臨床検体中の皮膚糸状菌の迅速な同定のためのオリゴヌクレオチドアレイの評価

爪真菌症が疑われる患者の爪標本を分析した。

コレクション：

サンプルは、台湾の台南にある国立成功大学病院 (NCKUH、三次紹介病院) の皮膚科から標準的な患者ケアの一環として収集されました。

爪のサンプルは、爪下の削り取り、切り抜き、またはキュレットとして収集されました。 サンプルは、ＫＯＨ染色および通常の真菌培養のために、室温の無菌エッペンドルフチューブに入れて、ＮＣＫＵＨの皮膚科の研究室に直ちに移送された。

サンプルの準備:

各サンプルを手術用の刃で小片に切断し、2 ml ガラス ホモジナイザーでホモジナイズしました。 懸濁液を 37°C で 30 分間リチカーゼで処理し、Blood & Tissue ゲノム DNA キットで DNA を抽出しました。PCR プログラムとアレイ ハイブリダイゼーションは以前の研究と同じです。

分析：

アレイ法と培養法の結果が異なる場合、再シーケンシングによる不一致分析、KOH の増加、および抗真菌治療後の患者の転帰。 感度、特異性、陽性 (PPV) および陰性適中率 (NPV) を使用したアレイおよび培養方法の性能評価は、不一致分析後に計算されました。 有意差は、フィッシャーの正確確率検定によって推定されました。