologia tych chorób uległa znacznej zmianie.

Jeśli chodzi o wirus zapalenia wątroby typu B (HBV), program szczepień, wraz z lepszymi stanami społeczno -ekonomicznymi i większą świadomością populacji, stopniowo zmniejszał częstość występowania i rozpowszechnienia tej choroby wirusowej. Przewlekłe zapalenie wątroby związane z wirusem zapalenia wątroby typu C (HCV), po wzroście w latach 80. i 90. XX wieku, wykazuje obecnie spadek trendu, szczególnie wśród młodszych grup wiekowych. Podczas gdy inne badania koncentrowały się na chorobach wątroby pochodzenia metabolicznego (ASLD, METALD, ALD itp.), Które są wskazane jako jedna z najczęstszych przyczyn choroby wątroby na całym świecie i we Włoszech, najnowsze dane epidemiologiczne dotyczące populacji włoskiej zostały zebrane pod koniec lat 90. W miarę upływu dekady uważano, że może być interesujące zebranie nowych danych na temat rozpowszechnienia chorób wątroby, szczególnie w południowych Włoszech, szczególnie w gminie geograficznie równoległej zarówno z wybrzeża, jak i w zapleczu.

Dlatego to badanie obserwacyjne ma na celu przeanalizowanie ewolucji chorób wątroby poprzez przywołanie kohorty pacjentów już zidentyfikowanych w obszarze śródziemnomorskim. Kohorta składa się z osób zamieszkałych w gminie Putignano (BA), które już przeszły ocenę funkcji wątroby, współwątpliwości i nawyków dietetycznych, oprócz dodawania informacji genetycznych poprzez odkrywanie korelacji w całym genomie (GWAS), przydatne do identyfikacji powiązań genetycznych i specyficznych cech fenotypowych i specyficznych charakterystyk fenotypowych i specyficznych fenotypowych cech i specyficznych fenotypowych charakterystyk. Powiązane współistniejące, przy użyciu reprezentatywnej próbki populacji.

Analiza zebranych danych ma na celu identyfikację czynników ryzyka i predykcyjnych biomarkerów progresji choroby wątroby, w celu optymalizacji strategii zapobiegania i zarządzania. Wyniki dostarczą przydatnych informacji w celu poprawy nadzoru klinicznego i promowania spersonalizowanych interwencji u osób z chorobami wątroby. Analizy zostaną przeprowadzone przy użyciu zaawansowanych metodologii bioinformatycznych i statystycznych w celu zapewnienia odporności wyników.

To wycofanie zostanie przeprowadzone prawie 20 lat po pierwszym. Wycofanie osób pozwoli na podłużną ocenę czynników progresji choroby lub początek choroby.

Celem tego badania kohortowego jest nie tylko przywołanie osób wcześniej zaangażowanych w badania NutriHep 1 i NutriHep2, ale, podobnie jak wszystkie badania kohortowe, w celu oceny związku między narażeniem a wynikiem w grupie osób. Ponadto, oprócz ponownej oceny wcześniej rozważanych parametrów (badania krwi, kwestionariusz dietetyczny i aktywność fizyczna) w celu zbadania ich zmienności, a genotypowanie całego genomu będzie wykonywać genotypowanie całego genomu polimorfizmów pojedynczego nukleotydu (SNP). Technologia ta pozwala na analizę tysięcy/milionów wariantów genetycznych równomiernie rozmieszczonych w całym genomie, wcześniej scharakteryzowanym w różnych populacjach przodków i obecnej w bazie danych 30 Genomes Project Faza 3.

Charakterystyka tych wariantów genetycznych (SNP) pozwoli nam obliczyć, dla każdego pacjenta w naszej grupie badanej, genetyczne i poligeniczne wyniki ryzyka określone przez łączny wpływ wielu wariantów genetycznych.

W szczególności określenie wyników ryzyka genetycznego i poligenicznego zostanie przeprowadzone przy użyciu danych uzyskanych z badań asocjacyjnych całego genomu (GWAS) i przy użyciu wyrafinowanych algorytmów biostatystycznych i matematycznych w celu ważenia liczby alleli na wariantach związanych z patologią MAFLD opartą na ranowym pochodzeniu naszego pacjenta. W kolejnych fazach genetyczne i poligeniczne wyniki ryzyka zostaną wykorzystane do zbadania powiązań z cechami klinicznymi chorymi osobami w celu zidentyfikowania podgrup pacjentów o charakterystyce klinicznej oraz przewidywanie ryzyka wystąpienia i ewolucji patologii.

