NIAID gecentraliseerd sequentieprotocol
Achtergrond:
Genetische testen genaamd "sequencing" helpen onderzoekers om naar DNA te kijken. Genen zijn gemaakt van DNA en zijn de instructies voor ons lichaam om te functioneren. We hebben allemaal duizenden genen. DNA-varianten zijn verschillen in genen tussen twee mensen. We hebben allemaal heel veel varianten. De meeste zijn onschadelijk en sommige veroorzaken verschillen zoals blauwe of bruine ogen. Enkele varianten kunnen gezondheidsproblemen veroorzaken.
Objectief:
De genetica van immuunstoornissen begrijpen, verschillende gezondheidsproblemen, evenals de resultaten van klinische genomica en genetische adviesdiensten die onder dit protocol worden uitgevoerd.
Geschiktheid:
Deelnemers aan andere NIH-onderzoeksprotocollen voor menselijke proefpersonen - hetzij in het NIH Clinical Center (CC) of bij Children's National Health System (CNHS) - (leeftijd 0-99 jaar), en, in geselecteerde gevallen, hun biologische familieleden
Ontwerp:
Onderzoekers zullen het DNA van de deelnemer bestuderen dat is geëxtraheerd uit bloed, speeksel of een ander weefselmonster, inclusief eerder verzamelde monsters die we mogelijk bij de NIH hebben opgeslagen. Onderzoekers kijken tot in detail naar het DNA van de deelnemer. We zoeken naar verschillen in de DNA-volgorde of -structuur tussen deelnemers en andere mensen.
Deelnemers ontvangen resultaten die:
- Zijn belangrijk voor hun gezondheid
- Zijn bevestigd in een klinisch laboratorium
- Suggereer dat ze risico lopen op een ernstige ziekte die uw huidige of toekomstige medische behandeling kan beïnvloeden.
Sommige genetische informatie die we aan deelnemers teruggeven, kan van onzeker belang zijn.
Als de genetische testresultaten geen verband houden met de NIH-evaluaties van de deelnemer, zullen we doorgaans niet rapporteren:
- Normale varianten
- Informatie over progressieve, dodelijke aandoeningen waarvoor geen effectieve behandeling bestaat
- Dragerschap (aandoeningen die u niet heeft maar wel kunt doorgeven)
De monsters en gegevens worden bewaard voor toekomstig onderzoek.
Persoonlijke gegevens worden zo privé mogelijk gehouden.
Als toekomstige studies nieuwe informatie nodig hebben, kunnen deelnemers worden gecontacteerd.
Studie Overzicht
Toestand
Toestand
Conditie
Conditie
Gedetailleerde beschrijving
Studieontwerp: dit onderzoek dient als een gecentraliseerd sequentieprotocol voor NIH-onderzoeksstudies met menselijke proefpersonen om standaardisatie te vergemakkelijken en de opbouw van genotype- en fenotypegegevens voor deelnemende programma's te consolideren. Deelnemers aan andere NIH-onderzoeken, zowel bij de NIH CC als bij de CNHS, die genetische tests omvatten, kunnen zich inschrijven voor dit protocol en genetische tests zullen onder dit worden uitgevoerd
studie.
Doelstelling: Primair: bewijsmateriaal genereren en analyseren met betrekking tot de genetische bijdrage aan diverse immuunziekten en andere gezondheidsproblemen
aandoeningen bestudeerd door het intramurale onderzoeksprogramma (IRP) van de NIH.
Secundair: bewijsmateriaal genereren en analyseren met betrekking tot de processen en resultaten van de klinische genomica en genetica
begeleidingsdiensten uitgevoerd onder dit protocol.
Eindpunt: Primair: Discrete genetische bijdragen aan immuunziekten en andere gezondheidsproblemen, inclusief expliciet:
Gevestigde genetische aandoeningen.
Nieuwe genetische defecten.
Nieuwe fenotypes geassocieerd met gevestigde genetica
stoornissen.
Secundair: bewijsbasis voor het verbeteren van klinische genomische diensten op dit protocol en gerelateerde programma's.
NAUWKEURIG
Onderzoekers van het National Institute of Allergy and Infectious Diseases (NIAID) gebruiken sequencing-technologieën van de volgende generatie om genetische bijdragen aan immuunziekten te helpen bepalen. Deze inspanningen hebben het aantal moleculaire diagnoses voor een subset van NIAID verhoogd
deelnemers evenals ontdekte fundamentele inzichten in de cellulaire en signaalroutes in gastheerverdediging en immuunregulatie.
Ondanks deze successen blijft de analyse en interpretatie van genomische gegevens een substantiële uitdaging. Onderzoekers begrijpen simpelweg de functionele en klinische gevolgen van de meeste menselijke genetische variatie niet. Dit geldt voor het NIAID en voor het hele intramurale onderzoeksprogramma. Vooruitgang boeken op dit gebied vereist een gecoördineerde, systematische en transparante aanpak
klinisch genomics onderzoek.
