Test molecolare del cancro mediante analisi genomica, trascrittomica e proteomica integrata
TEST MOLECOLARI DEL CANCRO MEDIANTE ANALISI GENOMICA, TRASCRITTOMICA E PROTEOMICA INTEGRATA
Lo scopo di questo studio è scoprire i cambiamenti genetici associati a diversi tipi di cancro. Con le informazioni di questo studio i ricercatori sperano di fornire modi migliori per prevenire, rilevare e curare molti tumori.
Molte malattie possono derivare da cambiamenti nel materiale genetico di una persona che causano il malfunzionamento delle cellule. Attualmente, ricercatori e medici conoscono alcuni dei cambiamenti genetici che possono causare malattie, ma non conoscono tutti i cambiamenti genetici che possono causare malattie.
Questo progetto è progettato per identificare i cambiamenti genetici che possono causare il cancro negli esseri umani. I campioni verranno raccolti da una diagnostica programmata o di routine (ad es. prelievo di sangue per i conteggi) e può includere campioni del tessuto stesso (chirurgia), midollo osseo, sangue, saliva, urina, liquido spinale, espettorato, liquido articolare, liquido seminale, ascite (un liquido che si riempie nell'addome), e/o liquido pleurico (liquido nella cavità polmonare), per confermare la diagnosi di cancro o per aiutare a decidere il modo migliore per trattare il cancro o altre malattie. È inoltre possibile analizzare il tessuto archiviato. I campioni possono essere conservati per un uso futuro in esperimenti successivi. Il Dipartimento di Patologia del Rhode Island Hospital conserverà i campioni.
Verranno raccolte informazioni dalla cartella clinica, come le risposte ai trattamenti o la storia familiare di cancro.
Panoramica dello studio
Stato
Condizioni
Intervento / Trattamento
Descrizione dettagliata
Le mutazioni complesse, progressive, multigeniche e somatiche del genoma sono ora ampiamente accettate come la principale forza trainante nell'evoluzione dell'inizio, della crescita, della metastasi e della farmacoresistenza del cancro. Diversi tipi di tumori sono associati a mutazioni in gruppi distinti di geni e vi è un urgente bisogno di un metodo basato sul sequenziamento per analizzare pannelli di geni candidati che differiscono per ciascun tipo di tumore.
Gli approcci tradizionali all'analisi delle sequenze che impiegano il sequenziamento di Sanger basato sull'elettroforesi capillare sono ampiamente utilizzati per guidare la terapia per i pazienti con cancro del polmone e del colon-retto e per melanomi, sarcomi, leucemie e linfomi. Questa tecnologia è limitata in termini di throughput, scalabilità, velocità e risoluzione. La tecnologia emergente come il sequenziamento di nuova generazione (NGS) offre numerosi vantaggi rispetto ai metodi tradizionali, inclusa la capacità di sequenziare completamente un gran numero di geni in un singolo test e rilevare simultaneamente delezioni, inserzioni, alterazioni del numero di copie, traslocazioni e sostituzioni di basi a livello di esoma in tutti i geni noti correlati al cancro.
Il sequenziamento dell'intero genoma è finanziariamente proibitivo per molte applicazioni potenzialmente preziose. Un'alternativa ai metodi dell'intero genoma è l'arricchimento del bersaglio, come il sequenziamento dell'esoma, che cattura e sequenzia solo le regioni codificanti proteine. L'esoma rappresenta l'1-2% del genoma umano; tuttavia contiene la stragrande maggioranza delle malattie che causano alterazioni. Oltre al sequenziamento dell'esoma, il sequenziamento del trascrittoma a lunghezza intera (mRNA) offre un'alternativa rapida ed economica. È un metodo più semplice per identificare le sequenze codificanti e catturare le varianti nei geni espressi, nonché per generare informazioni aggiuntive, come il livello di espressione genica e i modelli di splicing.
L'obiettivo di questo studio è quello di indagare le alterazioni genomiche, trascrittomiche e proteomiche nei tumori solidi umani e nelle neoplasie ematologiche.
