NIAID集中配列決定プロトコル
バックグラウンド：
「シーケンシング」と呼ばれる遺伝子検査は、研究者が DNA を見るのに役立ちます。 遺伝子はDNAでできており、私たちの体が機能するための指示です. 私たちは皆、何千もの遺伝子を持っています。 DNAバリアントは、2人の間の遺伝子の違いです。 私たちは皆、たくさんのバリエーションを持っています。 ほとんどは無害ですが、青い目や茶色の目などの原因となるものもあります。 いくつかの亜種は、健康上の問題を引き起こす可能性があります。
目的：
免疫疾患のさまざまな健康状態の遺伝学、ならびにこのプロトコルの下で実行される臨床ゲノミクスおよび遺伝カウンセリング サービスの結果を理解すること。
資格:
他の NIH ヒト被験者研究プロトコルの参加者 - NIH 臨床センター (CC) または子供の国民保健システム (CNHS) のいずれか - (年齢 0-99 歳)、および選択されたケースでは、その生物学的親戚
デザイン：
研究者は、NIH に保存されている可能性がある以前に収集されたサンプルを含む、血液、唾液、または別の組織サンプルから抽出された参加者の DNA を研究します。 研究者は参加者の DNA を詳細に調べます。 参加者と他の人の DNA 配列または構造の違いを探しています。
参加者は次の結果を受け取ります。
- 彼らの健康にとって重要です
- 臨床検査室で確認済み
- 現在または将来の医療管理に影響を与える可能性のある深刻な病気のリスクがある可能性があることを示唆します。
参加者に返す遺伝子情報の一部は、重要性が不明な場合があります。
遺伝子検査の結果が参加者の NIH 評価と無関係である場合、通常は報告しません。
- 通常のバリアント
- 有効な治療法がない進行性の致命的な状態に関する情報
- 保因者の状態 (持っていないが、渡すことができる状態)
サンプルとデータは、将来の研究のために保存されます。
個人データは可能な限り秘密にされます。
今後の研究で新しい情報が必要な場合は、参加者に連絡することができます。
調査の概要
状態
状態
詳細な説明
研究デザイン: この研究は、標準化を促進し、プログラムに参加するための遺伝子型および表現型データの蓄積を統合するために、NIH のヒト被験者研究の集中型シーケンス プロトコルとして機能します。 遺伝子検査を含む NIH CC と CNHS の両方での他の NIH 研究の参加者は、このプロトコルに登録することができ、遺伝子検査はこれに基づいて実施されます。
勉強。
目的: 主要: 多様な免疫疾患およびその他の健康への遺伝的寄与に関する証拠を生成および分析すること
NIH 学内研究プログラム (IRP) によって研究された条件。
二次: 臨床ゲノミクスおよび遺伝学のプロセスと結果に関するエビデンスを生成および分析する
このプロトコルの下で実行されるカウンセリング サービス。
エンドポイント: 一次: 免疫疾患およびその他の健康状態への個別の遺伝的寄与。明示的に以下を含む:
確立された遺伝性疾患。
新しい遺伝的欠陥。
確立された遺伝子に関連する新しい表現型
障害。
二次: このプロトコルおよび関連プログラムで臨床ゲノム サービスを改善する方法の証拠ベース。
プレシス
国立アレルギー感染症研究所 (NIAID) の研究者は、免疫疾患への遺伝的寄与を判断するために次世代シーケンシング技術を使用しています。 これらの取り組みにより、NIAIDのサブセットの分子診断率が向上しました
参加者だけでなく、宿主防御と免疫調節における細胞経路とシグナル伝達経路に関する基本的な洞察を明らかにしました。
これらの成功にもかかわらず、ゲノムデータの分析と解釈は依然として大きな課題です。 簡単に言えば、研究者は、ほとんどのヒトの遺伝的変異の機能的および臨床的結果を理解していません. これは、NIAID および学内研究プログラム全体に当てはまります。 この分野で進歩を遂げるには、調整された体系的で透明性のあるアプローチが必要です。
臨床ゲノミクス研究。
このプロトコルは遺伝子検査に固有のものであり、NIH の参加プログラム全体で臨床ケアを強化し、研究を強化することを明確に目指しています。 発端者は、遺伝子検査のために生物学的標本を提供し、一次臨床および研究評価を実行する一次プロトコルに登録する必要があります。 このプロトコルは、
標準化された表現型解析、臨床研究情報システム (CRIS) による検査の注文、サンプルの収集と分離、核酸分析、バイオインフォマティクス、臨床的解釈、CRIS での報告、遺伝カウンセリング、および研究ツールとしてのゲノミクスの効果的な使用のサポートを含むプログラムによる取り組み学内プログラム全体。 遺伝子検査の結果とデータ (要求に応じて) は、特定の参加者が共同登録されているプロトコルの研究チームと共有されます。 全体として、プロセスの標準化が進むことで、データの整合性と効率性がサポートされると同時に、研究者の柔軟性のニーズにも対応できます。
研究の種類
研究の種類
入学 (推定)
入学
連絡先と場所
研究連絡先
研究連絡先
- 名前：Morgan N Similuk
- 電話番号：(301) 435-6691
- メール：morgan.similuk@nih.gov
研究場所
-
-
District of Columbia
-
Washington D.C.、District of Columbia、アメリカ、20010
- 募集
- Children's National Health System
-
コンタクト：
- Michael Keller, MD
- 電話番号：202-476-5843
- メール：mkeller@childrensnational.org
-
-
Maryland
-
Bethesda、Maryland、アメリカ、20892
- 募集
- National Institutes of Health Clinical Center
-
コンタクト：
- For more information at the NIH Clinical Center contact Office of Patient Recruitment (OPR)
- 電話番号：TTY dial 711 800-411-1222
- メール：ccopr@nih.gov
-
-
参加基準
適格基準
適格基準
就学可能な年齢
健康ボランティアの受け入れ
サンプリング方法
調査対象母集団
説明
- 参加者の参加基準:
次の基準のいずれかを満たす必要があります。
- 発端者の参加者：一緒に登録されている別のNIHプロトコルによって調査中の疾患を持っている必要があります。
- 生物学的近親者：発端者の参加者と生物学的に関連があり、別のNIHプロトコルで調査中の疾患を持っていません。
