Protocollo di sequenziamento centralizzato NIAID
Sfondo:
I test genetici chiamati "sequenziamento" aiutano i ricercatori a esaminare il DNA. I geni sono fatti di DNA e sono le istruzioni per il funzionamento del nostro corpo. Abbiamo tutti migliaia di geni. Le varianti del DNA sono differenze nei geni tra due persone. Abbiamo tutti un sacco di varianti. La maggior parte sono innocui e alcuni causano differenze come gli occhi blu o marroni. Alcune varianti possono causare problemi di salute.
Obbiettivo:
Comprendere la genetica dei disturbi immunitari di varie condizioni di salute, nonché i risultati della genomica clinica e dei servizi di consulenza genetica svolti nell'ambito di questo protocollo.
Eleggibilità:
Partecipanti ad altri protocolli di ricerca su soggetti umani NIH - presso il Centro Clinico NIH (CC) o presso il Sistema Sanitario Nazionale dei Bambini (CNHS) - (di età compresa tra 0 e 99 anni) e, in casi selezionati, i loro parenti biologici
Progetto:
I ricercatori studieranno il DNA dei partecipanti estratto dal sangue, dalla saliva o da un altro campione di tessuto, compresi i campioni raccolti in precedenza che potremmo aver conservato presso l'NIH. I ricercatori esamineranno il DNA dei partecipanti in modo molto dettagliato. Cerchiamo differenze nella sequenza o nella struttura del DNA tra i partecipanti e le altre persone.
I partecipanti riceveranno risultati che:
- Sono importanti per la loro salute
- Sono stati confermati in un laboratorio clinico
- Suggerisci che potrebbero essere a rischio di malattie gravi che potrebbero influire sulla tua gestione medica attuale o futura.
Alcune informazioni genetiche che restituiamo ai partecipanti possono essere di importanza incerta.
Se i risultati dei test genetici non sono correlati alle valutazioni NIH del partecipante, in genere non riporteremo:
- Varianti normali
- Informazioni su condizioni progressive e fatali che non hanno un trattamento efficace
- Stato di vettore (condizioni che non hai ma che potresti trasmettere)
I campioni e i dati verranno salvati per ricerche future.
I dati personali saranno mantenuti il più privati possibile.
Se studi futuri necessitano di nuove informazioni, i partecipanti possono essere contattati.
Panoramica dello studio
Stato
Stato
Condizioni
Condizioni
Descrizione dettagliata
Disegno dello studio: questo studio funge da protocollo di sequenziamento centralizzato per gli studi di ricerca sui soggetti umani NIH per facilitare la standardizzazione e consolidare l'accumulo di dati di genotipo e fenotipo per i programmi partecipanti. I partecipanti ad altri studi NIH sia presso il NIH CC che il CNHS che includono test genetici possono iscriversi a questo protocollo e i test genetici saranno condotti in base a questo
studia.
Obiettivo: Primario: generare e analizzare prove riguardanti il contributo genetico a diverse malattie immunitarie e altre condizioni di salute
condizioni studiate dal programma di ricerca intramurale NIH (IRP).
Secondario: generare e analizzare prove relative ai processi e ai risultati della genomica clinica e genetica
servizi di consulenza svolti nell'ambito di questo protocollo.
Endpoint: Primario: contributi genetici discreti alle malattie immunitarie e ad altre condizioni di salute, che includono esplicitamente:
Malattie genetiche accertate.
Nuovi difetti genetici.
Nuovi fenotipi associati a genetica stabilita
disturbi.
Secondario: base di prove su come migliorare i servizi di genomica clinica su questo protocollo e sui programmi correlati.
PRECIS
I ricercatori del National Institute of Allergy and Infectious Diseases (NIAID) utilizzano tecnologie di sequenziamento di nuova generazione per aiutare a determinare i contributi genetici alle malattie immunitarie. Questi sforzi hanno aumentato i tassi di diagnosi molecolare per un sottogruppo di NIAID
partecipanti e hanno scoperto informazioni fondamentali sui percorsi cellulari e di segnalazione nella difesa dell'ospite e nella regolazione immunitaria.
