Moleculair testen van kanker door geïntegreerde genomische, transcriptomische en proteomische analyse
MOLECULAIRE TESTEN VAN KANKER DOOR GEÏNTEGREERDE GENOMIC-, TRANSCRIPTOMIC- EN PROTEOMISCHE ANALYSE
Het doel van deze studie is om genetische veranderingen te ontdekken die verband houden met verschillende kankers. Met de informatie uit deze studie hopen de onderzoekers betere manieren te bieden om veel kankers te voorkomen, op te sporen en te behandelen.
Veel ziekten kunnen het gevolg zijn van veranderingen in het genetisch materiaal van een persoon waardoor cellen niet goed werken. Momenteel kennen onderzoekers en artsen enkele van de genetische veranderingen die ziekte kunnen veroorzaken, maar ze kennen niet alle genetische veranderingen die ziekte kunnen veroorzaken.
Dit project is ontworpen om genetische veranderingen te identificeren die kanker bij de mens kunnen veroorzaken. Specimens zullen worden verzameld van een geplande diagnostische of routine (d.w.z. bloedafname voor tellingen) procedure en kan monsters van het weefsel zelf (chirurgie), beenmerg, bloed, speeksel, urine, ruggenmergvocht, sputum, gewrichtsvloeistof, zaadvloeistof, ascites (een vloeistof die zich in de buik vult), en/of pleuravocht (vocht in de longholte), om de diagnose kanker te bevestigen of om te helpen beslissen hoe kanker of een andere ziekte het beste kan worden behandeld. Bovendien kan gearchiveerd weefsel worden geanalyseerd. Monsters kunnen worden opgeslagen voor toekomstig gebruik in latere experimenten. De afdeling Pathologie van het Rhode Island Hospital bewaart de monsters.
Informatie uit het medisch dossier, zoals reacties op behandelingen of familiegeschiedenis van kanker, zal worden verzameld.
Studie Overzicht
Toestand
Interventie / Behandeling
Gedetailleerde beschrijving
Complexe, progressieve, multigene, somatische mutaties van het genoom worden nu algemeen aanvaard als de belangrijkste drijvende kracht achter de evolutie van het ontstaan, de groei, de metastase en de farmacoresistentie van kanker. Verschillende soorten tumoren worden in verband gebracht met mutaties in verschillende sets van genen, en er is dringend behoefte aan een op sequencing gebaseerde methode voor het analyseren van panelen van kandidaat-genen die voor elk tumortype verschillen.
Traditionele benaderingen van sequentieanalyse waarbij gebruik wordt gemaakt van op capillaire elektroforese gebaseerde Sanger-sequencing, worden veel gebruikt als leidraad voor de therapie van patiënten met long- en colorectale kanker en voor melanoom, sarcomen, leukemieën en lymfomen. Deze technologie is beperkt in doorvoer, schaalbaarheid, snelheid en resolutie. De opkomende technologie zoals next-generation sequencing (NGS) heeft een aantal voordelen ten opzichte van traditionele methoden, waaronder de mogelijkheid om grote aantallen genen volledig te sequensen in een enkele test en tegelijkertijd deleties, inserties, wijzigingen in het aantal kopieën, translocaties en exome-brede basissubstituties in alle bekende kankergerelateerde genen.
Het sequentiëren van het hele genoom is financieel onbetaalbaar voor veel potentieel waardevolle toepassingen. Een alternatief voor methoden voor het hele genoom is doelverrijking, zoals exome-sequencing, waarbij alleen eiwitcoderende regio's worden opgevangen en gesequenced. Het exoom vertegenwoordigt 1-2% van het menselijk genoom; bevat echter de overgrote meerderheid van ziekteverwekkende veranderingen. Naast exome sequencing biedt full-length transcriptoom (mRNA) sequencing een snel en goedkoop alternatief. Het is een eenvoudigere methode om coderende sequenties te identificeren en varianten vast te leggen in genen die tot expressie worden gebracht, en om aanvullende informatie te genereren, zoals genexpressieniveau en splitsingspatronen.
Het doel van deze studie is het onderzoeken van genomische, transcriptomische en proteomische veranderingen in menselijke solide kankers en hematologische maligniteiten.
Patiënten >18 jaar gediagnosticeerd met kanker (inclusief een solide tumor of hematologische maligniteit) of patiënten die een procedure ondergaan voor de diagnose van een vermoedelijke kanker komen in aanmerking.