Dit protocol is specifiek voor genetische tests en heeft expliciet tot doel zowel de klinische zorg te versterken als het onderzoek te verbeteren in de deelnemende programma's van de NIH. Probands zullen biologische monsters leveren voor genetische tests en zullen moeten worden ingeschreven volgens een primair protocol, dat de primaire klinische en onderzoeksevaluaties zal uitvoeren. Dit protocol dient als vehikel voor een
programmatische inspanningen, waaronder gestandaardiseerde fenotypering, het bestellen van tests via het Clinical Research Information System (CRIS), het verzamelen en isoleren van monsters, nucleïnezuuranalyse, bioinformatica, klinische interpretatie, rapportage in CRIS, genetische counseling en ondersteuning van effectief gebruik van genomica als onderzoeksinstrument gedurende het hele intramurale programma. Genetische testresultaten en gegevens (op verzoek) zullen worden gedeeld met de onderzoeksteams voor protocollen waarop een bepaalde deelnemer mede-ingeschreven is. Over het algemeen zal een grotere processtandaardisatie de gegevensintegriteit en -efficiëntie ondersteunen, terwijl er nog steeds wordt voorzien in de behoefte aan flexibiliteit van de onderzoeker.
Studietype
Studietype
Inschrijving (Geschat)
Inschrijving
Contacten en locaties
Studiecontact
Studiecontact
- Naam: Morgan N Similuk
- Telefoonnummer: (301) 435-6691
- E-mail: morgan.similuk@nih.gov
Studie Locaties
-
-
District of Columbia
-
Washington D.C., District of Columbia, Verenigde Staten, 20010
- Werving
- Children's National Health System
-
Contact:
- Michael Keller, MD
- Telefoonnummer: 202-476-5843
- E-mail: mkeller@childrensnational.org
-
-
Maryland
-
Bethesda, Maryland, Verenigde Staten, 20892
- Werving
- National Institutes of Health Clinical Center
-
Contact:
- For more information at the NIH Clinical Center contact Office of Patient Recruitment (OPR)
- Telefoonnummer: TTY dial 711 800-411-1222
- E-mail: ccopr@nih.gov
-
-
Deelname Criteria
Geschiktheidscriteria
Geschiktheidscriteria
Leeftijden die in aanmerking komen voor studie
Accepteert gezonde vrijwilligers
Bemonsteringsmethode
Studie Bevolking
Beschrijving
- DEELNEMER INCLUSIEF CRITERIA:
Moet voldoen aan een van de volgende criteria:
- Proband-deelnemers: moeten een ziekte hebben die wordt onderzocht door een ander NIH-protocol waarop ze mede zijn ingeschreven.
- Biologische verwanten: biologisch verwant aan een proefpersoon, en heeft geen ziekte die wordt onderzocht in een ander NIH-protocol.
- Gezonde vrijwilligers: niet verwant aan een proefpersoon, en heeft geen ziekte die wordt onderzocht in een ander NIH-protocol.
- Leeftijd 0-99 jaar.
- Deelnemers moeten bereid zijn om genetisch onderzoek te ondergaan.
- Deelnemers moeten bereid zijn om monsters te laten opslaan voor toekomstig onderzoek.
- Deelnemers moeten bereid zijn om hun geanonimiseerde genomische gegevens te laten delen, bijvoorbeeld in databases met gecontroleerde toegang, zoals de Database of Genotypes and Phenotypes (dbGaP).
- Volwassen gezonde vrijwilligers moeten geïnformeerde toestemming kunnen geven.
UITSLUITINGSCRITERIA DEELNEMER:
Elke aandoening die naar de mening van de onderzoeker een contra-indicatie vormt voor deelname aan dit onderzoek, is een reden voor uitsluiting.
Richtlijnen voor mede-inschrijving:
Probands moeten zijn ingeschreven bij een andere NIH - hetzij bij het NIH CC- of CNHS - protocol als hun primaire protocol voor het uitvoeren van klinische en onderzoeksevaluaties. Familieleden van probands kunnen in dit protocol worden opgenomen, ongeacht of de familieleden al dan niet zijn ingeschreven in een ander NIH-protocol. We kunnen echter prioriteit geven aan het inschrijven van familieleden die andere NIH-protocollen gebruiken en die een zorgvuldige fenotypering op die protocollen hebben ondergaan. Zorgvuldige fenotypering is belangrijk, ook voor deelnemers die ogenschijnlijk gezond zijn. Omdat het primaire onderzoeksteam het meest geschikt is om de fenotypes van hun deelnemers te karakteriseren, zal fenotypering van mede-ingeschreven familieleden worden uitgevoerd op de primaire protocollen.
