Untersuchung der Auswirkungen von probiotischem Joghurt auf die Reduzierung der Menge an Umweltgiften bei Schulkindern in Mwanza, Tansania (PDTX)

Für die Aufnahme in die Studie wird eine Gruppe von 60 Erstklässlern der Lake Primary School rekrutiert. Nach Einholung der Zustimmung der Betreuungsperson des Kindes erhält jedes Kind eine Teilnehmernummer und von jedem Kind werden Blut-, Urin- und Stuhlproben durch qualifiziertes Personal des NIMR entnommen. Die Kinder werden nach dem Zufallsprinzip in zwei Gruppen (n=30) eingeteilt, um Alter, Geschlecht und Gewicht zu entsprechen. Eine davon erhält 100 g probiotischen Joghurt mit Lactobacillus rhamnosus GR-1, während die andere Gruppe eine entsprechende Portion Milch erhält. Nach 30 Tagen Verzehr des Joghurts oder der Milch werden erneut Proben entnommen.

Die Proben werden zur Analyse auf Trockeneis nach London, Ontario, Kanada zurückgeschickt. Blut und Urin werden mittels hochauflösender Sektorfeld-Massenspektrometrie mit induktiv gekoppeltem Plasma (HR-SF-ICP-MS) analysiert, um den Gehalt an toxischen Schwermetallen (Quecksilber, Blei, Cadmium, Arsen) zu bestimmen. Dies wird vom London Health Sciences Trace Elements Laboratory in Kanada durchgeführt. Der Urin wird außerdem mittels Gaschromatographie/Massenspektrometrie (GC-MS) analysiert, um den Pestizidgehalt in der Biotron-Einrichtung (University of Western Ontario) zu bestimmen. Wir werden den Urin auch mittels NMR auf mögliche Stoffwechselveränderungen des Wirts als Reaktion auf die Instillation von Probiotika untersuchen.

DNA-Proben der Bakteriengemeinschaft werden extrahiert und analysiert, um die Magen-Darm-Mikrobiota der Kinder sowohl vor als auch nach der Verabreichung des probiotischen Joghurts zu bestimmen, um die Wirkung des Joghurts auf das Darmmikrobiom zu bestimmen. Kurz gesagt, die DNA wird mit dem Qiagen Stool DNA Extraction Kit extrahiert und die 16S-rRNA-Gene der Bakteriengemeinschaft werden mithilfe von Barcode-Primern amplifiziert, die für eine variable Region innerhalb des Gens spezifisch sind. Die Proben werden auf der Ion Torrent-Plattform (London Regional Genomics Centre, Kanada) gepoolt und sequenziert. Die Lesevorgänge werden dann mithilfe benutzerdefinierter Skripte sowie des Tools Quantitative Insights Into Microbial Ecology (QIIME), dem führenden Paket für die Mikrobiota-Analyse, verarbeitet und analysiert.