De onderzoeksanalyse wordt uitgevoerd door de afdeling pathologie of de afdeling hematologie oncologie. Het geanalyseerde lichaam/bloedweefsel zal afkomstig zijn van extra weefsel/bloed dat niet nodig is voor de diagnose of evaluatie van de kanker van de patiënt. Alle monsters worden geanonimiseerd. Monsters worden voor onbepaalde tijd bewaard of totdat alle monsters zijn gebruikt.
Studietype
Inschrijving (Verwacht)
Contacten en locaties
Studie Locaties
-
-
Rhode Island
-
East Greenwich, Rhode Island, Verenigde Staten, 02818
- Werving
- Rhode Island Comprehensive Cancer Center at East Greenwich
-
Contact:
- Allison Jean, B.A.
- Telefoonnummer: (401) 444- 8856
-
Contact:
- Andrew Schumacher, M.S.
- Telefoonnummer: 401-444-3234
-
Onderonderzoeker:
- Priscilla Merriam, M.D.
-
Onderonderzoeker:
- Howard Safran, M.D.
-
Onderonderzoeker:
- Maria Constantinou, M.D.
-
Onderonderzoeker:
- Anthony Mega, M.D.
-
Hoofdonderzoeker:
- Kimberly Perez, M.D.
-
Onderonderzoeker:
- Amy Pilotte, N. P.
-
Providence, Rhode Island, Verenigde Staten, 02903
- Werving
- Rhode Island Hospital
-
Contact:
- Allison Jean, B.A.
- Telefoonnummer: (401) 444- 8856
-
Contact:
- Andrew Schumacher, M.S.
- Telefoonnummer: 401-444-3234
-
Onderonderzoeker:
- Howard Safran, M.D.
-
Onderonderzoeker:
- Maria Constantinou, M.D.
-
Hoofdonderzoeker:
- Kimberly Perez, M.D.
-
Onderonderzoeker:
- Humera Khurshid, M.D.
-
Onderonderzoeker:
- Evgeny Yakirevich, M.D.
-
Onderonderzoeker:
- Murray Resnick, M.D.
-
Onderonderzoeker:
- James Butera, M.D.
-
Onderonderzoeker:
- Mary Anne Fenton, M.D.
-
Onderonderzoeker:
- Lucia Fontes-Bortes, N.P.
-
Onderonderzoeker:
- Peter Quesenberry, M.D.
-
Onderonderzoeker:
- Matthew Quesenberry, M.D.
-
Onderonderzoeker:
- John Reagan, M.D.
-
Onderonderzoeker:
- Eric Winer, M.D.
-
Onderonderzoeker:
- Thomas DiPetrillo, M.D.
-
Onderonderzoeker:
- Jaroslaw Hepel, M.D.
-
Onderonderzoeker:
- Kara Lynne Leonard, M.D.
-
Hoofdonderzoeker:
- David Tracey, P.A.
-
Onderonderzoeker:
- Inna Yakirevich, N.P.
-
Onderonderzoeker:
- Sharon Benson, N.P.
-
Onderonderzoeker:
- Heinrich Elinzano, M.D.
-
Onderonderzoeker:
- Timothy Kinsella, M.D.
-
Onderonderzoeker:
- Thomas Ng, M.D.
-
Providence, Rhode Island, Verenigde Staten, 02906
- Werving
- The Miriam Hospital
-
Onderonderzoeker:
- Priscilla Merriam, M.D.
-
Onderonderzoeker:
- Howard Safran, M.D.
-
Onderonderzoeker:
- Anthony Mega, M.D.
-
Hoofdonderzoeker:
- Kimberly Perez, M.D.
-
Onderonderzoeker:
- John Reagan, M.D.
-
Onderonderzoeker:
- Eric Winer, M.D.
-
Contact:
- Maureen Jean, R.N.
- Telefoonnummer: 401-793-4283
-
Contact:
- Diane Martel, R.N.
- Telefoonnummer: (401) 793- 4282
-
Onderonderzoeker:
- Jennifer Collins, N.P.
-
Onderonderzoeker:
- Irene Kolberg, N.P.
-
Onderonderzoeker:
- Fred Schiffman, M.D.
-
Onderonderzoeker:
- Edward Wittles, M.D.
-
Onderonderzoeker:
- Angela Taber, M.D.
-
Onderonderzoeker:
- Camille Higel-McGovern, N.P.
-
Onderonderzoeker:
- Amy Pilotte, N.P.