Kohorta NutriHep (Putignano) została po raz pierwszy założona w latach 2006-2007, obejmująca kohortę 2300 osób, wycofaną z list lekarzy ogólnych w gminie Putignano (BA) z krokiem 1: 3.

W latach 2015-2018 odwołano tych samych badanych, z kontrolą 65,60%. Ponadto 102 zgony odnotowano w latach 2007–2014.

Wycofanie rozważy 2300 z pierwszej fali, od której zgony oceniały w drodze konsultacji rejestrów śmierci za pośrednictwem regionalnego systemu Edotto, a osoby, które przeprowadziły się do innych regionów, zostaną odjęte.

Ponadto zostanie utworzona wbudowana kohorta w celu utrzymania reprezentatywności badanej populacji, wyodrębnionej 1: 3 na podstawie rejestracji lekarzy ogólnych. Podejście to jest przydatne, ponieważ początkowa kohorta się starzeje i dlatego nie obejmuje już osób należących do młodszych grup wiekowych, które były obecne na początku badania, ale w wieku w wieku. Pozwala nam to utrzymać rozkład wieku podobny do początkowego, uniemożliwiając stopniowe wypaczenie kohorty w kierunku starszych grup wiekowych, a także zmniejszenie stronniczości ze względu na starzenie się samej kohorty i poprawę uogólnienia wyników. Pozwala nam również zachować moc statystyczną badania, ponieważ szczególnie niektóre starsze grupy wiekowe mają kluczowe znaczenie dla analizy wpływu narażenia na wynik.

Z podobnymi metodami do poprzednich, to badanie obserwacyjne skupi się głównie na następujących fazach:

Początkowa faza

• Tworzenie listy przedmiotów, które należy nazwać, czerpiąc zarówno z nazwisk uczestników w badaniu NutriHep 1, jak i mieszkańców gminy Putignano poprzez listę lekarzy ogólnych w celu zrekompensowania młodszej grupy wiekowej;
• Ponowne kontaktowanie z przedmiotami wciąż żyjącymi, poprzez listy wysyłane do ich domu i rozmowy;
• Planowanie spotkań.

V1:

• Podpisanie świadomej zgody;
• Ocena zdrowia wątroby poprzez badanie nieinwazyjne za pomocą fibroskanu;
• Anamneza oparta na parametrach epidemiologicznych (wiek, płeć, dochód, patologiczna i rodzinna historia chorób związanych z wątrobą);
• Zbiór parametrów antropometrycznych, takich jak waga, wysokość, obwód talii, obwód bioder, obwód szyi, obwód nadgarstka i obwód łydki. Ponadto parametry ciśnienia krwi (skurczowe i rozkurczowe) i status sprawności fizycznej zostaną rejestrowane za pomocą następujących testów pola: Test Handgrip, Sit and Reach, stojak na pojedynczą nogę, 30 '' Sit to Stand, Test Ruffier, VO2 Max.

Zarejestrowani badani otrzymają akcelerometr, który zapewnia obiektywne i wiarygodne informacje na temat aktywności fizycznej (przyspieszenia, ruchy ...) i jakość snu. Zostanie podany w dniu rekrutacji i wróci po 7 dniach.

Aby lepiej zrozumieć, przed rozpoczęciem projektu, aspekty, które mogłyby zakłócać powodzenie proponowanych interwencji, badani wypełnią dodatkowy kwestionariusz:

