Studio Genitourinario per Promuovere il Lactobacillus per Ottimizzare il Microbioma nella Salute delle Donne (GUD-FLORA) (GUD-FLORA)

Questo è uno studio prospettico e osservazionale in pazienti con infezioni urinarie ricorrenti che richiedono assistenza presso la Divisione di Uroginecologia della Duke.

Dopo aver ottenuto il consenso informato, i campioni basali e i questionari verranno completati durante una visita in presenza. I dati clinici saranno estratti dalla cartella clinica. Durante la visita basale, ai partecipanti verrà fornito un ciclo di 3 mesi del probiotico vaginale VS-01TM, prodotto da Seed Health, Inc. VS-01TM è una compressa solubile in commercio contenente tre ceppi di L. crispatus. La compressa viene auto-somministrata per via vaginale tramite un applicatore fornito.

I partecipanti seguiranno il regime posologico raccomandato (ad esempio, Giorni 1, 4, 7, 14, 21, 28, poi ogni due settimane) per un totale di 3 mesi.

Nessuna terapia esistente per le infezioni urinarie ricorrenti verrà interrotta o vietata durante il periodo di studio. I pazienti saranno incoraggiati a continuare eventuali farmaci stabili/esistenti per la prevenzione delle infezioni urinarie come gli estrogeni vaginali. Non verrà utilizzato alcun controllo con placebo.

Ai partecipanti verranno forniti kit di campionamento domestico per la raccolta dei campioni. Il campionamento finale avviene un mese dopo il completamento del regime probiotico, con campioni conservati per future analisi per determinare se la colonizzazione persiste dopo la cessazione del probiotico. Il campionamento avverrà al basale e alle settimane 4, 10 e 16. Ogni punto temporale di campionamento includerà un campione di urina e un tampone vaginale. Il campione basale includerà anche un test del pH tramite striscia di carta indicatrice.

Le procedure di campionamento domestico saranno simili a quelle recentemente pubblicate da un grande consorzio. I partecipanti restituiranno i kit di campionamento tramite spedizionieri pre-indirizzati e prepagati attraverso il nostro account di laboratorio. A causa della natura domestica della raccolta dei campioni da parte dei pazienti, non saranno necessarie ulteriori visite in clinica. I pazienti avranno accesso alle visite cliniche di routine secondo lo standard di cura.

Al ricevimento in laboratorio, i campioni verranno processati e il DNA verrà estratto. I campioni preparati con controlli positivi e negativi verranno valutati per l'abbondanza microbica. Per la nostra analisi primaria, l'abbondanza assoluta di L. crispatus al basale e nei successivi punti temporali verrà valutata utilizzando la PCR digitale a goccia. Inoltre, pianificheremo di ottenere finanziamenti aggiuntivi per analisi basate sul sequenziamento di L. crispatus e altre specie. Per queste analisi aggiuntive, i campioni verrebbero inviati al Duke Microbiome Core per la preparazione della libreria, l'amplificazione e il sequenziamento del gene 16S rRNA a lunghezza intera. L'identificazione tassonomica verrà eseguita con pipeline standard e l'abbondanza relativa di L. crispatus e altre specie verrà quantificata.

Per quanto riguarda i dati dei questionari, tutti saranno completati elettronicamente in clinica (basale tramite iPad) o a casa (link inviato all'email designata) e archiviati tramite Research Electronic Data Capture (REDCap). I questionari utilizzati sono il Vulvovaginal Symptoms Questionnaire (VSQ) e un questionario di accettabilità. Si tratta di questionari validati per valutare rispettivamente la tollerabilità e l'accettabilità da parte del paziente del regime probiotico vaginale.