Denne side blev automatisk oversat, og nøjagtigheden af ​​oversættelsen er ikke garanteret. Der henvises til engelsk version for en kildetekst.

Molekylær test af kræft ved integreret genomisk, transkriptomisk og proteomisk analyse

26. august 2014 opdateret af: Rhode Island Hospital

MOLEKYLÆR PRØVNING AF KRÆFT VED INTEGRERET GENOMISK, TRANSKRIPTOMISK OG PROTEOMISK ANALYSE

Formålet med denne undersøgelse er at opdage genetiske ændringer forbundet med forskellige kræftformer. Med oplysningerne fra denne undersøgelse håber efterforskerne at give bedre måder at forebygge, opdage og behandle mange kræftformer på.

Mange sygdomme kan skyldes ændringer i en persons genetiske materiale, der får celler til ikke at fungere korrekt. I øjeblikket kender forskere og læger nogle af de genetiske ændringer, der kan forårsage sygdom, men de kender ikke alle de genetiske ændringer, der kan forårsage sygdom.

Dette projekt er designet til at identificere genetiske ændringer, der kan forårsage kræft hos mennesker. Prøver vil blive indsamlet fra en planlagt diagnosticering eller rutine (dvs. blodprøvetagning for tælling) procedure og kan omfatte prøver fra selve vævet (kirurgi), knoglemarv, blod, spyt, urin, spinalvæske, opspyt, ledvæske, sædvæske, ascites (en væske, der fyldes op i maven), og/eller pleuravæske (væske i lungehulen), for enten at bekræfte diagnosen kræft eller for at hjælpe med at beslutte, hvordan man bedst behandler kræft eller anden sygdom. Derudover kan arkiveret væv analyseres. Prøver kan opbevares til fremtidig brug i senere eksperimenter. Afdelingen for patologi på Rhode Island Hospital vil opbevare prøverne.

Oplysninger fra journalen, såsom svar på behandlinger eller familiehistorie med kræft, vil blive indsamlet.

Studieoversigt

Status

Ukendt

Intervention / Behandling

Detaljeret beskrivelse

Komplekse, progressive, multigene, somatiske mutationer af genomet er nu bredt accepteret som den primære drivkraft i udviklingen af ​​kræftinitiering, vækst, metastase og farmakorresistens. Forskellige typer af tumorer er forbundet med mutationer i forskellige sæt af gener, og der er et presserende behov for en sekventeringsbaseret metode til at analysere paneler af kandidatgener, der er forskellige for hver tumortype.

Traditionelle tilgange til sekvensanalyse, der anvender kapillærelektroforese-baseret Sanger-sekventering, er meget brugt til at vejlede terapi for patienter med lunge- og kolorektal cancer og for melanom, sarkomer, leukæmier og lymfomer. Denne teknologi er begrænset i gennemløb, skalerbarhed, hastighed og opløsning. Den nye teknologi, såsom næste generations sekventering (NGS) - har en række fordele i forhold til traditionelle metoder, herunder evnen til fuldt ud at sekventere et stort antal gener i en enkelt test og samtidig detektere deletioner, indsættelser, kopinummerændringer, translokationer og eksomomfattende basesubstitutioner i alle kendte cancerrelaterede gener.

Sekventering af hele genomet er økonomisk uoverkommeligt for mange potentielt værdifulde applikationer. Et alternativ til helgenommetoder er målberigelse, såsom exome-sekventering, som kun indfanger og sekvenserer proteinkodende regioner. Exomet repræsenterer 1-2% af det humane genom; indeholder dog langt størstedelen af ​​sygdomsfremkaldende ændringer. Ud over exom-sekventering tilbyder fuldlængde transkriptom (mRNA)-sekventering et hurtigt og billigt alternativ. Det er en lettere metode til at identificere kodende sekvenser og fange varianter i gener, der udtrykkes, samt at generere yderligere information, såsom genekspressionsniveau og splejsningsmønstre.

Målet med denne undersøgelse er at undersøge genomiske, transkriptomiske og proteomiske ændringer i humane solide kræftformer og hæmatologiske maligniteter.

Patienter >18 år. diagnosticeret med kræft (herunder enhver solid tumor eller hæmatologisk malignitet) eller patienter, der gennemgår en procedure til diagnosticering af en formodet kræftsygdom, er berettiget.

Forskningsanalysen vil blive udført af patologisk afdeling eller afdelingen for hæmatologisk onkologi. Det analyserede legeme/blodvæv vil være fra ekstra væv/blod, som ikke er nødvendigt til diagnosticering eller evaluering af patientens cancer. Alle prøver vil blive afidentificeret. Prøver vil blive opbevaret i en ubestemt periode, eller indtil alle prøver er udnyttet.

