Undersöker effekterna av probiotisk yoghurt på att minska nivåerna av miljögifter bland skolbarn i Mwanza, Tanzania (PDTX)

En grupp på 60 förstaårsstudenter från Lake Primary School kommer att rekryteras för inkludering i studien. Efter medgivande från barnets vårdgivare kommer varje barn att få ett deltagarnummer och blod-, urin- och avföringsprover kommer att samlas in från varje barn av kvalificerad personal från NIMR. Barn kommer att randomiseras i två grupper (n=30) för att matcha ålder, kön och vikt, varav den ena får en 100 g probiotisk yoghurt innehållande Lactobacillus rhamnosus GR-1 medan den andra gruppen får en motsvarande portion mjölk. Efter 30 dagars förtäring av yoghurten eller mjölken kommer prover återigen att samlas in.

Prover kommer att skickas tillbaka till London, Ontario, Kanada på torris för analys. Blod och urin kommer att analyseras via högupplöst sektorfältinduktivt kopplad plasmamasspektrometri (HR-SF-ICP-MS) för att bestämma nivåer av giftiga tungmetaller (kvicksilver, bly, kadmium, arsenik). Detta kommer att utföras av London Health Sciences Trace Elements-laboratoriet i Kanada. Urin kommer också att analyseras via gaskromatografi/masspektrometri (GC-MS) för att bestämma nivåer av bekämpningsmedel vid Biotron Facility (University of Western Ontario). Vi kommer också att undersöka urin via NMR för potentiella värdmetaboliska förändringar som svar på probiotisk instillation.

DNA-prover från bakteriesamhället kommer att extraheras och analyseras för att fastställa barnens gastrointestinala mikrobiota både före och efter administrering av den probiotiska yoghurten för att bestämma effekten av yoghurten på tarmmikrobiomet. Kortfattat kommer DNA att extraheras med Qiagen Stool DNA-extraktionskit och bakteriesamhällets 16S rRNA-gener kommer att amplifieras med streckkodade primers specifika för en variabel region i genen. Proverna kommer att slås samman och sekvenseras på Ion Torrent-plattformen (London Regional Genomics Center, Kanada). Läsningar bearbetas och analyseras sedan med hjälp av anpassade skript samt verktyget Quantitative Insights Into Microbial Ecology (QIIME), som är det ledande paketet för mikrobiotaanalys.