Test moléculaire du cancer par analyse génomique, transcriptomique et protéomique intégrée
TEST MOLÉCULAIRE DU CANCER PAR ANALYSE GÉNOMIQUE, TRANSCRIPTOMIQUE ET PROTÉOMIQUE INTÉGRÉE
Le but de cette étude est de découvrir les changements génétiques associés à différents cancers. Avec les informations de cette étude, les chercheurs espèrent fournir de meilleurs moyens de prévenir, détecter et traiter de nombreux cancers.
De nombreuses maladies peuvent résulter de modifications du matériel génétique d'une personne qui empêchent les cellules de fonctionner correctement. Actuellement, les chercheurs et les médecins connaissent certains des changements génétiques qui peuvent causer des maladies, mais ils ne connaissent pas tous les changements génétiques qui peuvent causer des maladies.
Ce projet est conçu pour identifier les changements génétiques qui peuvent causer le cancer chez les humains. Les échantillons seront prélevés à partir d'un diagnostic programmé ou d'une routine (c.-à-d. prise de sang pour numération) et peut inclure des échantillons du tissu lui-même (chirurgie), de la moelle osseuse, du sang, de la salive, de l'urine, du liquide céphalo-rachidien, des expectorations, du liquide articulaire, du liquide séminal, de l'ascite (un liquide qui se remplit dans l'abdomen), et/ou du liquide pleural (liquide dans la cavité pulmonaire), soit pour confirmer le diagnostic de cancer, soit pour aider à décider de la meilleure façon de traiter le cancer ou une autre maladie. De plus, des tissus archivés peuvent être analysés. Les échantillons peuvent être stockés pour une utilisation future dans des expériences ultérieures. Le département de pathologie du Rhode Island Hospital conservera les échantillons.
Les informations du dossier médical, telles que les réponses aux traitements ou les antécédents familiaux de cancer, seront collectées.
Aperçu de l'étude
Statut
Les conditions
Intervention / Traitement
Description détaillée
Les mutations complexes, progressives, multigéniques et somatiques du génome sont désormais largement acceptées comme le principal moteur de l'évolution de l'initiation, de la croissance, des métastases et de la pharmacorésistance du cancer. Différents types de tumeurs sont associés à des mutations dans des ensembles distincts de gènes, et il existe un besoin pressant d'une méthode basée sur le séquençage pour analyser des panels de gènes candidats qui diffèrent pour chaque type de tumeur.
Les approches traditionnelles d'analyse de séquence utilisant le séquençage Sanger basé sur l'électrophorèse capillaire sont largement utilisées pour guider le traitement des patients atteints de cancer du poumon et colorectal et pour le mélanome, les sarcomes, les leucémies et les lymphomes. Cette technologie est limitée en termes de débit, d'évolutivité, de vitesse et de résolution. La technologie émergente telle que le séquençage de nouvelle génération (NGS) - présente un certain nombre d'avantages par rapport aux méthodes traditionnelles, notamment la capacité de séquencer entièrement un grand nombre de gènes en un seul test et de détecter simultanément les délétions, les insertions, les modifications du nombre de copies, les translocations et substitutions de bases à l'échelle de l'exome dans tous les gènes connus liés au cancer.
Le séquençage du génome entier est financièrement prohibitif pour de nombreuses applications potentiellement intéressantes. Une alternative aux méthodes du génome entier est l'enrichissement ciblé, tel que le séquençage de l'exome, qui capture et séquence uniquement les régions codant pour les protéines. L'exome représente 1 à 2 % du génome humain ; contient cependant la grande majorité des maladies causant des altérations. En plus du séquençage de l'exome, le séquençage du transcriptome de pleine longueur (ARNm) offre une alternative rapide et peu coûteuse. Il s'agit d'une méthode plus simple pour identifier les séquences codantes et capturer les variantes dans les gènes qui sont exprimés, ainsi que pour générer des informations supplémentaires, telles que le niveau d'expression des gènes et les modèles d'épissage.
Le but de cette étude est d'étudier les altérations génomiques, transcriptomiques et protéomiques dans les cancers solides humains et les hémopathies malignes.