- 健康なボランティア：発端者の参加者とは無関係であり、別のNIHプロトコルで調査中の疾患を持っていません。
- 0 ～ 99 歳。
- 参加者は、遺伝子検査を受ける意思がある必要があります。
- 参加者は、将来の研究のためにサンプルを保存することに同意する必要があります。
- 参加者は、匿名化されたゲノムデータを喜んで共有する必要があります。たとえば、遺伝子型および表現型のデータベース (dbGaP) などのアクセス制御データベースで共有する必要があります。
- 成人の健康なボランティアは、インフォームド コンセントを提供できなければなりません。
参加者の除外基準:
研究者の意見では、この研究への参加を禁忌とする状態は、除外の理由です。
共同登録のガイドライン:
発端者は、別の NIH (NIH CC または CNHS のいずれか) プロトコルに、臨床および研究評価を実施するための主要なプロトコルとして登録する必要があります。 発端者の近親者は、別の NIH プロトコルに登録されているかどうかにかかわらず、このプロトコルに登録できます。 ただし、他の NIH プロトコルを使用しており、それらのプロトコルで慎重な表現型検査を受けている親族を優先して登録する場合があります。 明らかに健康な参加者であっても、慎重な表現型解析が重要です。 一次研究チームは参加者の表現型を特徴付けるのに最適であるため、共同登録された親戚の表現型は一次プロトコルで実行されます。
サブスタディの選択基準:
- 14～99歳。
- 英語力。
- -インフォームドコンセントを提供する能力。
サブスタディの除外基準:
- -過去にこのプロトコルから肯定的な遺伝的結果を受けています。
- -調査官の意見では、このサブスタディへの参加を禁忌とする状態。
研究計画
研究はどのように設計されていますか？
デザインの詳細
- 観測モデル：家族ベース
- 時間の展望：見込みのある
グループ/コホートの数
コホートと介入
グループ/コホートグループ/コホート |
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生物学的近親者
発端者の生物学的近親者。発端者の参照プロトコルに共同登録されている場合とされていない場合があります。
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健康なボランティア
内部統制の選択
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発端者
-NIHまたはCNHSのいずれかに登録されている別のNIAIDプロトコルによって調査中の疾患を持つ参加者。
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この研究は何を測定していますか？
主要な結果の測定
主要な結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
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免疫疾患に関連する新たな遺伝的欠陥の特定
時間枠：ゲノムデータ解析時
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免疫疾患に関連する新たな遺伝的欠陥の特定
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ゲノムデータ解析時
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確立された遺伝的欠陥に関連する新しい臨床表現型の特定
時間枠：ゲノムデータ解析時
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確立された遺伝的欠陥に関連する新しい臨床表現型の特定
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ゲノムデータ解析時
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確立された免疫系の遺伝性疾患の特定
時間枠：ゲノムデータ解析時
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確立された免疫系の遺伝性疾患、および場合によっては免疫系以外の既知の遺伝性疾患の特定
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ゲノムデータ解析時
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二次結果の測定
二次結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
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このプロトコルおよび関連プログラムで臨床ゲノム サービスを改善する方法の証拠ベース。
時間枠：5.1.1.登録/ベースラインレポートの理解度調査と半構造化電話インタビュー
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このプロトコルの下で実行される臨床ゲノミクスおよび遺伝カウンセリング サービスのプロセスと結果の研究。
これらの研究では、調査、インタビュー、およびその他の社会的および行動的研究方法を使用して、研究参加者から、彼らの状態とこのプロトコルへの参加に関連する認識、経験、および態度に関するデータを収集します。
これらの追加研究の目的は、プロトコル 17-I-0122 に基づいて提供されるサービスを改善し、同様の研究を行っている他の研究者のための証拠を作成することです。
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5.1.1.登録/ベースラインレポートの理解度調査と半構造化電話インタビュー
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協力者と研究者
スポンサー
スポンサー
協力者
協力者
捜査官
捜査官
- 主任研究者：Morgan N Similuk、National Institute of Allergy and Infectious Diseases (NIAID)
出版物と役立つリンク
一般刊行物
