Återkallelse av en kohort av ämnen i Medelhavet. Övervakning av leversjukdomar (Nutrihep 3). (Nutrihep3)

Leversjukdomar representerar ett betydande folkhälsoproblem, med en hög prevalens och en växande förekomst över hela världen och en betydande inverkan på global sjuklighet och dödlighet, vilket orsakar cirka 2 miljoner dödsfall årligen. Dödsfall är till stor del hänförliga till komplikationer av cirrhos och hepatocellulärt karcinom. De vanligaste orsakerna till cirrhos över hela världen är relaterade till viral hepatit, alkohol och alkoholfri fettleversjukdom orsakad av dåliga dietvanor. Hepatotropiska virus är den etiologiska faktorn i de flesta fall av akut hepatit, men läkemedelsinducerad leverskada representerar alltmer en betydande andel av fallen.

I Italien har förekomsten av leversjukdomar varit föremål för studier under de senaste åren. Baserat på dessa data har Italien identifierats som en "hyper-endemisk" region där både virala och metaboliska etiologier är ansvariga för en hög prevalens och förekomst av kroniska leversjukdomar. Dessutom har en progressiv ökning av förekomsten av viral hepatit från norra till södra Italien observerats. Under de senaste decennierna har etiologin för dessa sjukdomar genomgått en betydande förändring.

Beträffande hepatit B -viruset (HBV) har vaccinationsprogrammet, tillsammans med förbättrade socioekonomiska tillstånd och större befolkningsmedvetenhet, gradvis minskat förekomsten och förekomsten av denna virala sjukdom. Kronisk hepatit relaterad till hepatit C -viruset (HCV), efter en ökning på 1980- och 1990 -talet, visar nu en minskande trend, särskilt bland yngre åldersgrupper. Medan andra studier har fokuserat på leversjukdomar av metaboliskt ursprung (ASLD, Metald, ALD, etc.), som indikeras som en av de vanligaste orsakerna till leversjukdom över hela världen och i Italien samlades de senaste epidemiologiska uppgifterna om den italienska befolkningen i slutet av 1990 -talet. När ett decennium nu har gått, trodde man att det kan vara intressant att samla in nya uppgifter om prevalensmönstret för leversjukdomar, särskilt i södra Italien, särskilt i en kommun geografiskt likadant från både kusten och inlandet.

Därför syftar denna observationsstudie till att analysera utvecklingen av leversjukdomar genom att återkalla en kohort av patienter som redan identifierats i Medelhavet. Kohorten består av individer som är bosatta i kommunen Putignano (BA) som redan har genomgått utvärdering av leverfunktion, komorbiditeter och dietvanor, förutom att lägga till genetisk information genom genombredd associering (GWAS) -analys, användbar för att identifiera föreningar mellan genetiska varianter och specifika fenotypiska egenskaper med syftet med att upptäcka genetiska korrelationer och kontakter för att identifiera föreningar mellan genetiska varianter och specifika fenotypiska egenskaper med syftet med att upptäcka genetiska korrelationer och kontakteriering och relaterade till relaterade till de molekulära förändringarna och de specifika fenetiska anställningarna Komorbiditeter, med ett representativt befolkningsprov.

Analysen av de insamlade uppgifterna syftar till att identifiera riskfaktorer och förutsägbara biomarkörer för leversjukdomsprogression, med målet att optimera förebyggande och hanteringsstrategier. Resultaten kommer att ge användbar information för att förbättra klinisk övervakning och främja personliga interventioner hos individer med leversjukdomar. Analyserna kommer att genomföras med avancerad bioinformatik och statistiska metoder för att säkerställa resultatens robusthet.

Denna återkallelse kommer att genomföras nästan 20 år efter den första. Återkallandet av försökspersoner kommer att möjliggöra en longitudinell bedömning av sjukdomens progressionsfaktorer eller sjukdomens början.

Syftet med denna kohortstudie är inte bara att återkalla ämnen som tidigare var involverade i Nutrihep 1 och Nutrihep2 -studierna, utan, som alla kohortstudier, att utvärdera sambandet mellan en exponering och ett resultat i en grupp individer. Förutom att omvärdera de tidigare övervägda parametrarna (blodprover, kostfrågeformulär och fysisk aktivitet) för att studera deras variation, och helgenome genotypning kommer att utföra hela genotypning av enstaka nukleotidpolymorfismer (SNP: er) kommer att utföras med hjälp av genom-genomströmning av genomiska teknik. Denna teknik möjliggör analys av tusentals/miljoner genetiska varianter jämnt fördelade över hela genomet, som tidigare karakteriserats i olika förfäderpopulationer och närvarande i 1000 Genomes Project Fas 3 -databas.

