Tämä sivu käännettiin automaattisesti, eikä käännösten tarkkuutta voida taata. Katso englanninkielinen versio lähdetekstiä varten.

Syövän molekyylitestaus integroidun genomisen, transkriptomisen ja proteomisen analyysin avulla

tiistai 26. elokuuta 2014 päivittänyt: Rhode Island Hospital

Syövän MOLEKUULAARINEN TESTAUS INTEGROIDUN GENOMISELLA, TRANSKRIPTOMISELLE JA PROTEOMISELLA ANALYYSIllä

Tämän tutkimuksen tarkoituksena on löytää geneettisiä muutoksia, jotka liittyvät erilaisiin syöpiin. Tämän tutkimuksen tietojen avulla tutkijat toivovat tarjoavansa parempia tapoja ehkäistä, havaita ja hoitaa monia syöpiä.

Monet sairaudet voivat johtua ihmisen geneettisen materiaalin muutoksista, jotka aiheuttavat solujen toimintahäiriöitä. Tällä hetkellä tutkijat ja lääkärit tietävät joitakin geneettisiä muutoksia, jotka voivat aiheuttaa sairauksia, mutta he eivät tiedä kaikkia geneettisiä muutoksia, jotka voivat aiheuttaa sairauksia.

Tämä projekti on suunniteltu tunnistamaan geneettisiä muutoksia, jotka voivat aiheuttaa syöpää ihmisissä. Näytteet otetaan ajoitetusta diagnoosista tai rutiinista (esim. verenotto laskentaa varten), ja siihen voi sisältyä näytteitä itse kudoksesta (leikkaus), luuytimestä, verestä, syljestä, virtsasta, selkäydinnesteestä, ysköksestä, nivelnesteestä, siemennesteestä, askitesista (neste, joka täyttyy vatsasta), ja/tai keuhkopussin nestettä (nestettä keuhkoontelossa), joko vahvistamaan syövän diagnoosin tai auttamaan päättämään, miten syöpää tai muuta sairautta parhaiten hoidetaan. Lisäksi arkistoitu kudos voidaan analysoida. Näytteet voidaan säilyttää myöhempää käyttöä varten myöhemmissä kokeissa. Rhode Islandin sairaalan patologian osasto säilyttää näytteet.

Tiedot potilaskertomuksista, kuten hoitovasteet tai suvussa esiintynyt syöpä, kerätään.

Tutkimuksen yleiskatsaus

Tila

Tuntematon

Ehdot

Interventio / Hoito

Yksityiskohtainen kuvaus

Genomin monimutkaiset, progressiiviset, multigeeniset, somaattiset mutaatiot hyväksytään nykyään laajalti ensisijaisena liikkeellepanevana voimana syövän alkamisen, kasvun, etäpesäkkeiden ja farmakoresistenssin kehityksessä. Erityyppiset kasvaimet liittyvät mutaatioihin erillisissä geenisarjoissa, ja on kipeä tarve sekvensointiin perustuvalle menetelmälle, jolla analysoidaan kunkin kasvaintyypin osalta erilaisia ​​ehdokasgeenipaneeleja.

Perinteisiä lähestymistapoja sekvenssianalyysiin, jossa käytetään kapillaarielektroforeesiin perustuvaa Sanger-sekvensointia, käytetään laajalti keuhko- ja paksusuolensyöpäpotilaiden sekä melanooman, sarkoomien, leukemioiden ja lymfoomien hoidon ohjauksessa. Tämä tekniikka on rajoitettu suorituskyvyn, skaalautuvuuden, nopeuden ja resoluution suhteen. Nouseva teknologia, kuten seuraavan sukupolven sekvensointi (NGS) - sisältää useita etuja perinteisiin menetelmiin verrattuna, mukaan lukien kyky sekvensoida suuri määrä geenejä yhdellä testillä ja havaita samanaikaisesti deleetiot, insertiot, kopioluvun muutokset, translokaatiot ja eksominlaajuiset emässubstituutiot kaikissa tunnetuissa syöpään liittyvissä geeneissä.