Nonostante questi successi, l'analisi e l'interpretazione dei dati genomici rimangono una sfida sostanziale. Semplicemente, i ricercatori non comprendono le conseguenze funzionali e cliniche della maggior parte delle variazioni genetiche umane. Questo è vero al NIAID e in tutto il programma di ricerca intramurale. Fare progressi in questo settore richiede un approccio coordinato, sistematico e trasparente
ricerca genomica clinica.
Questo protocollo è specifico per i test genetici e mira esplicitamente sia a rafforzare l'assistenza clinica sia a migliorare la ricerca durante i programmi partecipanti al NIH. I probandi forniranno campioni biologici per i test genetici e dovranno essere iscritti a un protocollo primario, che eseguirà le valutazioni cliniche e di ricerca primarie. Questo protocollo funge da veicolo per a
sforzo programmatico che include la fenotipizzazione standardizzata, l'ordinazione dei test attraverso il Clinical Research Information System (CRIS), la raccolta e l'isolamento dei campioni, l'analisi degli acidi nucleici, la bioinformatica, l'interpretazione clinica, la segnalazione in CRIS, la consulenza genetica e il supporto dell'uso efficace della genomica come strumento di ricerca durante tutto il programma intramurale. I risultati e i dati dei test genetici (su richiesta) saranno condivisi con i gruppi di ricerca per i protocolli su cui un determinato partecipante è co-iscritto. Nel complesso, una maggiore standardizzazione dei processi supporterà l'integrità e l'efficienza dei dati, pur soddisfacendo l'esigenza di flessibilità degli investigatori.
Tipo di studio
Tipo di studio
Iscrizione (Stimato)
Iscrizione
Contatti e Sedi
Contatto studio
Contatto studio
- Nome: Morgan N Similuk
- Numero di telefono: (301) 435-6691
- Email: morgan.similuk@nih.gov
Luoghi di studio
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District of Columbia
-
Washington D.C., District of Columbia, Stati Uniti, 20010
- Reclutamento
- Children's National Health System
-
Contatto:
- Michael Keller, MD
- Numero di telefono: 202-476-5843
- Email: mkeller@childrensnational.org
-
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Maryland
-
Bethesda, Maryland, Stati Uniti, 20892
- Reclutamento
- National Institutes of Health Clinical Center
-
Contatto:
- For more information at the NIH Clinical Center contact Office of Patient Recruitment (OPR)
- Numero di telefono: TTY dial 711 800-411-1222
- Email: ccopr@nih.gov
-
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Criteri di partecipazione
Criteri di ammissibilità
Criteri di ammissibilità
Età idonea allo studio
Accetta volontari sani
Metodo di campionamento
Popolazione di studio
Descrizione
- CRITERI DI INCLUSIONE DEI PARTECIPANTI:
Deve soddisfare uno dei seguenti criteri:
- Partecipanti probandi: devono avere una malattia sotto indagine da un altro protocollo NIH su cui sono co-iscritti.
- Parenti biologici: biologicamente imparentati con un partecipante probando e non hanno una malattia oggetto di indagine in un altro protocollo NIH.
- Volontari sani: non imparentati con un partecipante probando e non hanno una malattia sotto inchiesta in un altro protocollo NIH.
- Età 0-99 anni.
- I partecipanti devono essere disposti a sottoporsi a test genetici.
- I partecipanti devono essere disposti a consentire la conservazione dei campioni per ricerche future.
- I partecipanti devono essere disposti a condividere i propri dati genomici anonimizzati, ad esempio in database ad accesso controllato come il Database of Genotypes and Phenotypes (dbGaP).
- I volontari sani adulti devono essere in grado di fornire il consenso informato.
CRITERI DI ESCLUSIONE DEI PARTECIPANTI:
Qualsiasi condizione che, a parere dello sperimentatore, controindica la partecipazione a questo studio è un motivo di esclusione.
Linee guida per la coiscrizione:
I probandi devono essere iscritti a un altro protocollo NIH - presso il NIH CC o CNHS - come protocollo principale per l'esecuzione di valutazioni cliniche e di ricerca. I parenti dei probandi possono essere iscritti a questo protocollo indipendentemente dal fatto che i parenti siano iscritti o meno a un altro protocollo NIH. Tuttavia, potremmo dare la priorità all'iscrizione di parenti che si trovano su altri protocolli NIH e che sono stati sottoposti a un'attenta fenotipizzazione su tali protocolli. Un'attenta fenotipizzazione è importante, anche per i partecipanti apparentemente sani. Poiché il gruppo di ricerca primario è più adatto a caratterizzare i fenotipi dei partecipanti, la fenotipizzazione dei parenti co-iscritti verrà eseguita sui protocolli primari.
