Oporność na antybiotyki Helicobacter Pylori w Nankinie: Badanie przekrojowe

Od czasu swojego odkrycia Helicobacter pylori stał się jednym z najpowszechniejszych mikroorganizmów na świecie, z szacowaną globalną stopą zakażenia na poziomie 44,3%. Obciążenie jest szczególnie wysokie w krajach rozwijających się (50,8%) w porównaniu z krajami rozwiniętymi (34,7%). Poza ugruntowaną rolą w przewlekłym aktywnym zapaleniu żołądka i chorobie wrzodowej, H. pylori jest obecnie uznawany za główny czynnik ryzyka raka żołądka i chłoniaka tkanki limfatycznej błony śluzowej. Jest to szczególnie istotne w Chinach, gdzie rak żołądka jest jednym z wiodących nowotworów złośliwych. W konsekwencji zakażenie H. pylori stanowi poważne wyzwanie dla zdrowia publicznego. Rosnące zagrożenie opornością na środki przeciwdrobnoustrojowe dodatkowo podkreśla pilną potrzebę poprawy strategii eradykacji. Raport Konsensusu Maastricht VI/Florence zaleca rutynowe testy wrażliwości na antybiotyki w celu ukierunkowania wyboru precyzyjnych schematów leczenia przed eradykacją H. pylori. Obecnie tylko ograniczona liczba antybiotyków – w tym amoksycylina, klarytromycyna, metronidazol, lewofloksacyna, tetracyklina i furazolidon – pozostaje skuteczna. Jednak ich powszechne stosowanie przyspieszyło pojawianie się oporności. Chiny, z powodu wysokiego obciążenia zakażeniami, stoją przed szczególnie złożonym krajobrazem oporności na antybiotyki.

Schematy zawierające klarytromycynę i lewofloksacynę są skutecznymi strategiami zarówno w leczeniu pierwszego rzutu, jak i ratunkowym. Metaanaliza wykazała, że 14-dniowa terapia sekwencyjna oparta na lewofloksacynie jest jednym z najbardziej skutecznych schematów na świecie. Jednak wrażliwość na lewofloksacynę wykazuje znaczne zróżnicowanie geograficzne, a wskaźniki oporności pierwotnej w Chinach znacznie wzrosły w ostatnich latach. W obliczu ciągle rosnących wskaźników oporności na te antybiotyki kluczowe jest określenie dynamicznych trendów oporności fenotypowej oraz charakterystyki związanych z nią mutacji genetycznych.

Coraz poważniejsza sytuacja dotycząca oporności wymaga ustanowienia ciągłego nadzoru i gromadzenia danych lokalnych. Nasze centrum opublikowało wcześniej badania przekrojowe analizujące oporność H. pylori w Nankinie. Jednak dane dotyczące trendów oporności na inne środki przeciwdrobnoustrojowe i ich potencjalnych mechanizmów pozostają ograniczone. Dlatego niniejsze badanie systematycznie przegląda ewolucję wskaźników oporności fenotypowej i genotypowej H. pylori na sześć powszechnie stosowanych antybiotyków w ciągu ostatnich siedmiu lat.

Poza analizą fenotypową, to badanie bada genotypowe mechanizmy oporności na te antybiotyki. Oporność H. pylori wynika głównie z mutacji w genach kodujących cele leków, prowadząc do zmniejszonej skuteczności. Dowody wskazują, że wrażliwość można skutecznie ocenić poprzez wykrywanie specyficznych mutacji: w genie 23S rRNA (np. A2143G, A2142G) dla oporności na klarytromycynę; w genie gyrA dla oporności na chinolony; w genach białek wiążących penicylinę dla oporności na amoksycylinę; w genie 16S rRNA dla oporności na tetracyklinę; oraz w genach rdxA i frxA dla oporności na metronidazol.

Cel i Metody To retrospektywne, jednocentrowe, przekrojowe badanie epidemiologiczne ma na celu dostarczenie zaktualizowanej analizy wzorców oporności H. pylori w regionie Nankinu. Skupia się na scharakteryzowaniu aktualnego stanu oporności fenotypowej i genotypowej na amoksycylinę, klarytromycynę, metronidazol, lewofloksacynę, tetracyklinę i furazolidon. Ustalenia mają na celu dostarczenie naukowych podstaw do szybkiej diagnozy i spersonalizowanego leczenia zakażenia H. pylori. Badanie obejmuje retrospektywny przegląd dokumentacji medycznej z systemu elektronicznej dokumentacji medycznej i systemu informacji laboratoryjnej Szpitala Pierwszego w Nankinie. Zidentyfikuje wszystkich pacjentów ambulatoryjnych, którzy przeszli hodowlę H. pylori i testy genetyczne w klinice gastroenterologicznej między 1 stycznia 2018 a 31 grudnia 2025 roku.

Procedury Badania Identyfikacja Kohorty: Początkowa kohorta około 7 228 zapisów testów H. pylori zostanie pobrana z systemu informacji szpitalnej dla określonego okresu.

Przesiewanie Przypadków: Dwóch badaczy niezależnie przesieje przypadki zgodnie z wcześniej zdefiniowanymi kryteriami włączenia i wyłączenia. Rozbieżności zostaną rozstrzygnięte przez trzeciego starszego badacza.

Ekstrakcja Danych: Z użyciem wcześniej zaprojektowanego elektronicznego Formularza Raportowania Przypadków zostaną wyekstrahowane dane, w tym dane demograficzne pacjentów, rozpoznanie endoskopowe, wyniki hodowli H. pylori, wyniki fenotypowych testów wrażliwości na środki przeciwdrobnoustrojowe (AST) dla sześciu antybiotyków (z użyciem rozcieńczenia agarowego lub testu E, interpretowane zgodnie ze standardami CLSI/EUCAST) oraz wyniki wykrywania mutacji dla genów związanych z opornością (np. 23S rRNA, gyrA, PBP1A, 16S rRNA, rdxA, frxA poprzez multiplex PCR lub sekwencjonowanie).

Analiza Danych: Analiza statystyczna zostanie przeprowadzona przy użyciu SPSS. Statystyki opisowe zostaną użyte do obliczenia wskaźników oporności. Test zgodności Kappa zostanie użyty do oceny zgodności między fenotypami a genotypami oporności na antybiotyki.

Etyka i Zarządzanie Danymi Badanie to będzie prowadzone zgodnie z Deklaracją Helsińską. Protokół został zatwierdzony przez komisję etyczną. Ponieważ jest to retrospektywne badanie oparte na danych, analizujące istniejące wyniki laboratoryjne z próbek biopsji błony śluzowej żołądka przechowywanych w bazie danych szpitala, nie pobrano nowych próbek biologicznych. Wszystkie dane osobowe pacjentów zostaną zastąpione unikalnym identyfikatorem badania, aby zapewnić całkowitą anonimizację danych. Wymóg indywidualnej świadomej zgody może zostać uchylony przez komisję etyczną ze względu na retrospektywny charakter badania.