Pazienti >18 anni sono ammissibili i pazienti con diagnosi di cancro (incluso qualsiasi tumore solido o neoplasia ematologica) o pazienti sottoposti a procedura per la diagnosi di un presunto cancro.
L'analisi della ricerca sarà eseguita dal dipartimento di patologia o dalla divisione di ematologia oncologica. Il tessuto corporeo/sanguigno analizzato proverrà da tessuto/sangue extra non necessario per la diagnosi o la valutazione del cancro del paziente. Tutti i campioni saranno anonimi. I campioni verranno conservati per un periodo di tempo indefinito o fino a quando tutti i campioni non saranno utilizzati.
Tipo di studio
Iscrizione (Anticipato)
Contatti e Sedi
Luoghi di studio
-
-
Rhode Island
-
East Greenwich, Rhode Island, Stati Uniti, 02818
- Reclutamento
- Rhode Island Comprehensive Cancer Center at East Greenwich
-
Contatto:
- Allison Jean, B.A.
- Numero di telefono: (401) 444- 8856
-
Contatto:
- Andrew Schumacher, M.S.
- Numero di telefono: 401-444-3234
-
Sub-investigatore:
- Priscilla Merriam, M.D.
-
Sub-investigatore:
- Howard Safran, M.D.
-
Sub-investigatore:
- Maria Constantinou, M.D.
-
Sub-investigatore:
- Anthony Mega, M.D.
-
Investigatore principale:
- Kimberly Perez, M.D.
-
Sub-investigatore:
- Amy Pilotte, N. P.
-
Providence, Rhode Island, Stati Uniti, 02903
- Reclutamento
- Rhode Island Hospital
-
Contatto:
- Allison Jean, B.A.
- Numero di telefono: (401) 444- 8856
-
Contatto:
- Andrew Schumacher, M.S.
- Numero di telefono: 401-444-3234
-
Sub-investigatore:
- Howard Safran, M.D.
-
Sub-investigatore:
- Maria Constantinou, M.D.
-
Investigatore principale:
- Kimberly Perez, M.D.
-
Sub-investigatore:
- Humera Khurshid, M.D.
-
Sub-investigatore:
- Evgeny Yakirevich, M.D.
-
Sub-investigatore:
- Murray Resnick, M.D.
-
Sub-investigatore:
- James Butera, M.D.
-
Sub-investigatore:
- Mary Anne Fenton, M.D.
-
Sub-investigatore:
- Lucia Fontes-Bortes, N.P.
-
Sub-investigatore:
- Peter Quesenberry, M.D.
-
Sub-investigatore:
- Matthew Quesenberry, M.D.
-
Sub-investigatore:
- John Reagan, M.D.
-
Sub-investigatore:
- Eric Winer, M.D.
-
Sub-investigatore:
- Thomas DiPetrillo, M.D.
-
Sub-investigatore:
- Jaroslaw Hepel, M.D.
-
Sub-investigatore:
- Kara Lynne Leonard, M.D.
-
Investigatore principale:
- David Tracey, P.A.
-
Sub-investigatore:
- Inna Yakirevich, N.P.
-
Sub-investigatore:
- Sharon Benson, N.P.
-
Sub-investigatore:
- Heinrich Elinzano, M.D.
-
Sub-investigatore:
- Timothy Kinsella, M.D.
-
Sub-investigatore:
- Thomas Ng, M.D.
-
Providence, Rhode Island, Stati Uniti, 02906
- Reclutamento
- The Miriam Hospital
-
Sub-investigatore:
- Priscilla Merriam, M.D.
-
Sub-investigatore:
- Howard Safran, M.D.
-
Sub-investigatore:
- Anthony Mega, M.D.
-
Investigatore principale:
- Kimberly Perez, M.D.
-
Sub-investigatore:
- John Reagan, M.D.
-
Sub-investigatore:
- Eric Winer, M.D.
-
Contatto:
- Maureen Jean, R.N.
- Numero di telefono: 401-793-4283
-
Contatto:
- Diane Martel, R.N.
- Numero di telefono: (401) 793- 4282
-
Sub-investigatore:
- Jennifer Collins, N.P.
-
Sub-investigatore:
- Irene Kolberg, N.P.