CRITERI DI INCLUSIONE DEL SOTTOSTUDIO:
- Età compresa tra 14 e 99 anni.
- Conoscenza della lingua inglese.
- Capacità di fornire il consenso informato.
CRITERI DI ESCLUSIONE DEL SOTTOSTUDIO:
- Hanno ricevuto risultati genetici positivi da questo protocollo in passato.
- Qualsiasi condizione che, secondo l'opinione dello sperimentatore, controindica la partecipazione a questo sottostudio.
Piano di studio
Come è strutturato lo studio?
Dettagli di progettazione
- Modelli osservazionali: Basato sulla famiglia
- Prospettive temporali: Prospettiva
Numero di gruppi/coorti
Coorti e interventi
Gruppo / CoorteGruppo / Coorte |
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Parenti biologici
Parenti biologici di probandi, che possono o meno essere co-iscritti al protocollo di riferimento del probando.
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Volontari sani
Seleziona i controlli interni
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Probandi
Partecipanti con una malattia oggetto di indagine da parte di un altro protocollo NIAID su cui sono iscritti, presso l'NIH o il CNHS.
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Cosa sta misurando lo studio?
Misure di risultato primarie
Misure di risultato primarie
Misura del risultato |
Misura Descrizione |
Lasso di tempo |
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Identificazione di nuovi difetti genetici associati a disturbi immunitari
Lasso di tempo: Dopo l'analisi dei dati genomici
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Identificazione di nuovi difetti genetici associati a disturbi immunitari
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Dopo l'analisi dei dati genomici
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Identificazione di nuovi fenotipi clinici associati a difetti genetici accertati
Lasso di tempo: Dopo l'analisi dei dati genomici
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Identificazione di nuovi fenotipi clinici associati a difetti genetici accertati
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Dopo l'analisi dei dati genomici
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Identificare le malattie genetiche accertate del sistema immunitario
Lasso di tempo: Dopo l'analisi dei dati genomici
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Identificazione di malattie genetiche accertate del sistema immunitario, nonché di malattie genetiche note al di fuori del sistema immunitario in alcuni casi
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Dopo l'analisi dei dati genomici
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Misure di risultato secondarie
Misure di risultato secondarie
Misura del risultato |
Misura Descrizione |
Lasso di tempo |
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Base di prove su come migliorare i servizi di genomica clinica su questo protocollo e sui programmi correlati.
Lasso di tempo: 5.1.1. Sondaggio sulla comprensione del rapporto di riferimento/iscrizione e interviste telefoniche semi-strutturate
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Studi dei processi e dei risultati della genomica clinica e dei servizi di consulenza genetica svolti nell'ambito del presente protocollo.
Questi studi utilizzeranno sondaggi, interviste e altri metodi di ricerca sociale e comportamentale per raccogliere dati dai partecipanti allo studio sulle loro percezioni, esperienze e atteggiamenti relativi alla loro condizione e alla partecipazione a questo protocollo.
L'obiettivo di questi ulteriori studi sarà migliorare i servizi forniti nell'ambito del protocollo 17-I-0122 e generare una base di prove per altri ricercatori che conducono studi simili.
