Genomiske verktøy for å studere økologien til den menneskelige vaginale mikrofloraen (VM)

De normale vaginale bakteriene hos friske kvinner i reproduktiv alder spiller en nøkkelrolle i å forhindre vellykket kolonisering av "uønskede" organismer, inkludert de som er ansvarlige for bakteriell vaginose, soppinfeksjoner, seksuelt overførbare sykdommer og urinveisinfeksjoner. Vårt langsiktige mål er å utvikle en nøyaktig forståelse av skjeden mikrobielle økosystem hos normale, friske kvinner som en essensiell forutsetning for å forstå hvordan den normale mikrofloraen reduserer risikoen for å pådra seg disse vanlige vaginale infeksjonene.

Fire hundre kvinner vil bli rekruttert slik at det vil være lik fordeling mellom fire selverklærte etniske grupper (kaukasiske, afroamerikanske, latinamerikanske og asiatiske). Disse grupperingene ble valgt basert på den originale Forney-studien som identifiserte forskjellige distribusjoner av supergrupper av dominerende vaginal mikroflora mellom afroamerikanske og kaukasiske kvinner.

Det eksperimentelle fokuset for dette forslaget er å bruke en kombinasjon av kulturuavhengige metoder (T-RFLP av 16S rRNA, 16SrRNA og recA gener sekvensanalyse og samfunnsgenomikk) for å utvikle verktøy som tar sikte på å fremme vår forståelse av sammensetningen og rollen til individuelle organismer. og samfunn som utgjør økosystemene til menneskelige vaginaer. De spesifikke målene er designet for å utvikle genomiske verktøy for forskning og klinisk vitenskapelig miljø for å studere økologien til den menneskelige vaginale mikrofloraen