Patients >18 ans diagnostiqué avec un cancer (y compris toute tumeur solide ou hémopathie maligne) ou les patients qui subissent une procédure pour le diagnostic d'un cancer présumé sont éligibles.
L'analyse de la recherche sera effectuée par le département de pathologie ou la division d'hématologie oncologie. Le tissu corporel/sang analysé proviendra de tissus/sang supplémentaires qui ne sont pas nécessaires au diagnostic ou à l'évaluation du cancer du patient. Tous les échantillons seront anonymisés. Les échantillons seront conservés pendant une durée indéterminée ou jusqu'à ce que tous les échantillons soient utilisés.
Type d'étude
Inscription (Anticipé)
Contacts et emplacements
Lieux d'étude
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Rhode Island
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East Greenwich, Rhode Island, États-Unis, 02818
- Recrutement
- Rhode Island Comprehensive Cancer Center at East Greenwich
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Contact:
- Allison Jean, B.A.
- Numéro de téléphone: (401) 444- 8856
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Contact:
- Andrew Schumacher, M.S.
- Numéro de téléphone: 401-444-3234
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Sous-enquêteur:
- Priscilla Merriam, M.D.
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Sous-enquêteur:
- Howard Safran, M.D.
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Sous-enquêteur:
- Maria Constantinou, M.D.
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Sous-enquêteur:
- Anthony Mega, M.D.
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Chercheur principal:
- Kimberly Perez, M.D.
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Sous-enquêteur:
- Amy Pilotte, N. P.
-
Providence, Rhode Island, États-Unis, 02903
- Recrutement
- Rhode Island Hospital
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Contact:
- Allison Jean, B.A.
- Numéro de téléphone: (401) 444- 8856
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Contact:
- Andrew Schumacher, M.S.
- Numéro de téléphone: 401-444-3234
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Sous-enquêteur:
- Howard Safran, M.D.
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Sous-enquêteur:
- Maria Constantinou, M.D.
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Chercheur principal:
- Kimberly Perez, M.D.
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Sous-enquêteur:
- Humera Khurshid, M.D.
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Sous-enquêteur:
- Evgeny Yakirevich, M.D.
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Sous-enquêteur:
- Murray Resnick, M.D.
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Sous-enquêteur:
- James Butera, M.D.
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Sous-enquêteur:
- Mary Anne Fenton, M.D.
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Sous-enquêteur:
- Lucia Fontes-Bortes, N.P.
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Sous-enquêteur:
- Peter Quesenberry, M.D.
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Sous-enquêteur:
- Matthew Quesenberry, M.D.
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Sous-enquêteur:
- John Reagan, M.D.
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Sous-enquêteur:
- Eric Winer, M.D.
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Sous-enquêteur:
- Thomas DiPetrillo, M.D.
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Sous-enquêteur:
- Jaroslaw Hepel, M.D.
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Sous-enquêteur:
- Kara Lynne Leonard, M.D.
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Chercheur principal:
- David Tracey, P.A.
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Sous-enquêteur:
- Inna Yakirevich, N.P.
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Sous-enquêteur:
- Sharon Benson, N.P.
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Sous-enquêteur:
- Heinrich Elinzano, M.D.
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Sous-enquêteur:
- Timothy Kinsella, M.D.
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Sous-enquêteur:
- Thomas Ng, M.D.
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Providence, Rhode Island, États-Unis, 02906
- Recrutement
- The Miriam Hospital
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Sous-enquêteur:
- Priscilla Merriam, M.D.
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Sous-enquêteur:
- Howard Safran, M.D.
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Sous-enquêteur:
- Anthony Mega, M.D.
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Chercheur principal:
- Kimberly Perez, M.D.
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Sous-enquêteur:
- John Reagan, M.D.
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Sous-enquêteur:
- Eric Winer, M.D.
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Contact:
- Maureen Jean, R.N.
- Numéro de téléphone: 401-793-4283
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Contact:
- Diane Martel, R.N.
- Numéro de téléphone: (401) 793- 4282
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Sous-enquêteur:
- Jennifer Collins, N.P.