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5.1.1. Sondaggio sulla comprensione del rapporto di riferimento/iscrizione e interviste telefoniche semi-strutturate
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Collaboratori e investigatori
Sponsor
Sponsor
Collaboratori
Collaboratori
Investigatori
Investigatori
- Investigatore principale: Morgan N Similuk, National Institute of Allergy and Infectious Diseases (NIAID)
Pubblicazioni e link utili
Pubblicazioni generali
- Similuk MN, Yan J, Ghosh R, Oler AJ, Franco LM, Setzer MR, Kamen M, Jodarski C, DiMaggio T, Davis J, Gore R, Jamal L, Borges A, Gentile N, Niemela J, Lowe C, Jevtich K, Yu Y, Hullfish H, Hsu AP, Hong C, Littel P, Seifert BA, Milner J, Johnston JJ, Cheng X, Li Z, Veltri D, Huang K, Kaladi K, Barnett J, Zhang L, Vlasenko N, Fan Y, Karlins E, Ganakammal SR, Gilmore R, Tran E, Yun A, Mackey J, Yazhuk S, Lack J, Kuram V, Cao W, Huse S, Frank K, Fahle G, Rosenzweig S, Su Y, Hwang S, Bi W, Bennett J, Myles IA, De Ravin SS, Fuss I, Strober W, Bielekova B, Almeida de Jesus A, Goldbach-Mansky R, Williamson P, Kumar K, Dempsy C, Frischmeyer-Guerrerio P, Fisch R, Bolan H, Metcalfe DD, Komarow H, Carter M, Druey KM, Sereti I, Dropulic L, Klion AD, Khoury P, O' Connell EM, Holland-Thomas NC, Brown T, McDermott DH, Murphy PM, Bundy V, Keller MD, Peng C, Kim H, Norman S, Delmonte OM, Kang E, Su HC, Malech H, Freeman A, Zerbe C, Uzel G, Bergerson JRE, Rao VK, Olivier KN, Lyons JJ, Lisco A, Cohen JI, Lionakis MS, Biesecker LG, Xirasagar S, Notarangelo LD, Holland SM, Walkiewicz MA. Clinical exome sequencing of 1000 families with complex immune phenotypes: Toward comprehensive genomic evaluations. J Allergy Clin Immunol. 2022 Oct;150(4):947-954. doi: 10.1016/j.jaci.2022.06.009. Epub 2022 Jun 24.
- Zainab R, Kaur S, Lack J, Similuk M, Tandon M, Ghosh R, Seifert BA, Tokita M, Flippo C, Yan J, Walkiewicz M, Chittiboina P, Tatsi C. Genetic evaluation of pediatric pituitary adenomas and USP8-related genotype-phenotype correlations in Cushing's disease. Pituitary. 2025 Aug 14;28(5):92. doi: 10.1007/s11102-025-01557-6.
- Beers BJ, Similuk MN, Ghosh R, Seifert BA, Jamal L, Kamen M, Setzer MR, Jodarski C, Duncan R, Hunt D, Mixer M, Cao W, Bi W, Veltri D, Karlins E, Zhang L, Li Z, Oler AJ, Jevtich K, Yu Y, Hullfish H, Bielekova B, Frischmeyer-Guerrerio P, Dang Do A, Huryn LA, Olivier KN, Su HC, Lyons JJ, Zerbe CS, Rao VK, Keller MD, Freeman AF, Holland SM, Franco LM, Walkiewicz MA, Yan J. Chromosomal microarray analysis supplements exome sequencing to diagnose children with suspected inborn errors of immunity. Front Immunol. 2023 May 5;14:1172004. doi: 10.3389/fimmu.2023.1172004. eCollection 2023.
- Ferre EMN, Yu Y, Oikonomou V, Hilfanova A, Lee CR, Rosen LB, Burbelo PD, Vazquez SE, Anderson MS, Barocha A, Heller T, Soldatos A, Holland SM, Walkiewicz MA, Lionakis MS. Case report: Discovery of a de novo FAM111B pathogenic variant in a patient with an APECED-like clinical phenotype. Front Immunol. 2023 Feb 17;14:1133387. doi: 10.3389/fimmu.2023.1133387. eCollection 2023.
Collegamenti utili
Studiare le date dei record
Studia le date principali
Inizio studio (Effettivo)
Inizio studio
Completamento primario (Stimato)
Completamento primario
Completamento dello studio (Stimato)
Completamento dello studio
Date di iscrizione allo studio
Primo inviato
Primo inviato
Primo inviato che soddisfa i criteri di controllo qualità
Primo inviato che soddisfa i criteri di controllo qualità
Primo Inserito (Effettivo)
Primo Inserito
Aggiornamenti dei record di studio
Ultimo aggiornamento pubblicato (Effettivo)
Ultimo aggiornamento pubblicato
Ultimo aggiornamento inviato che soddisfa i criteri QC
Ultimo aggiornamento inviato che soddisfa i criteri QC
Ultimo verificato
Ultimo verificato
Maggiori informazioni
Termini relativi a questo studio
Parole chiave
Termini MeSH pertinenti aggiuntivi
Altri numeri di identificazione dello studio
Altri numeri di identificazione dello studio
- 170122
- 17-I-0122
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