Koko genomin sekvensointi on taloudellisesti kohtuutonta monille mahdollisesti arvokkaille sovelluksille. Yksi vaihtoehto koko genomin menetelmille on kohteen rikastaminen, kuten eksomin sekvensointi, joka kaappaa ja sekvensoi vain proteiinia koodaavat alueet. Eksomi edustaa 1-2 % ihmisen genomista; sisältää kuitenkin suurimman osan sairauksista, jotka aiheuttavat muutoksia. Exome-sekvensoinnin lisäksi täyspitkän transkription (mRNA) sekvensointi tarjoaa nopean ja edullisen vaihtoehdon. Se on helpompi tapa tunnistaa koodaavia sekvenssejä ja siepata muunnelmia ilmennetyistä geeneistä sekä tuottaa lisäinformaatiota, kuten geenin ilmentymistasoa ja silmukointikuvioita.

Tämän tutkimuksen tavoitteena on tutkia genomisia, transkriptomisia ja proteomisia muutoksia ihmisen kiinteissä syövissä ja hematologisissa pahanlaatuisissa kasvaimissa.

Yli 18-vuotiaat potilaat kelpoisuusvaatimukset täyttävät potilaat, joilla on diagnosoitu syöpä (mukaan lukien kiinteä kasvain tai hematologinen pahanlaatuinen kasvain) tai potilaat, joille tehdään toimenpide oletetun syövän diagnosoimiseksi.

Tutkimusanalyysin tekee patologian laitos tai hematologian onkologian osasto. Analysoitava keho/verikudos tulee ylimääräisestä kudoksesta/verestä, jota ei tarvita potilaan syövän diagnosointiin tai arviointiin. Kaikkien näytteiden tunnistetiedot poistetaan. Näytteitä säilytetään määräämättömän ajan tai kunnes kaikki näytteet on käytetty.

Opintotyyppi

Havainnollistava

Ilmoittautuminen (Odotettu)

500

Yhteystiedot ja paikat

Tässä osiossa on tutkimuksen suorittajien yhteystiedot ja tiedot siitä, missä tämä tutkimus suoritetaan.

Opiskelupaikat

  • Yhdysvallat
    • Rhode Island
      • East Greenwich, Rhode Island, Yhdysvallat, 02818
        • Rekrytointi
        • Rhode Island Comprehensive Cancer Center at East Greenwich
        • Ottaa yhteyttä:
          • Allison Jean, B.A.
          • Puhelinnumero: (401) 444- 8856
        • Ottaa yhteyttä:
          • Andrew Schumacher, M.S.
          • Puhelinnumero: 401-444-3234
        • Alatutkija:
          • Priscilla Merriam, M.D.
        • Alatutkija:
          • Howard Safran, M.D.
        • Alatutkija:
          • Maria Constantinou, M.D.
        • Alatutkija:
          • Anthony Mega, M.D.
        • Päätutkija:
          • Kimberly Perez, M.D.
        • Alatutkija:
          • Amy Pilotte, N. P.
      • Providence, Rhode Island, Yhdysvallat, 02903
        • Rekrytointi
        • Rhode Island Hospital
        • Ottaa yhteyttä:
          • Allison Jean, B.A.
          • Puhelinnumero: (401) 444- 8856
        • Ottaa yhteyttä:
          • Andrew Schumacher, M.S.
          • Puhelinnumero: 401-444-3234
        • Alatutkija:
          • Howard Safran, M.D.
        • Alatutkija:
          • Maria Constantinou, M.D.
        • Päätutkija:
          • Kimberly Perez, M.D.
        • Alatutkija:
          • Humera Khurshid, M.D.
        • Alatutkija:
          • Evgeny Yakirevich, M.D.
        • Alatutkija:
          • Murray Resnick, M.D.
        • Alatutkija:
          • James Butera, M.D.
        • Alatutkija:
          • Mary Anne Fenton, M.D.
        • Alatutkija:
          • Lucia Fontes-Bortes, N.P.
        • Alatutkija:
          • Peter Quesenberry, M.D.
        • Alatutkija:
          • Matthew Quesenberry, M.D.
        • Alatutkija:
          • John Reagan, M.D.
        • Alatutkija:
          • Eric Winer, M.D.
        • Alatutkija:
          • Thomas DiPetrillo, M.D.
        • Alatutkija:
          • Jaroslaw Hepel, M.D.
        • Alatutkija:
          • Kara Lynne Leonard, M.D.
        • Päätutkija:
          • David Tracey, P.A.
        • Alatutkija:
          • Inna Yakirevich, N.P.
        • Alatutkija:
          • Sharon Benson, N.P.
        • Alatutkija:
          • Heinrich Elinzano, M.D.
        • Alatutkija:
          • Timothy Kinsella, M.D.
        • Alatutkija:
          • Thomas Ng, M.D.
      • Providence, Rhode Island, Yhdysvallat, 02906
        • Rekrytointi
        • The Miriam Hospital
        • Alatutkija:
          • Priscilla Merriam, M.D.
        • Alatutkija:
          • Howard Safran, M.D.
        • Alatutkija:
          • Anthony Mega, M.D.
        • Päätutkija:
          • Kimberly Perez, M.D.
        • Alatutkija:
          • John Reagan, M.D.
        • Alatutkija:
          • Eric Winer, M.D.
        • Ottaa yhteyttä:
          • Maureen Jean, R.N.
          • Puhelinnumero: 401-793-4283
        • Ottaa yhteyttä:
          • Diane Martel, R.N.
          • Puhelinnumero: (401) 793- 4282
        • Alatutkija:
          • Jennifer Collins, N.P.
        • Alatutkija:
          • Irene Kolberg, N.P.
        • Alatutkija:
          • Fred Schiffman, M.D.
        • Alatutkija:
          • Edward Wittles, M.D.
        • Alatutkija:
          • Angela Taber, M.D.
        • Alatutkija:
          • Camille Higel-McGovern, N.P.
        • Alatutkija:
          • Amy Pilotte, N.P.
        • Alatutkija:
          • Xristin Maestri, N.P.

