ガンビアのヘリコバクター (パート 2)

この予備的な記述研究は、西アフリカのガンビアに住む子供と成人から得られたピロリ菌分離株間の遺伝子型の違いと類似性を評価する最初のデータを提供し、これらの違いの大きさを評価することを目的としています。 このプロトコルは、人口研究におけるヘリコバクター ピロリ分離のための低侵襲技術 (このプロジェクトの最初の部分で開発され、別のプロトコルである DMID プロトコル 06-0053 で説明されています) の適用について説明します。 研究対象者は西アフリカのガンビア在住者となります。 治療のための経鼻胃挿管を必要とする2歳未満の90人の子供と、これらの子供の健康な母親30人が研究される。 被験者は英国研究所の医学研究評議会（MRC）と西アフリカのガンビアのファハラにある臨床施設で研究される。 研究者らは、小児期の定着から成人の疾患状態への移行は、感染に対する宿主の反応によって部分的に引き起こされる、定着したヘリコバクター・ピロリ株自体の遺伝子型の進化を含む複数の要因の影響を受けると提案している。 研究者らは、ガンビアの子供たちから採取されたヘリコバクター・ピロリ菌株は、同じ地域社会から慢性的に定着した成人の菌株とは遺伝的に異なるだろうと仮説を立てている。 研究者らによる小児分離株と成人分離株の遺伝的および表現型の特徴付けは、これら2つの年齢層で流行している株間の根本的な違いを検査するもので、これはこのような高リスク社会における株選択および/またはゲノム進化の重要性を評価するのに役立つ可能性がある。 この研究の具体的な目的は、子供の株と成人の近親者からの株の関連性を評価することです。 研究手順には、入院患者による集中的な再栄養を受けている小児の乳児栄養目的で使用される経鼻胃管を介して胃液を吸引し、これらの吸引液およびサンプル提供の呼びかけに応じた親からのヘリコバクター・ピロリ菌を培養することが含まれる。この目的のために一時的に挿入された経鼻胃管を介して培養のための胃液を採取します。 ほとんどのジェノタイピングには、任意にプライミングされたポリメラーゼ連鎖反応 DNA フィンガープリンティング、特に密接に関連しているが同一ではないフィンガープリントを持つ分離株の場合の限定された (集中的な) DNA シーケンシング、およびメトロニダゾール感受性検査が伴います。 小児分離株と成人分離株の遺伝的および表現型の特徴付けは、これら 2 つの年齢層で流行している株間の基本的な違いをテストすることで、そのような高リスク社会における株選択および/またはゲノム進化の重要性を評価するのに役立ちます。 この 2 年間のプロジェクト中、被験者は 1 回だけ研究されます。 胃吸引液からヘリコバクター・ピロリが分離された場合、その子供の母親は、ヘリコバクター・ピロリ培養のための胃液の吸引液を採取するために、一度経鼻胃管を通すことに同意するかどうか尋ねられます。 得られた分離株は、DNA 分析と遺伝子型特定の対象となります。 これらの比較研究で取り上げられる特定の点には、同じ家族または村内の子供と成人から分離された菌株の直接比較が含まれます。 これは、自然に獲得されたヘリコバクター・ピロリ菌定着の早期発生率が高い社会で実施される最初の研究であり、同じ家族または村環境内の子供と成人からの分離株を直接比較することができ、以下の情報が得られる。家族内および地域内での感染伝播。 主な結果の尺度は、細菌分離株間の関連性の程度です。 これは、多型 DNA のランダム増幅 (RAPD) 結果間の視覚的比較、目的の対立遺伝子の遺伝子型の比較、そして STAR プログラムと複数の遺伝子座配列タイピングを使用して関連性の系統樹を構築するためのハウスキーピング遺伝子の配列決定によって最終的に評価されます ( MLST) データベース。 人間の被験者に対する結果の尺度はありません。