Strumenti genomici per studiare l'ecologia della microflora vaginale umana (VM)

I normali batteri vaginali nelle donne sane in età riproduttiva svolgono un ruolo chiave nel prevenire la colonizzazione di successo da parte di organismi "indesiderabili", compresi quelli responsabili di vaginosi batterica, infezioni da lieviti, malattie sessualmente trasmissibili e infezioni del tratto urinario. Il nostro obiettivo a lungo termine è sviluppare un'accurata comprensione dell'ecosistema microbico della vagina in donne normali e sane come prerequisito essenziale per comprendere come la normale microflora riduca il rischio di contrarre queste comuni infezioni vaginali.

Verranno reclutate quattrocento donne in modo che ci sia una distribuzione equa tra quattro gruppi etnici autoproclamati (caucasici, afroamericani, ispanici e asiatici). Questi raggruppamenti sono stati selezionati sulla base dello studio originale di Forney che ha identificato diversi supergruppi di distribuzione della microflora vaginale dominante tra donne afroamericane e caucasiche.

L'obiettivo sperimentale di questa proposta è utilizzare una combinazione di metodi indipendenti dalla cultura (T-RFLP di 16S rRNA, analisi della sequenza dei geni 16SrRNA e recA e genomica di comunità) per sviluppare strumenti volti a far progredire la nostra comprensione della composizione e del ruolo dei singoli organismi e le comunità che costituiscono gli ecosistemi delle vagine umane. Gli obiettivi specifici sono progettati per sviluppare strumenti genomici per la ricerca e la comunità scientifica clinica per studiare l'ecologia della microflora vaginale umana