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Teste molecular de câncer por análise genômica, transcriptômica e proteômica integrada

26 de agosto de 2014 atualizado por: Rhode Island Hospital

TESTE MOLECULAR DE CÂNCER POR ANÁLISE GENÔMICA, TRANSCRITÔMICA E PROTEÔMICA INTEGRADA

O objetivo deste estudo é descobrir alterações genéticas associadas a diferentes tipos de câncer. Com as informações deste estudo, os pesquisadores esperam fornecer melhores maneiras de prevenir, detectar e tratar muitos tipos de câncer.

Muitas doenças podem resultar de alterações no material genético de uma pessoa que fazem com que as células não funcionem adequadamente. Atualmente, pesquisadores e médicos conhecem algumas das alterações genéticas que podem causar doenças, mas não conhecem todas as alterações genéticas que podem causar doenças.

Este projeto visa identificar alterações genéticas que podem causar câncer em humanos. As amostras serão coletadas de um diagnóstico ou rotina agendada (ou seja, coleta de sangue para contagem) procedimento e pode incluir amostras do próprio tecido (cirurgia), medula óssea, sangue, saliva, urina, fluido espinhal, escarro, fluido articular, fluido seminal, ascite (um fluido que se enche no abdômen), e/ou líquido pleural (líquido na cavidade pulmonar), seja para confirmar o diagnóstico de câncer ou para ajudar a decidir a melhor forma de tratar o câncer ou outra doença. Além disso, o tecido arquivado pode ser analisado. As amostras podem ser armazenadas para uso futuro em experimentos posteriores. O Departamento de Patologia do Rhode Island Hospital armazenará as amostras.

Serão coletadas informações do prontuário médico, como respostas a tratamentos ou histórico familiar de câncer.

Visão geral do estudo

Status

Desconhecido

Intervenção / Tratamento

Descrição detalhada

Mutações somáticas complexas, progressivas e multigênicas do genoma são agora amplamente aceitas como a principal força motriz na evolução da iniciação, crescimento, metástase e farmacorresistência do câncer. Diferentes tipos de tumores estão associados a mutações em conjuntos distintos de genes, e há uma necessidade premente de um método baseado em sequenciamento de análise de painéis de genes candidatos que diferem para cada tipo de tumor.

Abordagens tradicionais para análise de sequência empregando sequenciamento de Sanger baseado em eletroforese capilar são amplamente utilizadas para orientar a terapia para pacientes com câncer de pulmão e colorretal e para melanoma, sarcomas, leucemias e linfomas. Essa tecnologia é limitada em taxa de transferência, escalabilidade, velocidade e resolução. A tecnologia emergente, como o sequenciamento de próxima geração (NGS) - possui várias vantagens sobre os métodos tradicionais, incluindo a capacidade de sequenciar completamente um grande número de genes em um único teste e detectar simultaneamente deleções, inserções, alterações no número de cópias, translocações e substituições de base em todo o exoma em todos os genes relacionados ao câncer conhecidos.

Sequenciar todo o genoma é financeiramente proibitivo para muitas aplicações potencialmente valiosas. Uma alternativa aos métodos do genoma inteiro é o enriquecimento do alvo, como o sequenciamento do exoma, que captura e sequencia apenas regiões codificadoras de proteínas. O exoma representa 1-2% do genoma humano; no entanto, contém a grande maioria das alterações causadoras de doenças. Além do sequenciamento do exoma, o sequenciamento completo do transcriptoma (mRNA) oferece uma alternativa rápida e barata. É um método mais fácil de identificar sequências de codificação e capturar variantes em genes que são expressos, bem como gerar informações adicionais, como nível de expressão gênica e padrões de splicing.

O objetivo deste estudo é investigar alterações genômicas, transcriptômicas e proteômicas em cânceres sólidos e hematológicos humanos.

Pacientes >18 anos diagnosticados com câncer (incluindo qualquer tumor sólido ou malignidade hematológica) ou pacientes que estão passando por um procedimento para o diagnóstico de um câncer presumido são elegíveis.

A análise da pesquisa será realizada pelo departamento de patologia ou pela divisão de oncologia hematológica. O tecido corporal/sangue analisado será de tecido/sangue extra que não é necessário para o diagnóstico ou avaliação do câncer do paciente. Todas as amostras serão desidentificadas. As amostras serão armazenadas por tempo indeterminado ou até que todas as amostras sejam utilizadas.

