タンザニア・ムワンザの学童における環境毒素レベルの低減に対するプロバイオティクスヨーグルトの効果を調査 (PDTX)

レイク小学校の 1 年生 60 人のグループが研究に参加するために募集されます。 子供の保護者の同意を得た後、各子供には参加者番号が与えられ、NIMR の有資格者によって各子供から血液、尿、糞便のサンプルが収集されます。 子どもたちは、年齢、性別、体重に応じて無作為に2つのグループ（n=30）に分けられ、そのうちの1つのグループにはラクトバチルス・ラムノサスGR-1を含むプロバイオティクスヨーグルト100gが与えられ、もう1つのグループには同量の牛乳が与えられる。 ヨーグルトまたは牛乳を摂取してから 30 日後に、再度サンプルが収集されます。

サンプルは分析のためにドライアイスに入れてカナダのオンタリオ州ロンドンに返送されます。 血液と尿は、高分解能セクターフィールド誘導結合血漿質量分析法 (HR-SF-ICP-MS) によって分析され、有毒な重金属 (水銀、鉛、カドミウム、ヒ素) のレベルが測定されます。 これはカナダのロンドン・ヘルス・サイエンス・トレース・エレメント研究所によって実施されます。 尿はまた、バイオトロン施設（ウェスタンオンタリオ大学）で農薬レベルを決定するためにガスクロマトグラフィー/質量分析法（GC-MS）によって分析されます。 また、プロバイオティクスの点滴に反応した潜在的な宿主の代謝変化について、NMR を介して尿を検査します。

細菌群集の DNA サンプルが抽出および分析され、プロバイオティクス ヨーグルトの投与前後で子供の胃腸内細菌叢を測定し、腸内細菌叢に対するヨーグルトの影響を確認します。 簡単に説明すると、Qiagen Stool DNA 抽出キットを使用して DNA を抽出し、遺伝子内の可変領域に特異的なバーコード付きプライマーを使用して細菌群集 16S rRNA 遺伝子を増幅します。 サンプルはプールされ、Ion Torrent プラットフォーム (ロンドン地域ゲノミクスセンター、カナダ) で配列決定されます。 次に、カスタム スクリプトと、微生物叢分析の主要なパッケージである Quantitative Insights Into Microbial Ecology (QIIME) ツールを使用して、読み取り情報が処理および分析されます。