Helicobacter en Gambia (Parte 2)

Este estudio descriptivo preliminar tiene como objetivo proporcionar los primeros datos que evaluarán las diferencias y similitudes en el genotipo entre aislamientos de H. pylori obtenidos de niños y adultos que viven en Gambia, África Occidental, y evaluar la magnitud probable de estas diferencias. Este protocolo describe la aplicación de técnicas mínimamente invasivas para el aislamiento de H. pylori (desarrolladas en la primera parte de este proyecto y descritas en un protocolo separado, el protocolo DMID 06-0053) en un estudio de población. Los sujetos de estudio serán residentes de Gambia, África Occidental. Se estudiarán 90 niños menores de 2 años que requieran intubación nasogástrica terapéutica y 30 madres sanas de estos niños. Los temas se estudiarán en el Consejo de Investigación Médica (MRC) de los Laboratorios de Investigación e Instalaciones Clínicas de Gran Bretaña en Fajara, Gambia, África Occidental. Los investigadores proponen que la transición de la colonización infantil al estado de la enfermedad adulta se ve afectada por múltiples factores, incluida la evolución de los genotipos de las propias cepas colonizadoras de H. pylori, impulsada en parte por la respuesta del huésped a la infección. Los investigadores plantean la hipótesis de que las cepas de H. pylori de los niños de Gambia diferirán genéticamente de las cepas de adultos colonizados crónicamente de la misma comunidad. La caracterización genética y fenotípica de los aislamientos pediátricos y adultos de los investigadores evaluará las diferencias fundamentales entre las cepas que circulan en estos 2 grupos de edad, lo que puede ayudar a evaluar la importancia de la selección de cepas y/o la evolución del genoma en sociedades de alto riesgo. El objetivo específico de este estudio es evaluar la relación de las cepas infantiles y las de parientes adultos cercanos. Los procedimientos del estudio incluirán la aspiración de jugo gástrico a través de una sonda nasogástrica utilizada con fines de alimentación infantil en niños que se someten a una renutrición hospitalaria intensiva, y el cultivo de H. pylori a partir de estos aspirados, y también de los padres que acepten la invitación a donar una muestra. de jugo gástrico para cultivo a través de una sonda nasogástrica insertada temporalmente para este fin. La mayoría de los genotipados implicarán huellas dactilares de ADN de reacción en cadena de polimerasa cebadas arbitrariamente, secuenciación de ADN limitada (enfocada), especialmente en casos de aislamientos con huellas dactilares estrechamente relacionadas pero no idénticas, y pruebas de susceptibilidad al metronidazol. La caracterización genética y fenotípica de aislamientos pediátricos y adultos evaluará las diferencias fundamentales entre las cepas que circulan en estos dos grupos de edad y, por lo tanto, ayudará a evaluar la importancia de la selección de cepas y/o la evolución del genoma en sociedades de alto riesgo. Las materias se estudiarán una sola vez durante este proyecto de 2 años. Si se aísla H. pylori de los aspirados gástricos, se le preguntará a la madre de ese niño si estaría de acuerdo en que se le pase una sonda nasogástrica en una ocasión para obtener un aspirado de jugo gástrico para el cultivo de H. pylori. Los aislados obtenidos serán objeto de análisis de ADN y genotipado. Los puntos específicos que abordarán estos estudios comparativos incluirán la comparación directa de cepas aisladas de niños y adultos dentro de la misma familia o aldea. Este será el primer estudio que se realizará en una sociedad con una alta incidencia temprana de colonización por H. pylori adquirida de forma natural, y permitirá la comparación directa entre aislamientos de niños y adultos dentro de las mismas familias o entorno del pueblo, lo que proporcionará información sobre transmisión intrafamiliar e intracomunitaria de la infección. La principal medida de resultado es el grado de relación entre los aislados bacterianos. Esto se evaluará mediante la comparación visual entre los resultados de la amplificación aleatoria de ADN polimórfico (RAPD), mediante la comparación del genotipo para los alelos de interés y, definitivamente, mediante la secuenciación de los genes domésticos para construir árboles filogenéticos de parentesco mediante el programa STAR y la tipificación de secuencias de locus múltiples ( MLST) base de datos. No hay medidas de resultado para sujetos humanos.