Karakteriseringen av dessa genetiska varianter (SNP) gör det möjligt för oss att beräkna, för varje ämne i vår studiekohort, genetiska och polygeniska riskpoäng bestämda av det kombinerade inflytandet av flera genetiska varianter.

Specifikt kommer bestämningen av genetiska och polygeniska riskpoäng att genomföras med användning av data erhållna från genombredda associeringsstudier (GWAS) och med användning av sofistikerad biostatistisk och matematiska algoritmer för att vägra allelen räknar på varianterna associerade med MAFLD-patologi baserat på det anorda ursprunget till vår patientkohort. I efterföljande faser kommer de genetiska och polygeniska riskpoängen att användas för att studera föreningarna med de kliniska egenskaperna hos de dåliga försökspersonerna för att identifiera undergrupper av patienter med distinkta kliniska egenskaper och förutsäga risken för början och utvecklingen av patologin.

Nutrihep-kohorten (Putignano) inrättades först 2006-2007, bestående av en kohort av 2300 försökspersoner, återkallade från listorna över allmänläkare i kommunen Putignano (BA) med ett 1: 3-steg.

Under 2015-2018 återkallades samma försökspersoner, med en uppföljning på 65,60%. Dessutom registrerades 102 dödsfall från 2007 till 2014.

Återkallelsen kommer att överväga 2300 från den första vågen, från vilken dödsfallen utvärderas genom samråd med dödsregistren via det regionala Edotto -systemet och de som flyttade till andra regioner kommer att subtraheras.

Vidare kommer en inbäddad kohort att skapas för att upprätthålla studiepopulationens representativitet, extraherad med ett 1: 3 -steg baserat på registreringarna av allmänna utövare. Detta tillvägagångssätt är användbart eftersom den första kohorten har åldrats och därför inte längre inkluderar individer som tillhör de yngre åldersgrupperna, som var närvarande i början av studien men har åldrats över tid. Detta gör att vi kan upprätthålla åldersfördelningen som liknar den första, förhindrar att kohorten gradvis blir sned mot äldre åldersgrupper, samt att minska förspänningen på grund av åldrandet av själva kohorten och förbättra resultatens generaliserbarhet. Det tillåter oss också att bevara studiens statistiska kraft, eftersom särskilt vissa äldre åldersgrupper är avgörande för analysen av effekterna av exponering på resultatet.

Med liknande metoder som de tidigare kommer denna observationsstudie främst att fokusera på följande faser:

Initialfas

• Skapande av en lista över ämnen som ska kallas, från båda namnen på deltagarna i Nutrihep 1 -studien och invånarna i kommunen Putignano genom listan över allmänläkare för att kompensera för den yngre åldersgruppen;
• Kontakt på ämnena som fortfarande lever, genom brev som skickas till sitt hem och samtal;
• Schemaläggning av möten.

V1:

• Undertecknande informerat samtycke;
• Utvärdering av leverhälsa genom icke-invasiv undersökning med fibroskan;
• Anames baserat på epidemiologiska parametrar (ålder, kön, inkomst, patologisk och familjehistoria av leverrelaterade sjukdomar);
• Insamling av antropometriska parametrar såsom vikt, höjd, midjeomkrets, höftomkrets, nackomkrets, handledsomkrets och kalvomkrets. Vidare kommer blodtrycksparametrar (systoliska och diastoliska) och fysiska konditionstatus att registreras genom följande fälttest: handgrepp, sitta och nå test, enkelbenstativ, 30 '' sitter för att stå, ruffier test, VO2 Max.

Inskrivna försökspersoner kommer att ges en accelerometer som ger objektiv och tillförlitlig information om fysisk aktivitet (accelerationer, rörelser ...) och sömnkvalitet. Det kommer att ges på rekryteringsdagen och returneras efter 7 dagar.