Tipo de estudo

Observacional

Inscrição (Antecipado)

500

Contactos e Locais

Esta seção fornece os detalhes de contato para aqueles que conduzem o estudo e informações sobre onde este estudo está sendo realizado.

Locais de estudo

    • Rhode Island
      • East Greenwich, Rhode Island, Estados Unidos, 02818
        • Recrutamento
        • Rhode Island Comprehensive Cancer Center at East Greenwich
        • Contato:
          • Allison Jean, B.A.
          • Número de telefone: (401) 444- 8856
        • Contato:
          • Andrew Schumacher, M.S.
          • Número de telefone: 401-444-3234
        • Subinvestigador:
          • Priscilla Merriam, M.D.
        • Subinvestigador:
          • Howard Safran, M.D.
        • Subinvestigador:
          • Maria Constantinou, M.D.
        • Subinvestigador:
          • Anthony Mega, M.D.
        • Investigador principal:
          • Kimberly Perez, M.D.
        • Subinvestigador:
          • Amy Pilotte, N. P.
      • Providence, Rhode Island, Estados Unidos, 02903
        • Recrutamento
        • Rhode Island Hospital
        • Contato:
          • Allison Jean, B.A.
          • Número de telefone: (401) 444- 8856
        • Contato:
          • Andrew Schumacher, M.S.
          • Número de telefone: 401-444-3234
        • Subinvestigador:
          • Howard Safran, M.D.
        • Subinvestigador:
          • Maria Constantinou, M.D.
        • Investigador principal:
          • Kimberly Perez, M.D.
        • Subinvestigador:
          • Humera Khurshid, M.D.
        • Subinvestigador:
          • Evgeny Yakirevich, M.D.
        • Subinvestigador:
          • Murray Resnick, M.D.
        • Subinvestigador:
          • James Butera, M.D.
        • Subinvestigador:
          • Mary Anne Fenton, M.D.
        • Subinvestigador:
          • Lucia Fontes-Bortes, N.P.
        • Subinvestigador:
          • Peter Quesenberry, M.D.
        • Subinvestigador:
          • Matthew Quesenberry, M.D.
        • Subinvestigador:
          • John Reagan, M.D.
        • Subinvestigador:
          • Eric Winer, M.D.
        • Subinvestigador:
          • Thomas DiPetrillo, M.D.
        • Subinvestigador:
          • Jaroslaw Hepel, M.D.
        • Subinvestigador:
          • Kara Lynne Leonard, M.D.
        • Investigador principal:
          • David Tracey, P.A.
        • Subinvestigador:
          • Inna Yakirevich, N.P.
        • Subinvestigador:
          • Sharon Benson, N.P.
        • Subinvestigador:
          • Heinrich Elinzano, M.D.
        • Subinvestigador:
          • Timothy Kinsella, M.D.
        • Subinvestigador:
          • Thomas Ng, M.D.
      • Providence, Rhode Island, Estados Unidos, 02906
        • Recrutamento
        • The Miriam Hospital
        • Subinvestigador:
          • Priscilla Merriam, M.D.
        • Subinvestigador:
          • Howard Safran, M.D.
        • Subinvestigador:
          • Anthony Mega, M.D.
        • Investigador principal:
          • Kimberly Perez, M.D.
        • Subinvestigador:
          • John Reagan, M.D.
        • Subinvestigador:
          • Eric Winer, M.D.
        • Contato:
          • Maureen Jean, R.N.
          • Número de telefone: 401-793-4283
        • Contato:
          • Diane Martel, R.N.
          • Número de telefone: (401) 793- 4282
        • Subinvestigador:
          • Jennifer Collins, N.P.
        • Subinvestigador:
          • Irene Kolberg, N.P.
        • Subinvestigador:
          • Fred Schiffman, M.D.
        • Subinvestigador:
          • Edward Wittles, M.D.
        • Subinvestigador:
          • Angela Taber, M.D.
        • Subinvestigador:
          • Camille Higel-McGovern, N.P.
        • Subinvestigador:
          • Amy Pilotte, N.P.
        • Subinvestigador:
          • Xristin Maestri, N.P.

Critérios de participação

Os pesquisadores procuram pessoas que se encaixem em uma determinada descrição, chamada de critérios de elegibilidade. Alguns exemplos desses critérios são a condição geral de saúde de uma pessoa ou tratamentos anteriores.