Osallistumiskriteerit

Tutkijat etsivät ihmisiä, jotka sopivat tiettyyn kuvaukseen, jota kutsutaan kelpoisuuskriteereiksi. Joitakin esimerkkejä näistä kriteereistä ovat henkilön yleinen terveydentila tai aiemmat hoidot.

Kelpoisuusvaatimukset

Opintokelpoiset iät

18 vuotta ja vanhemmat (Aikuinen, Vanhempi Aikuinen)

Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia

Ei

Sukupuolet, jotka voivat opiskella

Kaikki

Näytteenottomenetelmä

Todennäköisyysnäyte

Tutkimusväestö

Tämän tutkimuksen potilailla on joko epäilty tai vahvistettu kiinteä kasvain tai hematologinen pahanlaatuisuus

Kuvaus

Sisällyttämiskriteerit:

  • Dokumentoitu tietoinen suostumus
  • Potilaalla on joko epäilty tai vahvistettu kiinteä kasvain tai hematologinen pahanlaatuisuus
  • Kudosta tai kehon nestettä on riittävästi kokeellisen tutkimuksen mahdollistamiseksi
  • Potilas on yli 18-vuotias

Poissulkemiskriteerit:

  • Potilas ei halua tai ei pysty antamaan tietoon perustuvaa suostumusta

Opintosuunnitelma

Tässä osiossa on tietoja tutkimussuunnitelmasta, mukaan lukien kuinka tutkimus on suunniteltu ja mitä tutkimuksella mitataan.

Miten tutkimus on suunniteltu?

