統合されたゲノム、トランスクリプトーム、およびプロテオーム解析によるがんの分子検査
統合されたゲノム解析、転写解析、およびプロテオーム解析によるがんの分子検査
この研究の目的は、さまざまながんに関連する遺伝子変化を発見することです。 この研究からの情報により、研究者は多くの癌を予防、検出、治療するためのより良い方法を提供したいと考えています.
多くの病気は、細胞が正常に機能しなくなる原因となる人の遺伝物質の変化に起因する可能性があります。 現在、研究者や医師は、病気の原因となる遺伝子変化の一部を知っていますが、病気の原因となる遺伝子変化のすべてを知っているわけではありません。
このプロジェクトは、ヒトに癌を引き起こす可能性のある遺伝子変化を特定することを目的としています。 標本は、スケジュールされた診断またはルーチンから収集されます (つまり、 カウントのための採血）手順には、組織自体（手術）、骨髄、血液、唾液、尿、髄液、喀痰、関節液、精液、腹水（腹部に充満する液体）、および/または胸水 (肺腔内の液体) を採取して、がんの診断を確定したり、がんやその他の病気を治療する最善の方法を決定したりするのに役立ちます。 さらに、アーカイブされた組織を分析することができます。 サンプルは、後の実験で将来使用するために保存することができます。 ロードアイランド病院の病理部門がサンプルを保管します。
治療に対する反応やがんの家族歴などの医療記録からの情報が収集されます。
調査の概要
詳細な説明
ゲノムの複雑で進行性、多遺伝子性、体細胞変異は、現在、がんの発生、成長、転移、および薬剤耐性の進化における主要な原動力として広く受け入れられています。 さまざまな種類の腫瘍は、異なる遺伝子セットの変異に関連しており、腫瘍の種類ごとに異なる候補遺伝子のパネルを分析するシーケンスベースの方法が緊急に必要とされています。
キャピラリー電気泳動に基づくサンガー シーケンスを使用した従来のシーケンス解析手法は、肺がんや結腸直腸がん、黒色腫、肉腫、白血病、リンパ腫の患者の治療を導くために広く使用されています。 このテクノロジは、スループット、スケーラビリティ、速度、および解像度に制限があります。 次世代シーケンシング (NGS) などの新しいテクノロジーには、1 回のテストで多数の遺伝子を完全にシーケンスし、欠失、挿入、コピー数の変化、転座、およびすべての既知の癌関連遺伝子におけるエクソーム全体の塩基置換。
全ゲノムの配列決定は、潜在的に価値のある多くのアプリケーションにとって経済的に不可能です。 全ゲノム法に代わる方法の 1 つは、エクソーム シーケンスなどのターゲット エンリッチメントです。これは、タンパク質コード領域のみをキャプチャしてシーケンスします。 エクソームは、ヒトゲノムの 1 ～ 2% に相当します。しかし、変化を引き起こす疾患の大部分が含まれています。 エクソーム シーケンスに加えて、完全長トランスクリプトーム (mRNA) シーケンスは、高速で安価な代替手段を提供します。 これは、コード配列を特定し、発現する遺伝子のバリアントを捕捉するだけでなく、遺伝子発現レベルやスプライシング パターンなどの追加情報を生成するためのより簡単な方法です。
この研究の目的は、ヒト固形がんおよび血液悪性腫瘍におけるゲノム、トランスクリプトーム、およびプロテオームの変化を調査することです。
18歳以上の患者 がん（固形腫瘍または血液悪性腫瘍を含む）と診断された患者、または推定されるがんの診断のための処置を受けている患者は適格です。
研究分析は、病理学部門または血液腫瘍学部門によって行われます。 分析される体/血液組織は、患者のがんの診断または評価に必要のない余分な組織/血液からのものです。 すべてのサンプルは匿名化されます。 サンプルは、無期限またはすべてのサンプルが使用されるまで保管されます。
研究の種類
入学 (予想される)
連絡先と場所
研究場所
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Rhode Island
-
East Greenwich、Rhode Island、アメリカ、02818
- 募集
- Rhode Island Comprehensive Cancer Center at East Greenwich
-
コンタクト：
- Allison Jean, B.A.
- 電話番号：(401) 444- 8856
-
コンタクト：
- Andrew Schumacher, M.S.
- 電話番号：401-444-3234
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副調査官：
- Priscilla Merriam, M.D.
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副調査官：
- Howard Safran, M.D.
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副調査官：
- Maria Constantinou, M.D.
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副調査官：
- Anthony Mega, M.D.
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主任研究者：
- Kimberly Perez, M.D.
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副調査官：
- Amy Pilotte, N. P.
-
Providence、Rhode Island、アメリカ、02903
- 募集
- Rhode Island Hospital
-
コンタクト：
- Allison Jean, B.A.
- 電話番号：(401) 444- 8856
-
コンタクト：
- Andrew Schumacher, M.S.
- 電話番号：401-444-3234
-
副調査官：
- Howard Safran, M.D.
-
副調査官：
- Maria Constantinou, M.D.
-
主任研究者：
- Kimberly Perez, M.D.
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副調査官：
- Humera Khurshid, M.D.