Critérios de elegibilidade

Idades elegíveis para estudo

18 anos e mais velhos (Adulto, Adulto mais velho)

Aceita Voluntários Saudáveis

Não

Gêneros Elegíveis para o Estudo

Tudo

Método de amostragem

Amostra de Probabilidade

População do estudo

Os pacientes neste estudo terão um tumor sólido suspeito ou confirmado ou malignidade hematológica

Descrição

Critério de inclusão:

  • Consentimento informado documentado
  • O paciente tem um tumor sólido suspeito ou confirmado ou malignidade hematológica
  • Há tecido ou fluido corporal suficiente para permitir o estudo experimental
  • O paciente tem mais de 18 anos

Critério de exclusão:

  • O paciente não quer ou não pode fornecer consentimento informado

Plano de estudo

Esta seção fornece detalhes do plano de estudo, incluindo como o estudo é projetado e o que o estudo está medindo.

Como o estudo é projetado?

Detalhes do projeto

  • Modelos de observação: Caso-somente
  • Perspectivas de Tempo: Prospectivo

Coortes e Intervenções

Grupo / Coorte
Intervenção / Tratamento
Pacientes com Tumores Sólidos/Câncer Hematológico
Os pacientes neste estudo devem ter um tumor sólido suspeito ou confirmado ou câncer hematológico. A intervenção realizada neste estudo é a análise molecular do câncer. As amostras serão coletadas no momento do procedimento de diagnóstico ou estadiamento planejado do paciente. Se o paciente estiver agendado para cirurgia, uma amostra de tecido não necessária para o diagnóstico será obtida e usada para este estudo de pesquisa. Se o paciente já foi submetido a um procedimento diagnóstico anterior, parte do tecido armazenado desse procedimento também será submetido à análise molecular.
A intervenção realizada neste estudo é a análise molecular do câncer. As amostras a serem testadas para alterações genéticas serão coletadas durante um procedimento de diagnóstico de rotina, como uma cirurgia ou biópsia de tumor. As amostras que foram armazenadas em procedimentos de diagnóstico anteriores também serão analisadas. Este teste será realizado pelo Departamento de Patologia do Rhode Island Hospital ou por um laboratório externo designado pelo Rhode Island Hospital. A extensão do teste molecular será diferente em cada caso individual. Por exemplo, em alguns casos, o estudo de alterações genéticas começará com o sequenciamento completo do genoma ou exoma e será confirmado pelo ressequenciamento de Sanger direcionado, polimorfismo de nucleotídeo único e análise de transcriptoma. Em outros casos, o sequenciamento de painel multigênico direcionado ou o sequenciamento de Sanger de amplicon direcionado será o primeiro e único passo.

O que o estudo está medindo?

Medidas de resultados primários

Medida de resultado
Prazo
A frequência de mutações oncogênicas "acionáveis"
Prazo: 1 ano
1 ano
A prevalência de anormalidades genômicas, transcriptômicas e proteômicas no câncer humano
Prazo: 1 ano
1 ano

Colaboradores e Investigadores

É aqui que você encontrará pessoas e organizações envolvidas com este estudo.

Patrocinador

Investigadores

  • Investigador principal: Kimberly Perez, M.D., Lifespan Corporation

Datas de registro do estudo

Essas datas acompanham o progresso do registro do estudo e os envios de resumo dos resultados para ClinicalTrials.gov. Os registros do estudo e os resultados relatados são revisados ​​pela National Library of Medicine (NLM) para garantir que atendam aos padrões específicos de controle de qualidade antes de serem publicados no site público.

Datas Principais do Estudo

Início do estudo

1 de maio de 2013

Conclusão Primária (Antecipado)

1 de agosto de 2015

Conclusão do estudo (Antecipado)

1 de agosto de 2015

Datas de inscrição no estudo

Enviado pela primeira vez

31 de julho de 2014

Enviado pela primeira vez que atendeu aos critérios de CQ

7 de agosto de 2014

Primeira postagem (Estimativa)

12 de agosto de 2014

Atualizações de registro de estudo

Última Atualização Postada (Estimativa)

27 de agosto de 2014

Última atualização enviada que atendeu aos critérios de controle de qualidade

26 de agosto de 2014

Última verificação

1 de julho de 2014

Mais Informações

Termos relacionados a este estudo

Essas informações foram obtidas diretamente do site clinicaltrials.gov sem nenhuma alteração. Se você tiver alguma solicitação para alterar, remover ou atualizar os detalhes do seu estudo, entre em contato com register@clinicaltrials.gov. Assim que uma alteração for implementada em clinicaltrials.gov, ela também será atualizada automaticamente em nosso site .

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