Studio degli effetti dello yogurt probiotico sulla riduzione dei livelli di tossine ambientali tra i bambini in età scolare a Mwanza, in Tanzania (PDTX)

Un gruppo di 60 studenti del primo anno della Lake Primary School sarà reclutato per l'inclusione nello studio. Dopo aver ottenuto il consenso dal caregiver del bambino, a ogni bambino verrà assegnato un numero di partecipante e campioni di sangue, urina e feci saranno raccolti da ogni bambino da personale qualificato del NIMR. I bambini saranno randomizzati in due gruppi (n=30) per abbinare età, sesso e peso, uno dei quali riceverà uno yogurt probiotico da 100 g contenente Lactobacillus rhamnosus GR-1 mentre l'altro gruppo riceverà una porzione equivalente di latte. Dopo 30 giorni di consumo dello yogurt o del latte, i campioni verranno nuovamente raccolti.

I campioni verranno rispediti a London, Ontario Canada su ghiaccio secco per l'analisi. Il sangue e le urine saranno analizzati mediante spettrometria di massa di plasma accoppiato induttivamente ad alta risoluzione (HR-SF-ICP-MS) per determinare i livelli di metalli pesanti tossici (mercurio, piombo, cadmio, arsenico). Ciò sarà effettuato dal laboratorio London Health Sciences Trace Elements in Canada. L'urina sarà anche analizzata tramite gascromatografia/spettrometria di massa (GC-MS) per determinare i livelli di pesticidi presso la Biotron Facility (University of Western Ontario). Esamineremo anche l'urina tramite NMR per potenziali cambiamenti metabolici dell'ospite in risposta all'instillazione di probiotici.

I campioni di DNA della comunità batterica saranno estratti e analizzati per determinare il microbiota gastrointestinale dei bambini sia prima che dopo la somministrazione dello yogurt probiotico per determinare l'effetto dello yogurt sul microbioma intestinale. In breve, il DNA sarà estratto con il kit di estrazione del DNA Qiagen Stool ei geni 16S rRNA della comunità batterica saranno amplificati utilizzando primer codificati a barre specifici per una regione variabile all'interno del gene. I campioni saranno raggruppati e sequenziati sulla piattaforma Ion Torrent (London Regional Genomics Center, Canada). Le letture vengono quindi elaborate e analizzate utilizzando script personalizzati e lo strumento Quantitative Insights Into Microbial Ecology (QIIME), che è il pacchetto principale per l'analisi del microbiota.