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Sous-enquêteur:
- Irene Kolberg, N.P.
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Sous-enquêteur:
- Fred Schiffman, M.D.
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Sous-enquêteur:
- Edward Wittles, M.D.
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Sous-enquêteur:
- Angela Taber, M.D.
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Sous-enquêteur:
- Camille Higel-McGovern, N.P.
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Sous-enquêteur:
- Amy Pilotte, N.P.
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Sous-enquêteur:
- Xristin Maestri, N.P.
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Critères de participation
Critère d'éligibilité
Âges éligibles pour étudier
Accepte les volontaires sains
Sexes éligibles pour l'étude
Méthode d'échantillonnage
Population étudiée
La description
Critère d'intégration:
- Consentement éclairé documenté
- Le patient a une tumeur solide suspectée ou confirmée ou une hémopathie maligne
- Il y a suffisamment de tissu ou de liquide corporel pour permettre une étude expérimentale
- Le patient a plus de 18 ans
Critère d'exclusion:
- Le patient ne veut pas ou ne peut pas donner son consentement éclairé
Plan d'étude
Comment l'étude est-elle conçue ?
Détails de conception
- Modèles d'observation: Cas uniquement
- Perspectives temporelles: Éventuel
Cohortes et interventions
Groupe / Cohorte |
Intervention / Traitement |
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Patients atteints de tumeurs solides/cancer hématologique
Les patients participant à cette étude doivent avoir soit une tumeur solide suspectée ou confirmée, soit un cancer hématologique.
L'intervention réalisée dans cette étude est l'analyse moléculaire du cancer.
Les échantillons seront prélevés au moment de la procédure de diagnostic ou de stadification prévue pour le patient.
Si le patient doit subir une intervention chirurgicale, un échantillon de tissu non requis pour son diagnostic sera obtenu et utilisé pour cette étude de recherche.
Si le patient a déjà subi une procédure de diagnostic, une partie du tissu stocké de cette procédure sera également soumise à une analyse moléculaire.
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L'intervention réalisée dans cette étude est l'analyse moléculaire du cancer.
Les échantillons à tester pour les altérations génétiques seront collectés au cours d'une procédure de diagnostic de routine telle qu'une chirurgie ou une biopsie tumorale.
Les échantillons qui ont été stockés à partir de procédures de diagnostic précédentes seront également analysés.
Ces tests seront effectués par le Département de pathologie du Rhode Island Hospital ou par un laboratoire extérieur désigné par le Rhode Island Hospital.
L'étendue des tests moléculaires sera différente dans chaque cas individuel.
Par exemple, dans certains cas, l'étude des altérations génétiques commencera par le séquençage du génome entier ou de l'exome et sera confirmée par le reséquençage Sanger ciblé, le polymorphisme d'un seul nucléotide et l'analyse du transcriptome.
Dans d'autres cas, le séquençage de panel multigène ciblé ou le séquençage Sanger d'amplicon ciblé sera la première et unique étape.
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Que mesure l'étude ?
Principaux critères de jugement
Mesure des résultats |
Délai |
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La fréquence des mutations oncogéniques "actionnables"
Délai: 1 an
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1 an
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La prévalence des anomalies génomiques, transcriptomiques et protéomiques dans le cancer humain
Délai: 1 an
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1 an
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Collaborateurs et enquêteurs
Parrainer
Les enquêteurs
- Chercheur principal: Kimberly Perez, M.D., Lifespan Corporation
Dates d'enregistrement des études
Dates principales de l'étude
Début de l'étude
Achèvement primaire (Anticipé)
Achèvement de l'étude (Anticipé)
Dates d'inscription aux études
Première soumission
Première soumission répondant aux critères de contrôle qualité
Première publication (Estimation)
Mises à jour des dossiers d'étude
Dernière mise à jour publiée (Estimation)
Dernière mise à jour soumise répondant aux critères de contrôle qualité
Dernière vérification
Plus d'information
Termes liés à cette étude
Mots clés
Termes MeSH pertinents supplémentaires
Autres numéros d'identification d'étude
- 2055-13
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