Undersøgelsestype

Observationel

Tilmelding (Forventet)

500

Kontakter og lokationer

Dette afsnit indeholder kontaktoplysninger for dem, der udfører undersøgelsen, og oplysninger om, hvor denne undersøgelse udføres.

Studiesteder

    • Rhode Island
      • East Greenwich, Rhode Island, Forenede Stater, 02818
        • Rekruttering
        • Rhode Island Comprehensive Cancer Center at East Greenwich
        • Kontakt:
          • Allison Jean, B.A.
          • Telefonnummer: (401) 444- 8856
        • Kontakt:
          • Andrew Schumacher, M.S.
          • Telefonnummer: 401-444-3234
        • Underforsker:
          • Priscilla Merriam, M.D.
        • Underforsker:
          • Howard Safran, M.D.
        • Underforsker:
          • Maria Constantinou, M.D.
        • Underforsker:
          • Anthony Mega, M.D.
        • Ledende efterforsker:
          • Kimberly Perez, M.D.
        • Underforsker:
          • Amy Pilotte, N. P.
      • Providence, Rhode Island, Forenede Stater, 02903
        • Rekruttering
        • Rhode Island Hospital
        • Kontakt:
          • Allison Jean, B.A.
          • Telefonnummer: (401) 444- 8856
        • Kontakt:
          • Andrew Schumacher, M.S.
          • Telefonnummer: 401-444-3234
        • Underforsker:
          • Howard Safran, M.D.
        • Underforsker:
          • Maria Constantinou, M.D.
        • Ledende efterforsker:
          • Kimberly Perez, M.D.
        • Underforsker:
          • Humera Khurshid, M.D.
        • Underforsker:
          • Evgeny Yakirevich, M.D.
        • Underforsker:
          • Murray Resnick, M.D.
        • Underforsker:
          • James Butera, M.D.
        • Underforsker:
          • Mary Anne Fenton, M.D.
        • Underforsker:
          • Lucia Fontes-Bortes, N.P.
        • Underforsker:
          • Peter Quesenberry, M.D.
        • Underforsker:
          • Matthew Quesenberry, M.D.
        • Underforsker:
          • John Reagan, M.D.
        • Underforsker:
          • Eric Winer, M.D.
        • Underforsker:
          • Thomas DiPetrillo, M.D.
        • Underforsker:
          • Jaroslaw Hepel, M.D.
        • Underforsker:
          • Kara Lynne Leonard, M.D.
        • Ledende efterforsker:
          • David Tracey, P.A.
        • Underforsker:
          • Inna Yakirevich, N.P.
        • Underforsker:
          • Sharon Benson, N.P.
        • Underforsker:
          • Heinrich Elinzano, M.D.
        • Underforsker:
          • Timothy Kinsella, M.D.
        • Underforsker:
          • Thomas Ng, M.D.
      • Providence, Rhode Island, Forenede Stater, 02906
        • Rekruttering
        • The Miriam Hospital
        • Underforsker:
          • Priscilla Merriam, M.D.
        • Underforsker:
          • Howard Safran, M.D.
        • Underforsker:
          • Anthony Mega, M.D.
        • Ledende efterforsker:
          • Kimberly Perez, M.D.
        • Underforsker:
          • John Reagan, M.D.
        • Underforsker:
          • Eric Winer, M.D.
        • Kontakt:
          • Maureen Jean, R.N.
          • Telefonnummer: 401-793-4283
        • Kontakt:
          • Diane Martel, R.N.
          • Telefonnummer: (401) 793- 4282
        • Underforsker:
          • Jennifer Collins, N.P.
        • Underforsker:
          • Irene Kolberg, N.P.
        • Underforsker:
          • Fred Schiffman, M.D.
        • Underforsker:
          • Edward Wittles, M.D.
        • Underforsker:
          • Angela Taber, M.D.
        • Underforsker:
          • Camille Higel-McGovern, N.P.
        • Underforsker:
          • Amy Pilotte, N.P.
        • Underforsker:
          • Xristin Maestri, N.P.

Deltagelseskriterier

Forskere leder efter personer, der passer til en bestemt beskrivelse, kaldet berettigelseskriterier. Nogle eksempler på disse kriterier er en persons generelle helbredstilstand eller tidligere behandlinger.