För att bättre förstå, innan projektets början, aspekter som kan störa framgången för de föreslagna insatserna, kommer ämnen att fylla i ett ytterligare frågeformulär:

Vidare kommer tester att slutföras för att utvärdera sömnkvalitet och kinesofobi, Pittsburgh Sleep Quality Index (PSQI) och TAMPA -skalan för kinesiofobi (TSK). För klassificering av sarkopeni administreras det korta fysiska prestandatestet (SPPB). - Blodprovtagning för rutinanalyser. Följande kommer att mätas på proverna: komplett blodantal, CRP, totala proteiner, ceruloplasmin, alfa 1 antitrypsin, glukos, hemoglobin A1C (HbA1c), urea, kreatinin, uppskattad glomerulär filtreringshastighet (EGFR), total och direkt bilirub, albumin, aspartatamin, uppskattad glomerulär filtreringsfrekvens (EGFR), total och direkt bilirub, albumin, aspartatamin, uppskattad glomerulär filtreringsfrekvens (EGFR), total och direkt bilirub, albumin, aspartatamin, uppskattad glomerulär filtreringshastighet (EGFR), total och direkt bilirub, albumin, aspartat aminotrerare (Ast), altan), altan) Aminotransferase (ALT/GPT), Gamma-Glutamyl Transferase (GGT), sodium, potassium, calcium, phosphorus, iron, cholesterol, High-Density Lipoprotein (HDL), Low-Density Lipoprotein (LDL), triglycerides, cortisol, c-peptide, vitamin D, insulin, ferritin, folate, vitamin B12, parathyroid hormone, Thyroid-Stimulating Hormone (TSH), Free Triiodothyronine (FT3), Free Thyroxine (FT4), Insulin-like Growth Factor 1 (IGF-1), high-sensitivity C-reactive protein (hsCRP), pro-B-type Natriuretic Peptide (proBNP), zinc, magnesium, HBV and Hcv; Serumalikvoter, som eventuellt är kvar efter de rutinmässiga blodkemiska analyserna, kommer att lagras i biobanken för efterföljande analyser och eventuellt, med ämnets samtycke, som används för andra studier som IRCC: erna "Saverio de Bellis" kommer att aktivera.

Genotypningsanalyser kommer att genomföras på hela blodalikvoter, som också kan vara kvar efter rutinanalyser. Anonymitet garanteras genom att tilldela en unik kod till patienten vid tidpunkten för registreringen.

-Leverans av frågeformulär för självut fullbordande: matfrågeformulär (EPIC), fysisk aktivitet (IPAQ, lång form) och frågeformulär för att bedöma psykologisk hälsa: PSS-10 (upplevd stressskala), H.A.D.S. (Sjukhus ångest och depressionskala), TMI-I (testa ditt minne).

V2 (7 dagar senare):

• Insamling av blodkemi -test;
• Leverans av avföring och urinprover. Fekalt kalprotektin och ockult blod kommer att mätas på avföringsproven; Avförings- och urinprover kommer därefter att lagras i biobanken. Avföringsprover kommer att användas för utvärdering av tarmmikrobiota och fekal metabolom. Urinprover kommer att användas för metabolomikmätningar; För utvärderingen av tarmmikrobiota kommer det totala bakteriella metagenomiska DNA att extraheras från avföringsprover med hjälp av Qiaamp Fast DNA -avföringsmini -kit (Qiagen, Hilden, Tyskland). Mikrobiomkaraktärisering kommer att genomföras med hjälp av en DNA -metabarkodning och hagelgevär metatranscriptomics -strategi. DNA-metabarkodningsanalys kommer att genomföras med användning av V5-V6 hypervariabla regioner i 16S rRNA för bakterier (Miseq-Illumina-plattform). Prover som är signifikanta i DNA -metabarkodningsanalysen kommer att underkastas metatranscriptomics -analys (Nextseq 500 - Illumina -plattform). Metagenomics och metatranscriptomics -data kommer att analyseras med bioinformatikrörledningar.

För att utföra metabolomics-tester kommer prover att analyseras för flyktiga organiska föreningar (VOC) som kommer att vara termiskt desorberad genom att omedelbart överföra fibern till den uppvärmda injektionsporten (220 ° C) av en Clarus 680 (perkin elmer, beaconsfield uk) utrustad med en RTX-wax-kolumn (30 m × 0.25 mm i., 0.2.2. kopplad till en Clarus Sq8ms (Perkin Elmer) med käll- och överföringslinjetemperaturer som upprätthölls vid 250 respektive 210 ° C.

• Insamling av accelerometern;
• Leverans av frågeformulär och diskussion av dem för att undvika missförstånd och saknade data.