Suunnittelun yksityiskohdat

  • Havaintomallit: Vain tapaus
  • Aikanäkymät: Tulevaisuuden

Kohortit ja interventiot

Ryhmä/Kohortti
Interventio / Hoito
Pts, joilla on kiinteitä kasvaimia / hematologinen syöpä
Tämän tutkimuksen potilailla on oltava joko epäilty tai vahvistettu kiinteä kasvain tai hematologinen syöpä. Tässä tutkimuksessa suoritettu interventio on syövän molekyylianalyysi. Näytteet otetaan potilaan suunnitellun diagnostisen tai vaiheittaisen toimenpiteen aikana. Jos potilas on määrä leikkaukseen, otetaan näyte kudoksesta, jota ei tarvita hänen diagnoosinsa tekemiseen, ja sitä käytetään tässä tutkimustutkimuksessa. Jos potilaalle on tehty aikaisempi diagnostinen toimenpide, osa siitä tallennetusta kudoksesta lähetetään myös molekyylianalyysiin.
Muut: Syövän molekyylianalyysi
Tässä tutkimuksessa suoritettu interventio on syövän molekyylianalyysi. Näytteet, jotka testataan geneettisten muutosten varalta, kerätään rutiininomaisen diagnostisen toimenpiteen, kuten leikkauksen tai kasvainbiopsian, aikana. Myös aiemmista diagnostisista toimenpiteistä tallennetut näytteet analysoidaan. Tämän testin suorittaa Rhode Island Hospitalin patologinen osasto tai Rhode Islandin sairaalan nimeämä ulkopuolinen laboratorio. Molekyylitestauksen laajuus on erilainen kussakin yksittäisessä tapauksessa. Esimerkiksi joissakin tapauksissa geneettisten muutosten tutkimus alkaa koko genomin tai eksomin sekvensoinnilla, ja se vahvistetaan kohdistetulla Sanger-uudelleensekvensoinnilla, yhden nukleotidin polymorfismilla ja transkriptianalyysillä. Muissa tapauksissa kohdistettu monigeenipaneelisekvensointi tai kohdistettu amplikoni Sangerin sekvensointi on ensimmäinen ja ainoa vaihe.

Mitä tutkimuksessa mitataan?

Ensisijaiset tulostoimenpiteet

Tulosmittaus
Aikaikkuna
"Toimintokykyisten" onkogeenisten mutaatioiden taajuus
Aikaikkuna: 1 vuosi
1 vuosi
Genomisten, transkriptomisten ja proteomisten poikkeavuuksien esiintyvyys ihmisen syövässä
Aikaikkuna: 1 vuosi
1 vuosi

Yhteistyökumppanit ja tutkijat

Täältä löydät tähän tutkimukseen osallistuvat ihmiset ja organisaatiot.

Sponsori

Rhode Island Hospital

Tutkijat

  • Päätutkija: Kimberly Perez, M.D., Lifespan Corporation

Opintojen ennätyspäivät

Nämä päivämäärät seuraavat ClinicalTrials.gov-sivustolle lähetettyjen tutkimustietueiden ja yhteenvetojen edistymistä. National Library of Medicine (NLM) tarkistaa tutkimustiedot ja raportoidut tulokset varmistaakseen, että ne täyttävät tietyt laadunvalvontastandardit, ennen kuin ne julkaistaan ​​julkisella verkkosivustolla.

Opi tärkeimmät päivämäärät

Opiskelun aloitus

Keskiviikko 1. toukokuuta 2013

Ensisijainen valmistuminen (Odotettu)

Lauantai 1. elokuuta 2015

Opintojen valmistuminen (Odotettu)

Lauantai 1. elokuuta 2015

Opintoihin ilmoittautumispäivät

Ensimmäinen lähetetty

Torstai 31. heinäkuuta 2014

Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit

Torstai 7. elokuuta 2014

Ensimmäinen Lähetetty (Arvio)

Tiistai 12. elokuuta 2014

Tutkimustietojen päivitykset

Viimeisin päivitys julkaistu (Arvio)

Keskiviikko 27. elokuuta 2014

Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit

Tiistai 26. elokuuta 2014

Viimeksi vahvistettu

Tiistai 1. heinäkuuta 2014

Lisää tietoa

Tähän tutkimukseen liittyvät termit

Avainsanat

Muita asiaankuuluvia MeSH-ehtoja

Muut tutkimustunnusnumerot

  • 2055-13

Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .

Kliiniset tutkimukset Kiinteät kasvaimet

Kliiniset tutkimukset Syövän molekyylianalyysi

Hae vastaavia kokeiluja

Sponsorit ja yhteistyökumppanit

Sairaudet

Huumeiden interventiot

CROs by country

CROs in Finland

Ehdot

Harvinaiset sairaudet

Huumeiden interventiot

Ravintolisät

Sponsori / yhteistyökumppanit

Sijainnit

3
Tilaa