Berettigelseskriterier

Aldre berettiget til at studere

18 år og ældre (Voksen, Ældre voksen)

Tager imod sunde frivillige

Ingen

Køn, der er berettiget til at studere

Alle

Prøveudtagningsmetode

Sandsynlighedsprøve

Studiebefolkning

Patienter i denne undersøgelse vil enten have en formodet eller bekræftet solid tumor eller hæmatologisk malignitet

Beskrivelse

Inklusionskriterier:

  • Dokumenteret informeret samtykke
  • Patienten har enten en mistænkt eller bekræftet solid tumor eller hæmatologisk malignitet
  • Der er nok væv eller kropsvæske til at muliggøre eksperimentel undersøgelse
  • Patienten er over 18 år

Ekskluderingskriterier:

  • Patienten er uvillig eller ude af stand til at give informeret samtykke

Studieplan

Dette afsnit indeholder detaljer om studieplanen, herunder hvordan undersøgelsen er designet, og hvad undersøgelsen måler.

Hvordan er undersøgelsen tilrettelagt?

Design detaljer

  • Observationsmodeller: Kun etui
  • Tidsperspektiver: Fremadrettet

Kohorter og interventioner

Gruppe / kohorte
Intervention / Behandling
Pts med solide tumorer/hæmatologisk cancer
Patienter i denne undersøgelse skal have enten en formodet eller bekræftet solid tumor eller hæmatologisk cancer. Interventionen udført i denne undersøgelse er den molekylære analyse af cancer. Prøverne vil blive taget på tidspunktet for patientens planlagte diagnostiske eller stadieinddelingsprocedure. Hvis patienten er planlagt til operation, vil en prøve af væv, der ikke er nødvendig for deres diagnose, blive opnået og brugt til denne forskningsundersøgelse. Hvis patienten har gennemgået en tidligere diagnostisk procedure, vil noget af det lagrede væv fra denne procedure også blive sendt til molekylær analyse.
Interventionen udført i denne undersøgelse er den molekylære analyse af cancer. Prøver, der skal testes for genetiske ændringer, vil blive indsamlet i løbet af en rutinemæssig diagnostisk procedure, såsom en operation eller tumorbiopsi. Prøver, der er blevet opbevaret fra tidligere diagnostiske procedurer, vil også blive analyseret. Denne test vil blive udført af afdelingen for patologi på Rhode Island Hospital eller et eksternt laboratorium udpeget af Rhode Island Hospital. Omfanget af molekylær testning vil være forskelligt i hvert enkelt tilfælde. For eksempel vil undersøgelse af genetiske ændringer i nogle tilfælde starte med helgenom- eller exom-sekventering og vil blive bekræftet ved målrettet Sanger-resequencing, enkeltnukleotidpolymorfi og transkriptomanalyse. I andre tilfælde vil målrettet multigen panel-sekventering eller målrettet amplicon Sanger-sekventering være det indledende og eneste trin.

Hvad måler undersøgelsen?

Primære resultatmål

Resultatmål
Tidsramme
Hyppigheden af ​​"handlingsbare" onkogene mutationer
Tidsramme: 1 år
1 år
Forekomsten af ​​genomiske, transkriptomiske og proteomiske abnormiteter i menneskelig kræft
Tidsramme: 1 år
1 år

Samarbejdspartnere og efterforskere

Det er her, du vil finde personer og organisationer, der er involveret i denne undersøgelse.

Efterforskere

  • Ledende efterforsker: Kimberly Perez, M.D., Lifespan Corporation

Datoer for undersøgelser

Disse datoer sporer fremskridtene for indsendelser af undersøgelsesrekord og resumeresultater til ClinicalTrials.gov. Studieregistreringer og rapporterede resultater gennemgås af National Library of Medicine (NLM) for at sikre, at de opfylder specifikke kvalitetskontrolstandarder, før de offentliggøres på den offentlige hjemmeside.

Studer store datoer

Studiestart

1. maj 2013

Primær færdiggørelse (Forventet)

1. august 2015

Studieafslutning (Forventet)

1. august 2015

Datoer for studieregistrering

Først indsendt

31. juli 2014

Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier

7. august 2014

Først opslået (Skøn)

12. august 2014

Opdateringer af undersøgelsesjournaler

Sidste opdatering sendt (Skøn)

27. august 2014

Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier

26. august 2014

Sidst verificeret

1. juli 2014

Mere information

Begreber relateret til denne undersøgelse

Disse oplysninger blev hentet direkte fra webstedet clinicaltrials.gov uden ændringer. Hvis du har nogen anmodninger om at ændre, fjerne eller opdatere dine undersøgelsesoplysninger, bedes du kontakte register@clinicaltrials.gov. Så snart en ændring er implementeret på clinicaltrials.gov, vil denne også blive opdateret automatisk på vores hjemmeside .

Kliniske forsøg med Faste tumorer

Kliniske forsøg med Molekylær analyse af kræft

Abonner