冈比亚的幽门螺杆菌（第 2 部分）

这项初步的描述性研究旨在提供第一批数据，以评估从生活在西非冈比亚的儿童和成人身上获得的幽门螺杆菌分离株之间基因型的差异和相似性，并评估这些差异的可能程度。 该协议描述了微创技术在幽门螺杆菌分离中的应用（在本项目的第一部分开发，并在单独的协议 DMID 协议 06-0053 中进行了描述）在人口研究中的应用。 研究对象将是西非冈比亚的居民。 将对 90 名 2 岁以下需要治疗性鼻胃管插管的儿童和这些儿童的 30 名健康母亲进行研究。 受试者将在位于西非冈比亚法哈拉的英国研究实验室和临床机构的医学研究委员会 (MRC) 进行研究。 研究人员提出，从儿童定植到成人疾病状态的转变受到多种因素的影响，包括定植的幽门螺杆菌菌株本身的基因型进化，部分是由宿主对感染的反应驱动的。 研究人员假设，来自冈比亚儿童的幽门螺杆菌菌株在基因上与来自同一社区的长期定植的成年人的菌株不同。 研究人员对儿童和成人分离株的遗传和表型特征将测试在这 2 个年龄组中传播的菌株之间的根本差异，这可能有助于评估菌株选择和/或基因组进化在此类高风险社会中的重要性。 本研究的具体目的是评估儿童菌株与成年近亲菌株的相关性。 研究程序将包括通过用于接受强化住院再营养的儿童的婴儿喂养鼻胃管吸取胃液，并从这些吸出物以及接受捐赠样本邀请的父母那里培养幽门螺杆菌通过为此目的临时插入的鼻胃管收集胃液进行培养。 大多数基因分型将需要任意引发的聚合酶链反应 DNA 指纹识别、有限（集中的）DNA 测序，特别是在分离株具有密切相关但不相同的指纹的情况下，以及甲硝唑药敏试验。 儿科和成人分离株的遗传和表型特征将测试在这两个年龄组中传播的菌株之间的根本差异，从而有助于评估菌株选择和/或基因组进化在此类高风险社会中的重要性。 在这个为期 2 年的项目中，主题将只被研究一次。 如果从胃抽吸物中分离出幽门螺杆菌，将询问该孩子的母亲是否同意通过鼻胃管一次获取胃液抽吸物用于幽门螺杆菌培养。 获得的分离株将进行 DNA 分析和基因分型。 这些比较研究要解决的具体问题将包括直接比较从同一家庭或村庄的儿童和成人身上分离出的菌株。 这将是第一项在自然获得性幽门螺杆菌定植的早期高发社会中进行的研究，并将允许对同一家庭或村庄环境中的儿童和成人分离株进行直接比较，这将提供有关信息家庭内和社区内的感染传播。 主要结果指标是细菌分离株之间的相关程度。 这将通过多态性 DNA 随机扩增 (RAPD) 结果之间的视觉比较、感兴趣的等位基因的基因型比较，以及通过使用 STAR 程序和多位点序列分型对管家基因进行测序以构建相关性的系统发育树来最终评估。 MLST) 数据库。 没有针对人类受试者的结果测量。