Résistance aux antibiotiques de Helicobacter Pylori à Nanjing : Une étude transversale

Depuis sa découverte, Helicobacter pylori est devenu l'un des micro-organismes les plus répandus dans le monde, avec un taux d'infection mondial estimé à 44,3 %. La charge est nettement plus élevée dans les pays en développement (50,8 %) que dans les pays développés (34,7 %). Au-delà de son rôle établi dans la gastrite chronique active et l'ulcère gastro-duodénal, H. pylori est désormais reconnu comme un facteur de risque majeur du cancer gastrique et du lymphome du tissu lymphoïde associé aux muqueuses. Ceci est particulièrement significatif en Chine, où le cancer gastrique se classe parmi les principales tumeurs malignes. Par conséquent, l'infection à H. pylori constitue un défi majeur de santé publique. La menace croissante de la résistance aux antimicrobiens souligne davantage la nécessité urgente d'améliorer les stratégies d'éradication. Le rapport de consensus de Maastricht VI/Florence recommande des tests de sensibilité aux antibiotiques de routine pour guider la sélection de schémas thérapeutiques précis avant l'éradication de H. pylori. Actuellement, seul un nombre limité d'antibiotiques - dont l'amoxicilline, la clarithromycine, le métronidazole, la lévofloxacine, la tétracycline et le furazolidone - restent efficaces. Cependant, leur utilisation généralisée a accéléré l'émergence de résistances. La Chine, avec sa forte charge d'infection, fait face à un paysage particulièrement complexe de résistance aux antibiotiques.

Les schémas contenant de la clarithromycine et de la lévofloxacine sont des stratégies efficaces tant pour le traitement de première intention que de sauvetage. Une méta-analyse a souligné qu'une thérapie séquentielle de 14 jours à base de lévofloxacine est l'un des schémas les plus efficaces au monde. Cependant, la sensibilité à la lévofloxacine présente des variations géographiques significatives, les taux de résistance primaire en Chine ayant considérablement augmenté ces dernières années. Face à la hausse continue des taux de résistance à ces antibiotiques, il est crucial de délimiter les tendances dynamiques de la résistance phénotypique et les caractéristiques des mutations génétiques associées.

La situation de résistance de plus en plus sévère nécessite la mise en place d'une surveillance continue et l'accumulation de données locales. Notre centre a précédemment publié des études transversales analysant la résistance de H. pylori à Nanjing. Cependant, les données sur les tendances de résistance pour d'autres antimicrobiens et leurs mécanismes potentiels restent limitées. Par conséquent, cette étude examine systématiquement l'évolution des taux de résistance phénotypique et génotypique de H. pylori à six antibiotiques couramment utilisés au cours des sept dernières années.

Au-delà de l'analyse phénotypique, cette étude examine les mécanismes de résistance génotypique pour ces antibiotiques. La résistance chez H. pylori résulte principalement de mutations dans les gènes codant pour les cibles médicamenteuses, entraînant une efficacité réduite. Des preuves indiquent que la sensibilité peut être efficacement évaluée en détectant des mutations spécifiques : dans le gène de l'ARNr 23S (par exemple, A2143G, A2142G) pour la résistance à la clarithromycine ; le gène gyrA pour la résistance aux quinolones ; les gènes des protéines de liaison à la pénicilline pour la résistance à l'amoxicilline ; le gène de l'ARNr 16S pour la résistance à la tétracycline ; et les gènes rdxA et frxA pour la résistance au métronidazole.

Objectif et Méthodes Cette étude épidémiologique rétrospective, monocentrique et transversale vise à fournir une analyse actualisée des profils de résistance de H. pylori dans la région de Nanjing. Elle se concentre sur la caractérisation de l'état actuel de la résistance phénotypique et génotypique à l'amoxicilline, la clarithromycine, le métronidazole, la lévofloxacine, la tétracycline et le furazolidone. Les résultats sont destinés à fournir une base scientifique pour le diagnostic rapide et le traitement personnalisé de l'infection à H. pylori. L'étude implique un examen rétrospectif des dossiers médicaux du système de dossier médical électronique et du système d'information de laboratoire du Nanjing First Hospital. Elle identifiera tous les patients ambulatoires ayant subi une culture de H. pylori et un test génétique à la clinique de gastro-entérologie entre le 1er janvier 2018 et le 31 décembre 2025.

Procédures de l'étude Identification de la cohorte : Une cohorte initiale d'environ 7 228 enregistrements de tests H. pylori sera extraite du système d'information hospitalière pour la période spécifiée.

Sélection des cas : Deux chercheurs sélectionneront indépendamment les cas selon des critères d'inclusion et d'exclusion prédéfinis. Les divergences seront résolues par un troisième chercheur senior.

Extraction des données : À l'aide d'un formulaire électronique de rapport de cas préconçu, les données seront extraites, incluant les données démographiques des patients, le diagnostic endoscopique, les résultats de culture de H. pylori, les résultats des tests de sensibilité antimicrobienne (AST) phénotypiques pour les six antibiotiques (utilisant la méthode de dilution en gélose ou l'E-test, interprétés selon les normes CLSI/EUCAST), et les résultats de détection des mutations pour les gènes liés à la résistance (par exemple, ARNr 23S, gyrA, PBP1A, ARNr 16S, rdxA, frxA via PCR multiplex ou séquençage).

Analyse des données : L'analyse statistique sera effectuée avec SPSS. Les statistiques descriptives seront utilisées pour calculer les taux de résistance. Le test de concordance Kappa sera utilisé pour évaluer l'accord entre les phénotypes et génotypes de résistance aux antibiotiques.

Éthique et gestion des données Cette étude sera menée conformément à la Déclaration d'Helsinki. Le protocole a été approuvé par le comité d'éthique. Comme il s'agit d'une étude rétrospective basée sur des données analysant des résultats de laboratoire existants provenant d'échantillons de biopsies de muqueuse gastrique stockés dans la base de données de l'hôpital, aucun nouvel échantillon biologique n'a été collecté. Toutes les informations personnelles des patients seront remplacées par un identifiant d'étude unique pour garantir une anonymisation complète des données. L'exigence de consentement éclairé individuel peut être levée par le comité d'éthique étant donné la nature rétrospective de l'étude.