A probiotikus joghurt hatásainak vizsgálata a környezeti toxinok szintjének csökkentésére iskolás gyerekek körében Mwanzában, Tanzániában (PDTX)

A Lake Általános Iskolából egy 60 fős első éves diákból álló csoportot vesznek fel a vizsgálatba. Miután megkapta a gyermek gondozójának beleegyezését, minden gyermek megkapja a résztvevőszámot, és minden gyermektől vér-, vizelet- és székletmintát vesz a NIMR szakképzett személyzete. A gyerekeket véletlenszerűen két csoportba osztják (n=30) életkoruk, nemük és testsúlyuk szerint, amelyek közül az egyik 100 g Lactobacillus rhamnosus GR-1-et tartalmazó probiotikus joghurtot, míg a másik csoport egyenértékű tejet kap. A joghurt vagy tej elfogyasztása után 30 nap elteltével ismét mintát veszünk.

A mintákat szárazjégen szállítják vissza Londonba, Ontario Kanadába elemzés céljából. A vért és a vizeletet nagy felbontású szektormezős induktív csatolású plazma tömegspektrometriával (HR-SF-ICP-MS) elemzik a toxikus nehézfémek (higany, ólom, kadmium, arzén) szintjének meghatározására. Ezt a kanadai London Health Sciences Trace Elements laboratórium végzi majd. A vizeletet gázkromatográfiával/tömegspektrometriával (GC-MS) is elemzik, hogy meghatározzák a növényvédő szerek szintjét a Biotron létesítményben (University of Western Ontario). A vizeletet NMR segítségével is megvizsgáljuk a gazdaszervezet esetleges metabolikus változásaira a probiotikus becsepegtetés hatására.

A probiotikus joghurt beadása előtt és után is baktériumközösségből származó DNS-mintákat vonnak ki és elemeznek, hogy meghatározzák a gyermekek gasztrointesztinális mikrobiotáját, hogy meghatározzák a joghurtnak a bélmikrobiómára gyakorolt ​​hatását. Röviden, a DNS-t a Qiagen Stool DNS extrakciós készlettel extraháljuk, és a bakteriális közösség 16S rRNS génjeit a gén egy variábilis régiójára specifikus vonalkódolt primerek segítségével amplifikáljuk. A mintákat egyesítik és szekvenálják az Ion Torrent platformon (London Regional Genomics Center, Kanada). A beolvasásokat ezután egyéni szkriptek, valamint a Quantitative Insights Into Microbial Ecology (QIIME) eszköz segítségével dolgozzák fel és elemzik, amely a mikrobiotaelemzés vezető csomagja.