-
Onderonderzoeker:
- Xristin Maestri, N.P.
-
-
Deelname Criteria
Geschiktheidscriteria
Leeftijden die in aanmerking komen voor studie
Accepteert gezonde vrijwilligers
Geslachten die in aanmerking komen voor studie
Bemonsteringsmethode
Studie Bevolking
Beschrijving
Inclusiecriteria:
- Gedocumenteerde geïnformeerde toestemming
- Patiënt heeft een vermoedelijke of bevestigde solide tumor of hematologische maligniteit
- Er is voldoende weefsel of lichaamsvloeistof om experimenteel onderzoek mogelijk te maken
- De patiënt is ouder dan 18 jaar
Uitsluitingscriteria:
- De patiënt wil of kan geen geïnformeerde toestemming geven
Studie plan
Hoe is de studie opgezet?
Ontwerpdetails
- Observatiemodellen: Case-Alleen
- Tijdsperspectieven: Prospectief
Cohorten en interventies
Groep / Cohort |
Interventie / Behandeling |
|---|---|
|
Pts met solide tumoren / hematologische kanker
Patiënten in dit onderzoek moeten een vermoedelijke of bevestigde solide tumor of hematologische kanker hebben.
De interventie die in deze studie wordt uitgevoerd, is de moleculaire analyse van kanker.
De monsters worden genomen op het moment van de geplande diagnostische of stadiëringsprocedure van de patiënt.
Als de patiënt is ingepland voor een operatie, zal een weefselmonster worden verkregen dat niet nodig is voor de diagnose en zal worden gebruikt voor dit onderzoek.
Als de patiënt een eerdere diagnostische procedure heeft ondergaan, wordt een deel van het opgeslagen weefsel van die procedure ook aangeboden voor moleculaire analyse.
|
De interventie die in deze studie wordt uitgevoerd, is de moleculaire analyse van kanker.
Monsters die op genetische veranderingen moeten worden getest, worden verzameld tijdens een routinematige diagnostische procedure, zoals een operatie of een tumorbiopsie.
Monsters die zijn opgeslagen van eerdere diagnostische procedures zullen ook worden geanalyseerd.
Deze tests worden uitgevoerd door de afdeling Pathologie van het Rhode Island Hospital of een extern laboratorium dat is aangewezen door het Rhode Island Hospital.
De mate van moleculair testen zal in elk individueel geval anders zijn.
In sommige gevallen zal de studie van genetische veranderingen bijvoorbeeld beginnen met volledige genoom- of exome-sequencing en zal worden bevestigd door gerichte Sanger-resequencing, single-nucleotide polymorfisme en transcriptoomanalyse.
In andere gevallen zal gerichte multigene panel-sequencing of gerichte amplicon Sanger-sequencing de eerste en enige stap zijn.
|
Wat meet het onderzoek?
Primaire uitkomstmaten
Uitkomstmaat |
Tijdsspanne |
|---|---|
|
De frequentie van "bruikbare" oncogene mutaties
Tijdsspanne: 1 jaar
|
1 jaar
|
|
De prevalentie van genomische, transcriptomische en proteomische afwijkingen bij menselijke kanker
Tijdsspanne: 1 jaar
|
1 jaar
|
Medewerkers en onderzoekers
Sponsor
Onderzoekers
- Hoofdonderzoeker: Kimberly Perez, M.D., Lifespan Corporation
Studie record data
Bestudeer belangrijke data
Studie start
Primaire voltooiing (Verwacht)
Studie voltooiing (Verwacht)
Studieregistratiedata
Eerst ingediend
Eerst ingediend dat voldeed aan de QC-criteria
Eerst geplaatst (Schatting)
Updates van studierecords
Laatste update geplaatst (Schatting)
Laatste update ingediend die voldeed aan QC-criteria
Laatst geverifieerd
Meer informatie
Termen gerelateerd aan deze studie
Trefwoorden
Aanvullende relevante MeSH-voorwaarden
Andere studie-ID-nummers
- 2055-13
Deze informatie is zonder wijzigingen rechtstreeks van de website clinicaltrials.gov gehaald. Als u verzoeken heeft om uw onderzoeksgegevens te wijzigen, te verwijderen of bij te werken, neem dan contact op met register@clinicaltrials.gov. Zodra er een wijziging wordt doorgevoerd op clinicaltrials.gov, wordt deze ook automatisch bijgewerkt op onze website .