Undersøker effekten av probiotisk yoghurt på å redusere nivåene av miljøgifter blant skolebarn i Mwanza, Tanzania (PDTX)

En gruppe på 60 førsteårsstudenter fra Lake Primary School vil bli rekruttert for inkludering i studiet. Etter samtykke fra barnets omsorgsperson vil hvert barn få et deltakernummer og blod, urin og avføringsprøver vil bli samlet inn fra hvert barn av kvalifisert personell fra NIMR. Barn vil bli randomisert i to grupper (n=30) for å matche alder, kjønn og vekt, hvorav den ene vil motta en 100 g probiotisk yoghurt som inneholder Lactobacillus rhamnosus GR-1 mens den andre gruppen vil motta en tilsvarende porsjon melk. Etter 30 dager med inntak av yoghurt eller melk, vil prøver igjen bli samlet inn.

Prøver vil bli sendt tilbake til London, Ontario Canada på tørris for analyse. Blod og urin vil bli analysert via høyoppløselig sektorfelt induktivt koblet plasmamassespektrometri (HR-SF-ICP-MS) for å bestemme nivåer av giftige tungmetaller (kvikksølv, bly, kadmium, arsen). Dette vil bli utført av London Health Sciences Trace Elements-laboratoriet i Canada. Urin vil også bli analysert via gasskromatografi/massespektrometri (GC-MS) for å bestemme nivåer av plantevernmidler ved Biotron-anlegget (University of Western Ontario). Vi vil også undersøke urin via NMR for potensielle vertsmetabolske endringer som respons på probiotisk instillasjon.

DNA-prøver fra bakteriesamfunnet vil bli ekstrahert og analysert for å bestemme den gastrointestinale mikrobiotaen til barna både før og etter administrering av den probiotiske yoghurten for å bestemme effekten av yoghurten på tarmmikrobiomet. Kort fortalt vil DNA bli ekstrahert med Qiagen Stool DNA-ekstraksjonssett og bakteriesamfunnets 16S rRNA-gener vil ampliseres ved bruk av strekkodede primere som er spesifikke for en variabel region i genet. Prøvene vil bli samlet og sekvensert på Ion Torrent-plattformen (London Regional Genomics Center, Canada). Leser blir deretter behandlet og analysert ved hjelp av tilpassede skript samt verktøyet Quantitative Insights Into Microbial Ecology (QIIME), som er den ledende pakken for mikrobiotaanalyse.