-
Sub-investigatore:
- Fred Schiffman, M.D.
-
Sub-investigatore:
- Edward Wittles, M.D.
-
Sub-investigatore:
- Angela Taber, M.D.
-
Sub-investigatore:
- Camille Higel-McGovern, N.P.
-
Sub-investigatore:
- Amy Pilotte, N.P.
-
Sub-investigatore:
- Xristin Maestri, N.P.
-
-
Criteri di partecipazione
Criteri di ammissibilità
Età idonea allo studio
Accetta volontari sani
Sessi ammissibili allo studio
Metodo di campionamento
Popolazione di studio
Descrizione
Criterio di inclusione:
- Consenso informato documentato
- - Il paziente ha un tumore solido sospetto o confermato o una neoplasia ematologica
- C'è abbastanza tessuto o fluido corporeo per consentire uno studio sperimentale
- Il paziente ha più di 18 anni
Criteri di esclusione:
- Il paziente non vuole o non è in grado di fornire il consenso informato
Piano di studio
Come è strutturato lo studio?
Dettagli di progettazione
- Modelli osservazionali: Solo caso
- Prospettive temporali: Prospettiva
Coorti e interventi
Gruppo / Coorte |
Intervento / Trattamento |
|---|---|
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Pts con tumori solidi/tumore ematologico
I pazienti in questo studio devono avere un tumore solido sospetto o confermato o un cancro ematologico.
L'intervento eseguito in questo studio è l'analisi molecolare del cancro.
I campioni verranno prelevati al momento della procedura diagnostica o di stadiazione pianificata del paziente.
Se il paziente è programmato per un intervento chirurgico, verrà prelevato un campione di tessuto non necessario per la diagnosi e utilizzato per questo studio di ricerca.
Se il paziente è stato sottoposto a una precedente procedura diagnostica, anche parte del tessuto immagazzinato da tale procedura verrà sottoposto ad analisi molecolare.
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L'intervento eseguito in questo studio è l'analisi molecolare del cancro.
I campioni da testare per le alterazioni genetiche saranno raccolti nel corso di una procedura diagnostica di routine come un intervento chirurgico o una biopsia tumorale.
Saranno analizzati anche i campioni che sono stati conservati da precedenti procedure diagnostiche.
Questi test saranno eseguiti dal Dipartimento di Patologia del Rhode Island Hospital o da un laboratorio esterno designato dal Rhode Island Hospital.
L'estensione dei test molecolari sarà diversa in ogni singolo caso.
Ad esempio, in alcuni casi, lo studio delle alterazioni genetiche inizierà con il sequenziamento dell'intero genoma o dell'esoma e sarà confermato dal risequenziamento mirato di Sanger, dal polimorfismo a singolo nucleotide e dall'analisi del trascrittoma.
In altri casi il sequenziamento mirato del pannello multigenico o il sequenziamento mirato dell'amplicone Sanger sarà il primo e unico passaggio.
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Cosa sta misurando lo studio?
Misure di risultato primarie
Misura del risultato |
Lasso di tempo |
|---|---|
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La frequenza delle mutazioni oncogeniche "azionabili".
Lasso di tempo: 1 anno
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1 anno
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La prevalenza delle anomalie genomiche, trascrittomiche e proteomiche nel cancro umano
Lasso di tempo: 1 anno
|
1 anno
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Collaboratori e investigatori
Sponsor
Investigatori
- Investigatore principale: Kimberly Perez, M.D., Lifespan Corporation
Studiare le date dei record
Studia le date principali
Inizio studio
Completamento primario (Anticipato)
Completamento dello studio (Anticipato)
Date di iscrizione allo studio
Primo inviato
Primo inviato che soddisfa i criteri di controllo qualità
Primo Inserito (Stima)
Aggiornamenti dei record di studio
Ultimo aggiornamento pubblicato (Stima)
Ultimo aggiornamento inviato che soddisfa i criteri QC
Ultimo verificato
Maggiori informazioni
Termini relativi a questo studio
Parole chiave
Termini MeSH pertinenti aggiuntivi
Altri numeri di identificazione dello studio
- 2055-13
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