SUBSTUDIE INCLUSIECRITERIA:
- Leeftijd 14-99 jaar.
- Engelse taalvaardigheid.
- Mogelijkheid om geïnformeerde toestemming te geven.
SUBSTUDIE UITSLUITINGSCRITERIA:
- In het verleden positieve genetische resultaten van dit protocol hebben ontvangen.
- Elke aandoening die naar het oordeel van de onderzoeker een contra-indicatie vormt voor deelname aan dit deelonderzoek.
Studie plan
Hoe is de studie opgezet?
Ontwerpdetails
- Observatiemodellen: Op familie gebaseerd
- Tijdsperspectieven: Prospectief
Aantal groepen / cohorten
Cohorten en interventies
Groep / CohortGroep / Cohort |
|---|
|
Biologische verwanten
Biologische verwanten van probands, die al dan niet ook mede-ingeschreven zijn in het verwijzingsprotocol van de proband.
|
|
Gezonde vrijwilligers
Selecteer interne controles
|
|
Probands
Deelnemers met een ziekte die wordt onderzocht door een ander NIAID-protocol waarop ze zijn ingeschreven, hetzij bij de NIH of CNHS.
|
Wat meet het onderzoek?
Primaire uitkomstmaten
Primaire uitkomstmaten
Uitkomstmaat |
Maatregel Beschrijving |
Tijdsspanne |
|---|---|---|
|
Identificatie van nieuwe genetische defecten geassocieerd met immuunstoornissen
Tijdsspanne: Na analyse van genomische gegevens
|
Identificatie van nieuwe genetische defecten geassocieerd met immuunstoornissen
|
Na analyse van genomische gegevens
|
|
Identificatie van nieuwe klinische fenotypes geassocieerd met vastgestelde genetische defecten
Tijdsspanne: Na analyse van genomische gegevens
|
Identificatie van nieuwe klinische fenotypes geassocieerd met vastgestelde genetische defecten
|
Na analyse van genomische gegevens
|
|
Het identificeren van gevestigde genetische aandoeningen van het immuunsysteem
Tijdsspanne: Na analyse van genomische gegevens
|
Het identificeren van gevestigde genetische aandoeningen van het immuunsysteem, evenals in sommige gevallen bekende genetische aandoeningen buiten het immuunsysteem
|
Na analyse van genomische gegevens
|
Secundaire uitkomstmaten
Secundaire uitkomstmaten
Uitkomstmaat |
Maatregel Beschrijving |
Tijdsspanne |
|---|---|---|
|
Evidence base voor het verbeteren van klinische genomische diensten op dit protocol en aanverwante programma's.
Tijdsspanne: 5.1.1. Enrollment/baseline rapport begripsenquête en semi-gestructureerde telefonische interviews
|
Studies van de processen en resultaten van de klinische genomica- en genetische adviesdiensten die onder dit protocol worden uitgevoerd.
Deze studies zullen enquêtes, interviews en andere sociale en gedragsonderzoeksmethoden gebruiken om gegevens van studiedeelnemers te verzamelen over hun percepties, ervaringen en attitudes met betrekking tot hun toestand en deelname aan dit protocol.
Het doel van deze aanvullende onderzoeken is om de diensten die worden geleverd onder protocol 17-I-0122 te verbeteren en om een bewijsbasis te genereren voor andere onderzoekers die soortgelijke onderzoeken uitvoeren.
|
5.1.1. Enrollment/baseline rapport begripsenquête en semi-gestructureerde telefonische interviews
|
Medewerkers en onderzoekers
Sponsor
Sponsor
Medewerkers
Medewerkers
Onderzoekers
Onderzoekers
- Hoofdonderzoeker: Morgan N Similuk, National Institute of Allergy and Infectious Diseases (NIAID)
Publicaties en nuttige links
Algemene publicaties
- Similuk MN, Yan J, Ghosh R, Oler AJ, Franco LM, Setzer MR, Kamen M, Jodarski C, DiMaggio T, Davis J, Gore R, Jamal L, Borges A, Gentile N, Niemela J, Lowe C, Jevtich K, Yu Y, Hullfish H, Hsu AP, Hong C, Littel P, Seifert BA, Milner J, Johnston JJ, Cheng X, Li Z, Veltri D, Huang K, Kaladi K, Barnett J, Zhang L, Vlasenko N, Fan Y, Karlins E, Ganakammal SR, Gilmore R, Tran E, Yun A, Mackey J, Yazhuk S, Lack J, Kuram V, Cao W, Huse S, Frank K, Fahle G, Rosenzweig S, Su Y, Hwang S, Bi W, Bennett J, Myles IA, De Ravin SS, Fuss I, Strober W, Bielekova B, Almeida de Jesus A, Goldbach-Mansky R, Williamson P, Kumar K, Dempsy C, Frischmeyer-Guerrerio P, Fisch R, Bolan H, Metcalfe DD, Komarow H, Carter M, Druey KM, Sereti I, Dropulic L, Klion AD, Khoury P, O' Connell EM, Holland-Thomas NC, Brown T, McDermott DH, Murphy PM, Bundy V, Keller MD, Peng C, Kim H, Norman S, Delmonte OM, Kang E, Su HC, Malech H, Freeman A, Zerbe C, Uzel G, Bergerson JRE, Rao VK, Olivier KN, Lyons JJ, Lisco A, Cohen JI, Lionakis MS, Biesecker LG, Xirasagar S, Notarangelo LD, Holland SM, Walkiewicz MA. Clinical exome sequencing of 1000 families with complex immune phenotypes: Toward comprehensive genomic evaluations. J Allergy Clin Immunol. 2022 Oct;150(4):947-954. doi: 10.1016/j.jaci.2022.06.009. Epub 2022 Jun 24.