- Similuk MN, Yan J, Ghosh R, Oler AJ, Franco LM, Setzer MR, Kamen M, Jodarski C, DiMaggio T, Davis J, Gore R, Jamal L, Borges A, Gentile N, Niemela J, Lowe C, Jevtich K, Yu Y, Hullfish H, Hsu AP, Hong C, Littel P, Seifert BA, Milner J, Johnston JJ, Cheng X, Li Z, Veltri D, Huang K, Kaladi K, Barnett J, Zhang L, Vlasenko N, Fan Y, Karlins E, Ganakammal SR, Gilmore R, Tran E, Yun A, Mackey J, Yazhuk S, Lack J, Kuram V, Cao W, Huse S, Frank K, Fahle G, Rosenzweig S, Su Y, Hwang S, Bi W, Bennett J, Myles IA, De Ravin SS, Fuss I, Strober W, Bielekova B, Almeida de Jesus A, Goldbach-Mansky R, Williamson P, Kumar K, Dempsy C, Frischmeyer-Guerrerio P, Fisch R, Bolan H, Metcalfe DD, Komarow H, Carter M, Druey KM, Sereti I, Dropulic L, Klion AD, Khoury P, O' Connell EM, Holland-Thomas NC, Brown T, McDermott DH, Murphy PM, Bundy V, Keller MD, Peng C, Kim H, Norman S, Delmonte OM, Kang E, Su HC, Malech H, Freeman A, Zerbe C, Uzel G, Bergerson JRE, Rao VK, Olivier KN, Lyons JJ, Lisco A, Cohen JI, Lionakis MS, Biesecker LG, Xirasagar S, Notarangelo LD, Holland SM, Walkiewicz MA. Clinical exome sequencing of 1000 families with complex immune phenotypes: Toward comprehensive genomic evaluations. J Allergy Clin Immunol. 2022 Oct;150(4):947-954. doi: 10.1016/j.jaci.2022.06.009. Epub 2022 Jun 24.
- Zainab R, Kaur S, Lack J, Similuk M, Tandon M, Ghosh R, Seifert BA, Tokita M, Flippo C, Yan J, Walkiewicz M, Chittiboina P, Tatsi C. Genetic evaluation of pediatric pituitary adenomas and USP8-related genotype-phenotype correlations in Cushing's disease. Pituitary. 2025 Aug 14;28(5):92. doi: 10.1007/s11102-025-01557-6.
- Beers BJ, Similuk MN, Ghosh R, Seifert BA, Jamal L, Kamen M, Setzer MR, Jodarski C, Duncan R, Hunt D, Mixer M, Cao W, Bi W, Veltri D, Karlins E, Zhang L, Li Z, Oler AJ, Jevtich K, Yu Y, Hullfish H, Bielekova B, Frischmeyer-Guerrerio P, Dang Do A, Huryn LA, Olivier KN, Su HC, Lyons JJ, Zerbe CS, Rao VK, Keller MD, Freeman AF, Holland SM, Franco LM, Walkiewicz MA, Yan J. Chromosomal microarray analysis supplements exome sequencing to diagnose children with suspected inborn errors of immunity. Front Immunol. 2023 May 5;14:1172004. doi: 10.3389/fimmu.2023.1172004. eCollection 2023.
- Ferre EMN, Yu Y, Oikonomou V, Hilfanova A, Lee CR, Rosen LB, Burbelo PD, Vazquez SE, Anderson MS, Barocha A, Heller T, Soldatos A, Holland SM, Walkiewicz MA, Lionakis MS. Case report: Discovery of a de novo FAM111B pathogenic variant in a patient with an APECED-like clinical phenotype. Front Immunol. 2023 Feb 17;14:1133387. doi: 10.3389/fimmu.2023.1133387. eCollection 2023.
研究記録日
主要日程の研究
研究開始 (実際)
研究開始
一次修了 (推定)
一次修了
研究の完了 (推定)
研究の完了
試験登録日
最初に提出
最初に提出
QC基準を満たした最初の提出物
QC基準を満たした最初の提出物
最初の投稿 (実際)
最初の投稿
学習記録の更新
投稿された最後の更新 (実際)
投稿された最後の更新
QC基準を満たした最後の更新が送信されました
QC基準を満たした最後の更新が送信されました
最終確認日
最終確認日
詳しくは
本研究に関する用語
追加の関連 MeSH 用語
その他の研究ID番号
その他の研究ID番号
- 170122
- 17-I-0122
個々の参加者データ (IPD) の計画
個々の参加者データ (IPD) を共有する予定はありますか?
IPD プランの説明
医薬品およびデバイス情報、研究文書
米国FDA規制医薬品の研究
米国FDA規制機器製品の研究
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