Ponadto testy zostaną zakończone w celu oceny jakości snu i kinesophobii, wskaźnika jakości snu w Pittsburghu (PSQI) i skali Tampa Kinesiophobia (TSK). W przypadku klasyfikacji sarkopenii przeprowadzi się test krótkiej akumulator fizycznej (SPPB); - Pobieranie próbek krwi do rutynowych analiz. Poniżej zmierzono na próbkach: całkowita liczba krwi, CRP, białka całkowite, ceruloplazmina, antyitrypsyna alfa 1, glukoza, hemoglobina A1c (HBA1C), mocznik, kreatyna, kreatyna, szacowana szybkość filtracji kłębuszkowej (EGFR), ogółem i bezpośrednim bilirurubiną, altanotynową, asparaganową (AST/GOT), allaninę (EGFR) Aminotransferaza (Alt/GPT), transferaza gamma-glutamylowa (GGT), sód, potas, wapń, fosfor, żelazo, cholesterol, lipoproteina o wysokiej gęstości (HDL), lipoproteina o niskiej gęstości (LDL), tryglicerydy, kortyzol, cortisol, c-peptyd, witamina, insulina, ferritina, festipa, feutamina, festipa B12, ferritinę, feutaminę B12, ferritinę B12, ferritinę, ferritinę B12, ferritinę, ferritinę, ferritinę B12, ferritinę, ferritinę, ferritinę, ferritinę, ferritinę. Hormon przytarczyca, hormon stymulujący tarczycę (TSH), wolna triiodotyronina (FT3), wolna tyroksyna (FT4), insulinowy czynnik wzrostu 1 (IGF-1), białko C-reaktywne (HSCRP), Pro-Bezuryzm, Smowa, HBV (HSCRP) HCV; Próbki w surowicy, prawdopodobnie pozostałe po rutynowych analizach chemii krwi, będą przechowywane w biobank do kolejnych analiz i prawdopodobnie za zgodą pacjenta, zastosowanego do innych badań, które IRCCS „Saverio de Bellis” aktywuje.

Analizy genotypowania zostaną przeprowadzone na porcjach krwi pełnej krwi, prawdopodobnie pozostały po rutynowych analizach. Anonimowość zostanie zagwarantowana, przypisując pacjenta unikalnego kodu w momencie rejestracji.

-Dostarczanie kwestionariuszy samokomisji: kwestionariusz żywności (EPIC), aktywność fizyczna (IPAQ, długa forma) i kwestionariusze w celu oceny zdrowia psychicznego: PSS-10 (postrzegana skala stresu), H.A.D.S. (Skala lęku i depresji szpitalnej), TMI-I (sprawdź swoją pamięć).

V2 (7 dni później):

• Zbieranie testów chemii krwi;
• Dostawa próbek stołka i moczu. Kalprotektyna kału i krew okultystyczna będą mierzone na próbkach stolca; Próbki stołka i moczu będą następnie przechowywane w biobank. Próbki kału zostaną wykorzystane do oceny mikroflory jelitowej i metabolomu kału. Próbki moczu zostaną wykorzystane do pomiarów metabolomicznych; Do oceny mikroflory jelitowej całkowitego bakteryjnego metagenomicznego DNA zostanie wyekstrahowane z próbek stolca przy użyciu zestawu Mini Stoolowego DNA Qiaamp (Qiagen, Hilden, Niemcy). Charakterystyka mikrobiomu zostanie przeprowadzona przy użyciu metabarcodowania DNA i metatranscriptomiki strzelby. Analiza metabarcodowania DNA zostanie przeprowadzona przy użyciu hiperwarialnych regionów V5-V6 16S rRNA dla bakterii (platforma Miseq-Illumina). Próbki, które są istotne w analizie metabarcodingu DNA, zostaną poddane analizie metatranscriptomiki (Platforma NextSeq 500 - Illumina). Dane metagenomiki i metatranscriptomics zostaną przeanalizowane przy użyciu rurociągów bioinformatycznych.

Aby przeprowadzić testy metabolomiczne, próbki zostaną przeanalizowane pod kątem lotnych związków organicznych (LZO), które zostaną termicznie desorbowane przez natychmiastowe przeniesienie włókna do podgrzewanego portu wtryskowego (220 ° C) Clarus 680 (Perkin Elmer, Beaconsfield UK) wyposażony w kolumnę RTX-WSS (30 m × 0,25 MM. W połączeniu z Clarus SQ8MS (Perkin Elmer) z temperaturami linii źródłowej i transferowej utrzymywane odpowiednio w 250 i 210 ° C.

• Zbiór akcelerometru;
• Dostarczanie kwestionariuszy i dyskusja na ich temat, aby uniknąć nieporozumień i brakujących danych.