- Zainab R, Kaur S, Lack J, Similuk M, Tandon M, Ghosh R, Seifert BA, Tokita M, Flippo C, Yan J, Walkiewicz M, Chittiboina P, Tatsi C. Genetic evaluation of pediatric pituitary adenomas and USP8-related genotype-phenotype correlations in Cushing's disease. Pituitary. 2025 Aug 14;28(5):92. doi: 10.1007/s11102-025-01557-6.
- Beers BJ, Similuk MN, Ghosh R, Seifert BA, Jamal L, Kamen M, Setzer MR, Jodarski C, Duncan R, Hunt D, Mixer M, Cao W, Bi W, Veltri D, Karlins E, Zhang L, Li Z, Oler AJ, Jevtich K, Yu Y, Hullfish H, Bielekova B, Frischmeyer-Guerrerio P, Dang Do A, Huryn LA, Olivier KN, Su HC, Lyons JJ, Zerbe CS, Rao VK, Keller MD, Freeman AF, Holland SM, Franco LM, Walkiewicz MA, Yan J. Chromosomal microarray analysis supplements exome sequencing to diagnose children with suspected inborn errors of immunity. Front Immunol. 2023 May 5;14:1172004. doi: 10.3389/fimmu.2023.1172004. eCollection 2023.
- Ferre EMN, Yu Y, Oikonomou V, Hilfanova A, Lee CR, Rosen LB, Burbelo PD, Vazquez SE, Anderson MS, Barocha A, Heller T, Soldatos A, Holland SM, Walkiewicz MA, Lionakis MS. Case report: Discovery of a de novo FAM111B pathogenic variant in a patient with an APECED-like clinical phenotype. Front Immunol. 2023 Feb 17;14:1133387. doi: 10.3389/fimmu.2023.1133387. eCollection 2023.
Nuttige links
Studie record data
Bestudeer belangrijke data
Studie start (Werkelijk)
Studie start
Primaire voltooiing (Geschat)
Primaire voltooiing
Studie voltooiing (Geschat)
Studie voltooiing
Studieregistratiedata
Eerst ingediend
Eerst ingediend
Eerst ingediend dat voldeed aan de QC-criteria
Eerst ingediend dat voldeed aan de QC-criteria
Eerst geplaatst (Werkelijk)
Eerst geplaatst
Updates van studierecords
Laatste update geplaatst (Werkelijk)
Laatste update geplaatst
Laatste update ingediend die voldeed aan QC-criteria
Laatste update ingediend die voldeed aan QC-criteria
Laatst geverifieerd
Laatst geverifieerd
Meer informatie
Termen gerelateerd aan deze studie
Trefwoorden
Aanvullende relevante MeSH-voorwaarden
Andere studie-ID-nummers
Andere studie-ID-nummers
- 170122
- 17-I-0122
Plan Individuele Deelnemersgegevens (IPD)
Bent u van plan om gegevens van individuele deelnemers (IPD) te delen?
Beschrijving IPD-plan
Informatie over medicijnen en apparaten, studiedocumenten
Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd geneesmiddel
Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd apparaatproduct
Deze informatie is zonder wijzigingen rechtstreeks van de website clinicaltrials.gov gehaald. Als u verzoeken heeft om uw onderzoeksgegevens te wijzigen, te verwijderen of bij te werken, neem dan contact op met register@clinicaltrials.gov. Zodra er een wijziging wordt doorgevoerd op clinicaltrials.gov, wordt deze ook automatisch bijgewerkt op onze website .
Klinische onderzoeken op Primaire immunodeficiëntie
-
NCT02196064VoltooidHuman Immunodeficiency Virus (HIV) Hepatitis C Virus (HCV) Co-geïnfecteerde proefpersonen
-
NCT04768517WervingHepatitis C-virusinfectie | Hepatitis C-virusinfectie, reactie op therapie van | Human Immunodeficiency Virus (HIV) co-infectie