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副調査官：
- Evgeny Yakirevich, M.D.
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副調査官：
- Murray Resnick, M.D.
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副調査官：
- James Butera, M.D.
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副調査官：
- Mary Anne Fenton, M.D.
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副調査官：
- Lucia Fontes-Bortes, N.P.
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副調査官：
- Peter Quesenberry, M.D.
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副調査官：
- Matthew Quesenberry, M.D.
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副調査官：
- John Reagan, M.D.
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副調査官：
- Eric Winer, M.D.
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副調査官：
- Thomas DiPetrillo, M.D.
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副調査官：
- Jaroslaw Hepel, M.D.
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副調査官：
- Kara Lynne Leonard, M.D.
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主任研究者：
- David Tracey, P.A.
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副調査官：
- Inna Yakirevich, N.P.
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副調査官：
- Sharon Benson, N.P.
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副調査官：
- Heinrich Elinzano, M.D.
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副調査官：
- Timothy Kinsella, M.D.
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副調査官：
- Thomas Ng, M.D.
-
Providence、Rhode Island、アメリカ、02906
- 募集
- The Miriam Hospital
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副調査官：
- Priscilla Merriam, M.D.
-
副調査官：
- Howard Safran, M.D.
-
副調査官：
- Anthony Mega, M.D.
-
主任研究者：
- Kimberly Perez, M.D.
-
副調査官：
- John Reagan, M.D.
-
副調査官：
- Eric Winer, M.D.
-
コンタクト：
- Maureen Jean, R.N.
- 電話番号：401-793-4283
-
コンタクト：
- Diane Martel, R.N.
- 電話番号：(401) 793- 4282
-
副調査官：
- Jennifer Collins, N.P.
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副調査官：
- Irene Kolberg, N.P.
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副調査官：
- Fred Schiffman, M.D.
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副調査官：
- Edward Wittles, M.D.
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副調査官：
- Angela Taber, M.D.
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副調査官：
- Camille Higel-McGovern, N.P.
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副調査官：
- Amy Pilotte, N.P.
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副調査官：
- Xristin Maestri, N.P.
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参加基準
適格基準
就学可能な年齢
健康ボランティアの受け入れ
受講資格のある性別
サンプリング方法
調査対象母集団
説明
包含基準:
- 文書化されたインフォームドコンセント
- -患者は固形腫瘍または血液悪性腫瘍の疑いがあるか確認されています
- 実験的研究を可能にするのに十分な組織または体液がある
- 患者は18歳以上です
除外基準:
- 患者はインフォームドコンセントを提供したくない、または提供できない
研究計画
研究はどのように設計されていますか？
デザインの詳細
- 観測モデル：ケースのみ
- 時間の展望：見込みのある
コホートと介入
グループ/コホート |
介入・治療 |
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固形腫瘍/血液がん患者
この研究の患者は、固形腫瘍または血液がんが疑われるか確認されている必要があります。
この研究で行われた介入は、がんの分子分析です。
サンプルは、患者の計画された診断またはステージング手順の時点で採取されます。
患者に手術が予定されている場合、診断に必要のない組織のサンプルが得られ、この調査研究に使用されます。
患者が以前に診断手順を受けている場合、その手順で保存された組織の一部も分子分析のために提出されます。
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この研究で行われた介入は、がんの分子分析です。
遺伝子変異を検査するサンプルは、手術や腫瘍生検などの通常の診断手順の過程で収集されます。
以前の診断手順から保存されたサンプルも分析されます。
この検査は、ロード アイランド病院の病理部門またはロード アイランド病院が指定した外部検査室によって実施されます。
分子検査の範囲は、個々のケースで異なります。
たとえば、場合によっては、遺伝子変化の研究は全ゲノムまたはエクソーム シーケンスから開始され、ターゲット サンガー リシーケンス、一塩基多型、およびトランスクリプトーム解析によって確認されます。
他のケースでは、ターゲット マルチジーン パネル シーケンスまたはターゲット アンプリコン サンガー シーケンスが最初の唯一のステップになります。
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この研究は何を測定していますか？
主要な結果の測定
結果測定 |
時間枠 |
|---|---|
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「実行可能な」発癌性変異の頻度
時間枠：1年
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1年
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ヒトがんにおけるゲノム異常、トランスクリプトーム異常、およびプロテオーム異常の有病率
時間枠：1年
|
1年
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協力者と研究者
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捜査官
- 主任研究者：Kimberly Perez, M.D.、Lifespan Corporation
研究記録日
主要日程の研究
研究開始
一次修了 (予想される)
研究の完了 (予想される)
試験登録日
最初に提出
QC基準を満たした最初の提出物
最初の投稿 (見積もり)
学習記録の更新
投稿された最後の更新 (見積もり)
QC基準を満たした最後の更新が送信されました
最終確認日
詳しくは
この情報は、Web サイト clinicaltrials.gov から変更なしで直接取得したものです。研究の詳細を変更、削除、または更新するリクエストがある場合は、register@clinicaltrials.gov。 までご連絡ください。 clinicaltrials.gov に変更が加えられるとすぐに、ウェブサイトでも自動的に更新されます。