Genomic Tools voor het bestuderen van de ecologie van de menselijke vaginale microflora (VM)

De normale vaginale bacteriën bij gezonde vrouwen in de vruchtbare leeftijd spelen een sleutelrol bij het voorkomen van succesvolle kolonisatie door "ongewenste" organismen, waaronder organismen die verantwoordelijk zijn voor bacteriële vaginose, schimmelinfecties, seksueel overdraagbare aandoeningen en urineweginfecties. Ons langetermijndoel is het ontwikkelen van een nauwkeurig begrip van het microbiële ecosysteem van de vagina bij normale, gezonde vrouwen als een essentiële voorwaarde om te begrijpen hoe de normale microflora het risico op het krijgen van deze veelvoorkomende vaginale infecties vermindert.

Vierhonderd vrouwen zullen zodanig worden gerekruteerd dat er een gelijke verdeling zal zijn over vier zelfverklaarde etnische groepen (Kaukasisch, Afro-Amerikaans, Latijns-Amerikaans en Aziatisch). Deze groeperingen werden geselecteerd op basis van de originele Forney-studie die verschillende distributiesupergroepen identificeerde van dominante vaginale microflora tussen Afro-Amerikaanse en blanke vrouwen.

De experimentele focus van dit voorstel is het gebruik van een combinatie van cultuuronafhankelijke methoden (T-RFLP van 16S rRNA, 16SrRNA en recA genensequentieanalyse en community genomics) om tools te ontwikkelen die gericht zijn op het bevorderen van ons begrip van de samenstelling en rol van individuele organismen. en gemeenschappen die de ecosystemen van menselijke vagina's vormen. De specifieke doelstellingen zijn ontworpen om genomische hulpmiddelen te ontwikkelen voor de onderzoeks- en klinische wetenschappelijke gemeenschap om de ecologie van de menselijke vaginale microflora te bestuderen.