Helicobacter Gambiában (2. rész)

Ennek az előzetes leíró tanulmánynak az a célja, hogy megadja az első adatokat, amelyek értékelik a Gambiában (Nyugat-Afrika) élő gyermekektől és felnőttektől származó H. pylori izolátumok genotípusának különbségeit és hasonlóságait, és felmérik e különbségek valószínű nagyságát. Ez a protokoll a minimálisan invazív technikák alkalmazását írja le a H. pylori izolálására (amelyet a projekt első részében fejlesztettek ki, és egy külön protokollban, a 06-0053 számú DMID protokollban írták le) egy populációs vizsgálatban. A tanulmányi alanyok a nyugat-afrikai gambiai lakosok lesznek. Kilencven, 2 évnél fiatalabb, terápiás nasogasztrikus intubációt igénylő gyermeket és 30 egészséges anyát vizsgálnak meg. A tantárgyakat a Nagy-Britannia Kutatólaboratóriumainak és Klinikai Létesítményének Orvosi Kutatási Tanácsában (MRC) tanulmányozzák majd Fajara-ban, Gambia, Nyugat-Afrika. A kutatók azt javasolják, hogy a gyermekkori kolonizációból a felnőttkori betegségi állapotba való átmenetet számos tényező befolyásolja, beleértve maguknak a kolonizáló H. pylori törzsek genotípusainak evolúcióját, amelyet részben a gazdaszervezet fertőzésre adott válasza vezérel. A kutatók azt feltételezik, hogy a gambiai gyerekekből származó H. pylori törzsek genetikailag különbözni fognak az azonos közösségből származó, krónikusan kolonizált felnőttek törzseitől. A kutatók által végzett gyermek- és felnőtt izolátumok genetikai és fenotípusos jellemzése során az ebben a 2 korcsoportban keringő törzsek közötti alapvető különbségeket tesztelik, amelyek segíthetnek értékelni a törzsszelekció és/vagy a genom evolúció jelentőségét ilyen magas kockázatú társadalmakban. A tanulmány konkrét célja a gyermek és a közeli felnőtt rokonoktól származó törzsek rokonságának felmérése. A vizsgálati eljárások magukban foglalják a gyomornedv leszívását egy orrgyomorszondán keresztül, amelyet csecsemők táplálására használnak olyan gyermekeknél, akik intenzív fekvőbeteg-újratápláláson esnek át, valamint H. pylori tenyésztését ezekből az aspirátumokból, valamint azoktól a szülőktől, akik elfogadják a mintaadásra való felkérést. gyomornedv a tenyésztéshez egy erre a célra ideiglenesen behelyezett orrgyomorszondán keresztül. A legtöbb genotipizálás önkényesen előkészített polimeráz láncreakciós DNS-ujjlenyomat-vételt, korlátozott (fókuszált) DNS-szekvenálást, különösen szorosan rokon, de nem azonos ujjlenyomatokkal rendelkező izolátumok esetében, valamint metronidazol-érzékenységi teszteket foglal magában. A gyermek és felnőtt izolátumok genetikai és fenotípusos jellemzése megvizsgálja az alapvető különbségeket a két korcsoportban keringő törzsek között, és ezáltal segít a törzsszelekció és/vagy a genom evolúció jelentőségének értékelésében az ilyen magas kockázatú társadalmakban. A 2 éves projekt során a tantárgyakat csak egyszer tanulják meg. Ha a H. pylori-t izolálják a gyomor-aspirátumokból, a gyermek anyját megkérdezik, hogy beleegyezne-e abba, hogy egy alkalommal nasogastricus szondát engedjenek át a H. pylori tenyésztéshez szükséges gyomornedv leszívásához. A kapott izolátumokat DNS-elemzésnek és genotipizálásnak vetik alá. Ezekben az összehasonlító vizsgálatokban meg kell vizsgálni az azonos családból vagy faluból származó gyermekekből és felnőttekből izolált törzsek közvetlen összehasonlítását. Ez lesz az első olyan vizsgálat, amelyet olyan társadalomban végeznek el, ahol magas a korai természetes úton szerzett H. pylori kolonizáció előfordulása, és lehetővé teszi az azonos családból vagy falusi környezetből származó gyermekektől és felnőttektől származó izolátumok közvetlen összehasonlítását, amely információkat nyújt a fertőzés családon belüli és közösségen belüli átvitele. A fő eredménymérő a baktériumizolátumok közötti rokonság mértéke. Ezt a polimorf DNS (RAPD) véletlenszerű amplifikációjának eredményeinek vizuális összehasonlításával, az érdeklődésre számot tartó allélek genotípusának összehasonlításával, és véglegesen a háztartási gének szekvenálásával kell értékelni, hogy rokonsági fákat hozzunk létre a STAR program és a többszörös lókusz szekvencia tipizálása segítségével. MLST) adatbázis. Emberi alanyoknál nincsenek eredménymérők.